MLPA联合遗传连锁分析在假肥大型肌营养不良症产前诊断中的价值

目的探讨多重连接依赖探针扩增技术（multiplexligation-dependentprobeamplification，MLPA）联合短串联重复序列（shorttandemrepeat，STR）基因连锁分析用于Duchenne型假肥大型肌营养不良症（Duchennemusculardystrophy，DMD）产前诊断的价值。方法通过检测Y染色体性别决定基因（Ychromosomesex-determininggene，SRy）判断胎儿性别；MLPA检测45个DMD家系中先证者、孕妇以及胎儿Dystrophin基因突变情况，并对家系成员和胎儿进行第45、49、50内含子以及5’和3’端STR的连锁分析。结果45个进行产前诊断的家系中，SRY阳性31例，其中6例为DMD患病胎儿；阴性14例，其中4例为携带者，余未见异常。结论MLPA能检测胎儿Dystrophin基因外显子突变情况，STR连锁能分析胎儿是否继承母源性风险X染色体，因此，STR连锁分析能发现MLPA技术检测不到的外显子突变胎儿。将两种方法结合起来用于DMD的产前诊断准确性更高。

一例表现为主动脉瓣狭窄的非典型Williams-Beuren综合征患儿的遗传学诊断及分析

目的对1例主动脉瓣狭窄的患儿进行遗传学诊断,分析其发病机制。方法采用常规G显带染色体分析、微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)及多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技术分析患儿及其父母的染色体核型和基因组拷贝数变异。结果患儿及其父母的外周血染色体核型均未见异常。aCGH检测显示患儿7q11.23区存在278 kb杂合缺失,与Williams-Beuren综合征(Williams-Beuren syndrome,WBS)关键区部分重叠,涉及WBS的关键致病基因之一ELN。MLPA检测证实患儿存在上述缺失,患儿父母未发现染色体微重复/微缺失。结论患儿7q11.23区杂合缺失为新发突变。ELN基因单倍剂量不足可能是其发生主动脉瓣狭窄的原因,诊断为非典型WBS。

一个ADAR基因变异导致遗传性对称性色素异常症家系的分析

目的对1个遗传性对称性色素异常症家系的临床特征和ADAR基因变异进行分析,明确其可能的遗传病因。方法对先证者的ADAR基因外显子及外显子与内含子的交界区域进行PCR扩增并测序,针对检出的可疑致病变异在该家系中进行验证。结果测序结果显示先证者ADAR基因(NM_001111)存在c.1352delA(p.Asn451Metfs*13)缺失移码杂合变异;经验证,其症状相似的母亲、妹妹的ADAR基因均存在c.1352delA缺失移码杂合变异,家系中未受累的父亲及舅舅该位点为野生型。同时对100名正常人DNA进行ADAR基因c.1352delA变异筛查均未发现相同变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,ADAR基因c.1352delA(p.Asn451Metfs*13)变异判定为致病性变异(PVS1+PM2+PP1+PP3)。结论ADAR基因c.1352delA(p.Asn451Metfs*13)缺失移码变异可能是该家系罹患遗传性对称性色素异常症的遗传病因。

一例罕见的UBE3A基因部分缺失导致的重现性Angleman综合征

目的 为1对临床诊断为“智力低下、癫痫”的同胞兄弟提供遗传学诊断,探讨其发病机制.方法 用微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)技术对2例患儿及其父母、外祖父母进行检测;采用甲基化特异性的多重连接探针扩增(methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification,MS-MLPA)对其家系进行分析,进一步明确患者的缺失区域.结果 aCGH检测发现患儿15q11.2区存在138 kb的缺失,涉及部分UBE3A基因.MS-MLPA检测证实患儿UBE3A基因第8~13外显子存在杂合性缺失.患儿母亲及外祖父携带相同的缺失,患儿父亲、外祖母及其他家族成员则未发现缺失.数据库检索提示该缺失为UBE3A罕见的突变形式,部分检测方法对其存在漏检的可能性.结论 患儿所患的Angleman综合征的发病机制为母源性UBE3A基因的部分缺失,非常罕见.

人类微小RNA-409-3p靶基因预测及生物信息学分析

目的采用生物信息学技术预测人类微小RNA-409-3p(hsa-miR-409-3p)靶基因,并分析其可能参与的生物学过程及信号通路。方法应用miRbase数据库和UCSC Genome Browser分析工具获取hsa-miR-409-3p的染色体定位、碱基序列和物种保守性等基本信息,利用miRanda、miRDB、Target Scan和miRwalk进行靶基因预测,采用miRwalk网站对靶基因取交集,合并有文献支持和经实验证实的靶基因作为基因集,对基因集进行功能富集分析(GO分析)和信号通路分析。结果hsa-miR-409-3p序列在各物种间高度保守。对miRanda、miRDB、Target Scan和miRwalk预测的靶基因进行交集后共得到273个靶基因。miRwalk中检索到经验证的靶基因有133个。合并后进行GO分析,结果显示靶基因富集于细胞粘附、细胞基质粘附、生长调节、调节干细胞群维持、学习或记忆、突触传递的负调节等(P<0.05)。信号通路分析结果显示靶基因富集于PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路、AMPK信号通路、神经营养蛋白信号通路、B细胞受体信号通路、安非他明成瘾等(P<0.05)。结论 hsa-miR-409-3p参与神经系统功能及其调节的生物学过程,与神经系统疾病的发生密切相关。