棉花根总蛋白双向电泳方法的优化

以陆地棉（Gossypium hirsutumL.）根为材料,比较分析了三种总蛋白提取方法及电泳参数和上样量等因素对双向电泳结果的影响.结果表明：选择pH 4～7IPG胶条,采用丙酮沉淀/2-D Clean-up Kit法提取总蛋白,电泳时设置合适的电压,上样量为250μg蛋白进行双向电泳能够检测到1 000多个清晰的蛋白点,适合做质谱分析.

拟南芥AtrbohD和AtrbohF缺失对叶蛋白质组的影响

拟南芥NADPH氧化酶AtrbohD和AtrbohF在脱落酸(abscisic acid,ABA)抑制主根伸长、ABA诱导气孔关闭以及植物应答干旱、盐及病菌侵染等逆境胁迫反应中发挥重要作用,但这2个蛋白亚基缺失对拟南芥(Arabidopsis thaliana)蛋白质组的影响还未见报道。我们以营养土中生长16 d的野生型及AtrbohD和AtrbohF双基因突变体atrbohD1/F1叶片为材料进行蛋白组学分析,在双向电泳图谱上可分辨出约1 000个蛋白点,且蛋白表达谱存在差异。选取42个显著差异蛋白点进行MALDI-TOF/TOF质谱鉴定,成功鉴定出20个差异蛋白,这些蛋白主要与氧化还原、能量代谢、蛋白代谢、转录和信号传导等相关,还有一些蛋白功能未知。