基于cyt b基因分析河南省4大水系红鳍原鲌种群的遗传多样性

选用长江、黄河、淮河、海河4大水系的红鳍原鲌Cultrichthys erythropterus样本共100尾,基于cyt b基因分析其种群的遗传多样性、遗传结构及种群历史动态等。结果显示:河南省4大水系红鳍原鲌种群整体单倍型多态性为0.909,整体核苷酸多样性为0.004 88,具有较高的遗传多样性;4个水系均有特有单倍型,这表明红鳍原鲌种群的遗传分化数值较大,遗传分化程度较高;通过构建和分析系统发育树、贝叶斯系统发生树和单倍型网络图,发现河南省4大水系红鳍原鲌种群间谱系分化不明显,且无明显的地理结构;AMOVA分析显示,种群内的变异占72.11%,组间的变异占4.63%,表明变异主要发生在种群内;Tajima’s D和Fu’s F_S分析结果表明,河南省红鳍原鲌种群近期未发生过种群扩张事件。本文研究和分析了河南省境内红鳍原鲌种群遗传多样性和遗传结构,为河南省红鳍原鲌种质资源的保护和合理开发利用提供了参考。

基于线粒体COⅠ基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究

为系统评估河南省锯齿新米虾Neocaridina denticulata的遗传多样性现状,本研究基于线粒体COⅠ基因对河南省境内19个群体149尾样本进行了遗传多样性分析。结果显示,河南省境内锯齿新米虾群体包含35个单倍型,平均单倍型多样性(H_(d))为0.922,平均核苷酸多样性(π)为0.00632;长江水系群体有最高的遗传多样性(H_(d)=0.924,π=0.00637),淮河水系群体最低(H_(d)=0.773,π=0.00228),各水系均显示出单倍型多样性高、核苷酸多样性低的特点。AMOVA分析显示,锯齿新米虾群体遗传变异仅26.19%,源自不同水系之间,各水系内不同群体间及群体内个体间的变异各占35.71%和38.10%。基于COⅠ基因的最大似然树显示,不同水系群体互相嵌套在一起,但单倍型网络图显示海河水系与其他水系存在一定程度的分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际线分析表明,锯齿新米虾群体近期没有发生种群扩张,群体相对稳定。本研究完善了河南省境内淡水虾类的物种名录,为后续境内淡水虾类的相关研究提供参考。

脊尾白虾全人工繁育技术初步研究

脊尾白虾是我国沿海地区池塘养殖重要品种,但目前尚未实现全人工繁育,严重制约了产业进一步发展。选取野生脊尾白虾作为亲虾,经过越冬培育、促熟交尾、幼体孵化培育、仔虾选育等手段,进行了脊尾白虾全人工繁育技术研究。试验结果显示,在盐度31.3、水温18.1~26.2℃、pH 8.1条件下,室内越冬脊尾白虾亲虾可成功培养至性腺成熟,并交尾抱卵,平均抱卵率达70%,平均孵化率为61.02%。幼体最佳培育密度20尾/L,仔虾适宜养殖密度0.13~0.53尾/L,培育至2cm时存活率可达80%,继续培育3个月后发育至性成熟。一年可繁殖2~3代。在此基础上建立了脊尾白虾近交家系,现已培育至第6代,各家系繁殖力、生长速度和存活率均未出现近交衰退现象。本研究初步解决了脊尾白虾室内全人工繁育技术,并为试验动物培育奠定了良好的技术基础。

水生动物标志物评价镉污染的研究进展

镉是广泛存在于自然环境中的一类化学元素,其化合物易溶于水,采矿业和含镉工业周边水体往往镉含量较高,对周围环境造成了极大危害。环境中高含量的镉,可对生物机体造成严重影响,导致多种器官出现肿瘤,损伤DNA,影响DNA修复及促进细胞增生,导致机体出现畸变、癌变、突变。

基于多来源数据分析河南省刺鱼目新纪录种--中华多刺鱼

2015年10月,河南省鱼类资源调查队在河南省林州市进行鱼类资源普查时,采集到30尾刺鱼目Gasterosteiformes鱼类,综合采用形态学和分子系统学的方法确定其为中华多刺鱼Pungitius sinensis,为河南省新纪录种,标本保存于河南师范大学水产学院鱼类标本室。本文对该鱼的主要鉴定特征、分布区域、可能的来源、生存环境等做了初步分析。该鱼在我国北方(辽宁、黑龙江、吉林、天津、河北等省市)及韩国、日本北方均有分布,记录最南分布区域为北京市,为北京市二级保护鱼类。此次报道进一步扩大了该鱼最南端分布界限,为进一步开展该鱼的基础研究提供了重要参考资料。

河南省大吻鱥属鱼类分类现状厘定

河南省鱼类资源调查队在河南省鱼类资源普查时,采集到两种大吻鱥属鱼类,采用传统形态学结合分子系统学方法确定其为尖头大吻鱥和拉氏大吻鱥.由于拉氏大吻鱥和尖头大吻鱥形态上相似度较高,结合我们采集的两个物种现有数据分析发现,以往鉴别特征并不能完全区分这两个物种,因而本文对尖头大吻鱥和拉氏大吻鱥的主要形态鉴定特征、分布区域、生存环境及生活习性等方面做了进一步分析厘定,对分布于河南省的大吻鱥属鱼类做了系统比较总结,修正了现有该属鱼类的主要鉴别特征及在我省的分布情况,标本保存于河南师范大学水产学院鱼类标本室.

河南省鳙养殖群体的遗传多样性与选择压力分析

为了解人工养殖和选育活动对鳙(Hypophthalmichthys nobilis)遗传多样性的影响,利用线粒体COI基因对河南省鳙养殖群体的遗传多样性进行研究。165个样品共检测出14个单倍型,平均单倍型多样性为0.862 37,平均核苷酸多样性为0.002 23。AMOVA分析显示,大多数遗传变异存在于鳙群体内(97.65%),群体间的遗传变异为4.60%。系统发育树结果表明,养殖鳙群体交叉在一起,没有形成明显的地理格局分布。选择压力分析推测鳙养殖群体主要受到纯化选择作用,说明当前的人工选择对鳙线粒体基因的影响有限。河南省鳙养殖群体的遗传多样性差异较大,可能与其地理距离、异地引种有关。

基于形态学和分子系统学数据分析河南省鱼类新纪录种—北鳅

2016年4月至2017年10月,河南省鱼类资源调查队在河南省鱼类资源普查时,分别在林州、辉县、汝州等地采集到14尾鲤形目条鳅亚科鱼类,综合采用传统形态学结合分子系统学方法确定其为北鳅Lefuacostata,为河南省新纪录种,标本保存于河南师范大学水产学院鱼类标本室.对该鱼的主要形态鉴定特征、分布区域、生存环境及生活习性等方面做了初步分析.该鱼在我国内蒙古、辽河、黑龙江水系、河北、山东济南等地均有相关记录.此次河南省境内采集到北鳅,扩大了该鱼在我国分布范围,也为后续基础研究提供了重要依据.

黄河鲤nanog基因克隆及其表达特征研究

转录因子Nanog在干细胞多能性维持、胚胎早期发育等方面具有重要作用.利用PCR技术克隆黄河鲤nanog基因(Ccnanog),通过实时荧光定量PCR或半定量PCR分别对其在黄河鲤不同胚胎发育时期以及雌、雄成体不同组织中的表达特征进行了分析,并利用荧光原位杂交和免疫组织化学方法进一步检测了该基因在黄河鲤卵巢和精巢中的亚细胞定位.结果显示,黄河鲤nanog基因ORF为1158 bp,编码385个氨基酸残基;Nanog蛋白包含保守的HOX结构域,与斑马鱼的序列相似性最高.在胚胎中,Ccnanog在未受精卵、早期胚胎的Ⅰ细胞期至原肠胚期高表达,在神经胚期表达量显著降低,之后在眼囊期至出膜期基本检测不出;在组织中,Ccnanog短片段在以性腺为首的多个组织中均有不同程度的表达,Ccnanog长片段仅在雌鱼卵巢和皮肤中表达,其中在雌鱼卵巢中的表达量最高,其组织表达具有一定的性别二态性;在性腺中进一步检测到,Ccnanog主要分布在卵巢的卵原细胞、Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期初级卵母细胞的细胞质中,以及精巢的精原细胞、精母细胞和精子细胞中,且随着生殖细胞的发育其表达量逐渐下降.以上结果表明Ccnanog可能参与了黄河鲤早期胚胎发育过程与生殖细胞的发育,为后续功能研究提供了参考.

游泳运动对鱼肉品质影响的研究进展

近年来,水产品总产量逐年增加,消费者对鱼肉品质的关注度也不断上升,如何提高养殖鱼类的品质将成为水产养殖业未来的主要方向。本文综述了游泳训练对鱼类生长性能、肌肉组织学、营养品质及挥发性化合物的影响,以期能进一步探索其潜在机制,优化提升鱼肉品质方法。

SOST基因在淇河鲫肌间骨骨化过程中的表达研究

为探索硬化蛋白(sclerostin,SOST)基因在淇河鲫肌间骨骨化过程中的调控作用,本研究以淇河鲫仔稚鱼为研究对象,利用整体骨骼染色法对肌间骨的形态发生进行观察,并采用q RT-PCR、Western Blot和免疫组织化学技术检测SOST基因在肌间骨不同骨化阶段的m RNA和蛋白表达变化情况。结果显示,淇河鲫发育至24 dpf(day post fertilization),肌膈中出现纤维束;25 dpf髓弓小骨出现,28 dpf脉弓小骨出现,33 dpf髓弓小骨出现分叉,45 dpf肌间小骨发育完全。SOST基因在肌间骨骨化发生各阶段均有表达,23 dpf的表达量最低(P<0.05),随着肌间小骨的骨化发育,SOST基因呈递增趋势,45 dpf表达量显著高于其他骨化阶段(P<0.05);SOST蛋白在45 dpf时显著高于23和27 dpf(P<0.05),与其他发育阶段无显著差异(P>0.05)。SOST m RNA和蛋白变化趋势基本相同,都在23dpf处于最低,肌间骨全部出现后表达量达到最高,与淇河鲫肌间骨的形态发生趋势一致。因此,推测SOST与淇河鲫肌间骨骨化具有一定的相关性,可调控肌间骨的分化和形成。

鱼类miRNAs研究新进展

MicroRNAs（miRNAs）是一类内生性的、进化上高度保守的单链成熟非编码RNA,长度约21~25个核苷酸,广泛存在植物、动物及微生物中~[1-2],参与生物体的胚胎形成、个体生长发育、机体免疫、疾病防御以及繁殖和糖脂类代谢等生命过程~[3-8]。目前,基于生物信息学预测,miRNAs约占整个基因组的2%~3%~[9]。

Slc24a5在不同毛色绵羊皮肤中的表达和定位研究

为研究阳离子交换体(solute carrier family 24member 5,Slc24a5)在不同毛色绵羊皮肤中的表达情况,探究其与毛色形成之间的关系采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析黑色和白色绵羊皮肤中Slc24a5的相对表达量,并运用Western blot和免疫组织化学方法对不同体色绵羊皮肤中Slc24a5蛋白的表达和定位情况进行分析.结果显示:Slc24a5基因在黑色绵羊皮肤组织中的相对表达量是白色绵羊皮肤组织的20.53倍(P<0.01);Western blot印迹结果证实绵羊皮肤组织总蛋白中存在分子量约为51kD的蛋白质条带,且黑色绵羊皮肤平均蛋白表达量显著高于白色绵羊(P<0.01).免疫组织化学结果显示,Slc24a5在绵羊皮肤毛囊外根鞘和毛基质处均呈阳性表达,且根据光密度值分析显示,Slc24a5在黑色绵羊中的平均蛋白质表达量显著高于白色绵羊.以上研究结果显示Slc24a5可能与绵羊毛色形成具有一定的相关性.

MicroRNAs在皮肤生物学中的研究进展

microRNAs(miRNAs)是内源性转录后非编码小RNA分子,定向作用于靶基因,在细胞分化、组织发育等多个过程中发挥作用.皮肤是人类和动物身体最大的器官系统,miRNAs在动物皮肤形态发生和维持正常的生理生态功能等方面发挥重要作用.主要从miRNAs在皮肤形态发生、皮肤癌、皮肤伤口创伤愈合、色素形成等方面入手,对近期研究进展进行简要阐述和总结,为miRNAs在皮肤生物学研究上提供帮助.

鱼类肠道菌群影响因子研究进展

肠道菌群在维持肠道健康、促进肠道发育、抵抗病原入侵、调节机体能量吸收和脂质代谢过程中均发挥重要作用。在鱼类学研究中,由于种类繁多、食性差异大、生存环境复杂多变,导致鱼类肠道菌群方面的研究面临巨大挑战。本文在总结常见鱼类肠道微生物组成的基础上,着重介绍了鱼类饵料组成、水环境因子、物种、基因型、发育阶段、养殖模式及投喂策略对鱼类肠道菌群影响的相关研究进展,并对目前研究中存在的问题进行了剖析,以期为鱼类肠道菌群研究提供一定的参考依据。

鱼类线粒体基因组研究进展

线粒体基因组(mitochondrial genome DNA,mtDNA)具有严格的母系遗传且能进行自我复制,并且在世代传递过程中不易发生重组、进化速率较快等优点.因此mtDNA广泛应用于系统进化、种群遗传、适应性进化等领域中.本文对鱼类mtDNA研究做了详细阐述,系统总结了近年来鱼类mtDNA结构与特征、线粒体的起源与演化、种群遗传、适应性进化、鱼类条形码物种识别等研究进展,以期对相关研究有一定参考价值.

鱼类黏液细胞研究进展

鱼体的黏液腺分布于其表皮层,黏液细胞分泌黏液保护机体免受伤害,是鱼体抵御病原微生物入侵的第一道防线。目前对于褐牙鲆(Paralichthys olivaceus)[1]、鲇鱼(Silurus asotus)[2]、花鲈(Lateolabrax maculatus)[3]、剑尾鱼(Xiphophorus maculatus)[4]、大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)[5]、黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)[6]、点带石斑鱼(Epinephelus malabaricus)[7]、鲤鱼(Cyrinus carpio)[8]等鱼类黏液细胞已有相关的研究报道。笔者总结了鱼类黏液细胞的研究进展,以期为更深入研究其结构和功能奠定基础,对鱼类养殖以及疾病预防产生重要的实践意义。

河南境内四水系宽鳍鱲野生群体的遗传多样性

为准确掌握河南野生宽鳍鱲(Zacco platypus)群体遗传结构,本研究利用线粒体CO I基因检测了海河、黄河、淮河和长江水系宽鳍鱲群体的遗传多样性和种群分化情况。110个样品共检测出40个单倍型,平均单倍型多样性为0.92077,平均核苷酸多样性为0.02439。AMOVA分析显示,大多数遗传变异存在于宽鳍鱲群体间(60.59%),群体内的遗传变异为37.67%。系统发育树结果表明,长江水系宽鳍鱲群体遗传分化较大,一部分群体单独聚为一支,另外一部分群体与海河、黄河、淮河水系宽鳍鱲聚在一起,没有显示出明显的南北分化格局。种群历史动态结果推测宽鳍鱲群体经历过瓶颈效应,且该过程可能与第四纪中更新世气候波动有关。建议对河南境内的宽鳍鱲种群,特别是遗传多样性低的种群(海河水系)进行保护。

淮河源区群体遗传多样性研究

鲌亚科鱼类在我国分布广泛,但有关其种群遗传多样性的研究报道相对较少。本研究以淮河源区广布种为研究对象,采用核基因RAG2和线粒体基因Cytb,探讨种群遗传结构和遗传多样性。遗传多样性分析结果显示,RAG2和Cytb的平均单倍型多样性与核苷酸多样性分别为0.940±0.011、0.00246±0.00057和0.915±0.011、0.00461±0.00060。分析认为河南省淮河源区群体呈现出高的单倍型多样性和低的核苷酸多样性,结合星型分布的单倍型网络图,Tajima′s D、Fu′s Fs中性检测和核苷酸错配分析,淮河源区群体在晚更新世可能经历过种群快速扩张。结合AMOVA与MIGRATE-N群体基因流分析进一步证实,由于近期群体扩张和频繁的基因交流,导致群体间未形成明显的遗传结构和谱系格局。较低的群体遗传多样性预示该区域应加强对种质资源的保护。

基于转录组测序技术筛选花■卵巢发育相关基因

为筛选影响花[鱼骨]卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花[鱼骨]脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示,3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads,组装后共获得了99 878个unigenes,平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 305个,脑vs.肝脏组中特异性表达的基因数为839个,卵巢vs.肝脏组中特异性表达的基因数为1 474个,3个比较组共有的差异表达基因数为860个。GO分析发现,上述差异表达基因主要集中在初级代谢过程(primary metabolic process)、单细胞过程(single-organism process)、有机物代谢过程(organic substance metabolic process)等生物学过程中。KEGG pathway分析显示,一些与卵巢发育和减数分裂相关的信号通路得到了显著富集,如GnRH信号通路、类固醇激素合成、TGF-β信号通路、卵母细胞减数分裂等代谢通路。本研究结果丰富了花[鱼骨]的基因资源,可为花[鱼骨]的繁殖生物学研究提供基础数据。