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题名果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析
被引量:6
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作者
刘洪超
胡澍
涂心明
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机构
河南科技大学医学院生物医学实验教学中心/神经遗传实验室
河南科技大学医学院人体解剖与组织胚胎学教研室
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出处
《重庆医学》
CAS
北大核心
2015年第17期2311-2314,共4页
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基金
国家自然科学基金面上项目(31171256)
自然科学基金河南科技大学配套经费(09001504)
河南科技大学博士启动基金(13530057)
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文摘
目的利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能。方法基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析。结果Tap蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜区和信号肽,在细胞核中发挥生物学效应,具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域。Tap蛋白与来源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致,Tap蛋白与人类和啮齿动物的编码产物高度同源,在系统发生树中距离最近。结论果蝇Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型结构,可能在果蝇胚胎发育早期的神经发生、分化等过程中发挥作用。
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关键词
Tap蛋白
螺旋-环-螺旋构型
分子结构
计算生物学
果蝇
黑腹
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Keywords
Tap protein
basic helix-loop-helix motifs
molecular structure
computational biology
drosophila melanogaster
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分类号
R384.2
[医药卫生—医学寄生虫学]
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题名tap基因靶向表达导致果蝇神经系统异常发育
被引量:1
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作者
刘洪超
胡澍
霍言言
丁劲峰
钟亚迪
涂心明
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机构
河南科技大学医学院生物医学实验教学中心神经遗传实验室
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出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期324-329,共6页
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基金
国家自然科学基金面上项目("果蝇tap基因的功能与调控研究"
No.31171256)资助~~
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文摘
[目的]果蝇tap基因编码进化保守的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)蛋白,该研究初步探索其在果蝇神经系统发育中的功能。[方法]合成tap基因的编码序列并亚克隆至p UAST质粒,通过胚胎显微注射和mini-white标记基因筛选,获得UAS-tap转基因果蝇。将该转基因品系分别与ap-GAL4和GMR-GAL4果蝇品系杂交,采用定量RT-PCR方法检测杂交前后tap基因表达水平,并在显微镜下观察杂交后代的发育情况。[结果]成功构建了p UAS-tap重组质粒,通过显微注射与转基因果蝇筛选、平衡及定位,共获得5个独立转基因品系。tap基因靶向表达后引起成虫出现糙眼,翅膀出现异位刚毛和异位翅脉表型。[结论]tap基因可能通过原神经模式,也可能通过调节神经前体细胞分化而参与神经发育。对该基因功能与调控的深入研究,将与脊椎动物中其同源基因ngn的同类研究互相借鉴。
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关键词
tap基因
bHLH蛋白
原神经
GAL4/UAS系统
黑腹果蝇
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Keywords
tap gene, bHLH protein, proneural, GAIA/UAS system, Drosophila melanogaster
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分类号
Q963
[生物学—昆虫学]
Q344
[生物学—遗传学]
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