不同性别湖羊早期定植肠道菌群分析

【目的】分析不同性别湖羊早期定植肠道菌群情况,为深入研究其与机体健康状况之间的关系提供数据支持。【方法】采集48份(母羊31份和公羊17份)45日龄湖羊的粪便,提取基因组DNA,进行高通量测序,筛选有效序列和分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs),分析不同性别湖羊肠道微生物多样性,并通过多级物种差异判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)、非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling analysis,NMDS)、短期注意/记忆优先(short-term attention/memory priority,STAMP)模型确定菌群在门水平和属水平上的具体差异。【结果】经高通量测序,母羊获得2014个OTUs,公羊获得1747个OTUs,二者共有1637个OTUs。不同性别湖羊早期定植肠道菌群共注释到15个门、25个纲,62个目、118个科和317个属。不同性别湖羊早期定植肠道菌群在门水平和属水平均存在显著差异;在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidota)为优势菌门,其中,母羊相对丰度最高的是厚壁菌门(49.68%),公羊相对丰度最高的是拟杆菌门(47.34%),母羊肠道内迷踪菌门(Elusimicrobiota)比例显著高于公羊;在属水平上,具有性别差异的属共有15个,且大部分集中在厚壁菌门,其中,公羊肠道内琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)、丁酸弧菌属(Anaerostipes)比例显著高于母羊,而单球菌属(Monoglobus)、优杆菌属(Eubacterium_nodatum)、迷踪菌属(Elusimicrobium)比例显著低于母羊。【结论】湖羊母羊早期定植肠道菌群的多样性和丰富度均高于公羊,在门和属水平上存在性别差异。