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2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析
1
作者
郭占达
杜季梅
+2 位作者
郭子仪
王新港
张彦华
《河南农业科学》
北大核心
2022年第3期146-153,共8页
为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南的401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测。结果显示,共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%。对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行...
为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南的401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测。结果显示,共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%。对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行测序、同源性比对和遗传进化分析。同源性比对结果显示,18株PRRSV流行毒株ORF5基因核苷酸序列同源性在83.4%以上,与参考毒株同源性为82.9%~99.7%。遗传进化分析结果显示,18株PRRSV流行毒株序列均为美洲株,分属于1、5、8三个谱系,其中2株属于以JXAl为代表的谱系8,1株属于以VR2332为代表的谱系5,15株属于以NADC30为代表的谱系1。氨基酸比对结果显示,HN-TH1-2020、HY-PY1-2020、HN-XY1-2020毒株的13位以及HN-XC1-2020毒株的151位氨基酸毒力相关位点发生了不同程度的突变。
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关键词
河南省
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分子流行病学
ORF5基因
变异
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职称材料
题名
2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析
1
作者
郭占达
杜季梅
郭子仪
王新港
张彦华
机构
河南
省大河农畜牧科技有限公司
河南农业大学
动物
医
学院
商丘美兰生物工程有限公司
河南农业大学
动物
科学
院
出处
《河南农业科学》
北大核心
2022年第3期146-153,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31772781)。
文摘
为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南的401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测。结果显示,共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%。对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行测序、同源性比对和遗传进化分析。同源性比对结果显示,18株PRRSV流行毒株ORF5基因核苷酸序列同源性在83.4%以上,与参考毒株同源性为82.9%~99.7%。遗传进化分析结果显示,18株PRRSV流行毒株序列均为美洲株,分属于1、5、8三个谱系,其中2株属于以JXAl为代表的谱系8,1株属于以VR2332为代表的谱系5,15株属于以NADC30为代表的谱系1。氨基酸比对结果显示,HN-TH1-2020、HY-PY1-2020、HN-XY1-2020毒株的13位以及HN-XC1-2020毒株的151位氨基酸毒力相关位点发生了不同程度的突变。
关键词
河南省
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分子流行病学
ORF5基因
变异
Keywords
Henan Province
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus
Epidemiology
ORF5 gene
Variation
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析
郭占达
杜季梅
郭子仪
王新港
张彦华
《河南农业科学》
北大核心
2022
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