肺结核相关生物标志物的筛选与功能分析

目的筛选肺结核相关的生物标志物并进行功能模式分析。方法从基因表达数据库(GEO)中下载GSE83456数据集,运用GEO_(2)R在线工具筛选肺结核患者与健康对照之间的差异表达基因(DEGs),然后采用DAVID网站对差异基因进行基因本体(GO)富集分析和通路富集分析,并基于STRING数据库构建蛋白互作网络。结果与健康对照组相比,共筛选出266个DGEs,包括上调基因231个,下调基因35个。GO富集分析发现差异基因主要参与RNA结合、细胞因子活性、白细胞介素1受体结合、干扰素信号、免疫反应、细胞凋亡、炎症反应等生物过程。通路富集分析表明胞质DNA传感通路、补体与凝血级联反应、核苷酸结合寡聚化结构域(NOD)样受体通路、细胞因子-细胞因子受体互作、肿瘤坏死因子信号通路等通路显著富集。蛋白互作网络筛选出的核心标志物包括信号转导子和转录激活子1、环鸟苷酸-腺苷合成酶、干扰素刺激基因15和F盒蛋白6。结论本研究筛选出了肺结核相关的候选基因和信号通路,扩展了对其病因和分子机制的理解,这些关键的基因和通路可以作为生物标志物和药物治疗的靶标。