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花生重要农艺及产量性状的全基因组关联分析
被引量:
2
1
作者
严玫
张新友
+6 位作者
韩锁义
黄冰艳
董文召
刘华
孙子淇
张忠信
汤丰收
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期460-472,共13页
通过关联分析法发掘与花生(Arachis hypogaea)产量性状显著关联、同时又在花生基因组上随机分布的SSR位点及优异等位变异,可了解产量相关基因区域的分布特点,有助于利用分子标记辅助选择方法选育高产花生新品种。选用64个SSR标记,采用ML...
通过关联分析法发掘与花生(Arachis hypogaea)产量性状显著关联、同时又在花生基因组上随机分布的SSR位点及优异等位变异,可了解产量相关基因区域的分布特点,有助于利用分子标记辅助选择方法选育高产花生新品种。选用64个SSR标记,采用MLM(Q+K)方法对166份花生资源进行全基因组关联分析。结果表明,通过聚类分析和结构划分,供试群体受其综合性状遗传特点和来源地域的影响可被划分成7个亚群,聚类结果与群体结构基本一致,同时群体特点与材料来源地的生态划分符合同类聚集的规律。通过对6个产量相关性状的3年数值的关联分析,分别发掘出SSR位点有20个、33个和26个,2年以上重复检出的SSR位点有13个(P<0.05),各SSR位点的表型变异解释率范围为0.011–0.348 1,平均为0.067 3;共检出590个等位变异,平均每个标记位点12.29个,表型变异解释率值最高的是与单株果数呈显著关联的位点TC1A02(P<0.001),含21个等位变异;与产量构成主要因子紧密关联的位点中,百果重的TC1A02-C470(+41.588 5)、TC1A02-C560(+40.926 1)和p PGPseq2E6-B473(+63.953 4),单株果数的TC1A02-C500(+7.374 4),单株饱果数的GM1843-E157(+4.316 6),可用于产量性状的分子辅助育种。
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关键词
花生
产量性状
SSR
全基因组关联分析
原文传递
题名
花生重要农艺及产量性状的全基因组关联分析
被引量:
2
1
作者
严玫
张新友
韩锁义
黄冰艳
董文召
刘华
孙子淇
张忠信
汤丰收
机构
河南省农业科学院经济作物研究所/花生遗传改良国家地方联合工程实验室/农业部黄淮海油料作物重点实验室/河南省油料作物遗传改良重点实验室
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期460-472,共13页
基金
国家重点基础研究发展计划(No.2011CB109304)
国家花生产业技术体系建设项目(No.CARS-14)
文摘
通过关联分析法发掘与花生(Arachis hypogaea)产量性状显著关联、同时又在花生基因组上随机分布的SSR位点及优异等位变异,可了解产量相关基因区域的分布特点,有助于利用分子标记辅助选择方法选育高产花生新品种。选用64个SSR标记,采用MLM(Q+K)方法对166份花生资源进行全基因组关联分析。结果表明,通过聚类分析和结构划分,供试群体受其综合性状遗传特点和来源地域的影响可被划分成7个亚群,聚类结果与群体结构基本一致,同时群体特点与材料来源地的生态划分符合同类聚集的规律。通过对6个产量相关性状的3年数值的关联分析,分别发掘出SSR位点有20个、33个和26个,2年以上重复检出的SSR位点有13个(P<0.05),各SSR位点的表型变异解释率范围为0.011–0.348 1,平均为0.067 3;共检出590个等位变异,平均每个标记位点12.29个,表型变异解释率值最高的是与单株果数呈显著关联的位点TC1A02(P<0.001),含21个等位变异;与产量构成主要因子紧密关联的位点中,百果重的TC1A02-C470(+41.588 5)、TC1A02-C560(+40.926 1)和p PGPseq2E6-B473(+63.953 4),单株果数的TC1A02-C500(+7.374 4),单株饱果数的GM1843-E157(+4.316 6),可用于产量性状的分子辅助育种。
关键词
花生
产量性状
SSR
全基因组关联分析
Keywords
peanut (Arachis hypogaea), yield trait, SSR, genome-wide association study
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生重要农艺及产量性状的全基因组关联分析
严玫
张新友
韩锁义
黄冰艳
董文召
刘华
孙子淇
张忠信
汤丰收
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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