目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨荆防颗粒治疗流感的机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)查询荆防颗粒的成分以及靶点,通...目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨荆防颗粒治疗流感的机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)查询荆防颗粒的成分以及靶点,通过GeneCards数据库查询流感的靶点,进而取交集得到荆防颗粒治疗流感的潜在靶点。通过STRING数据库对潜在靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,利用R软件RStudio对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.2构建“药物-成分-潜在靶点”网络。应用Autodock开展重要有效成分和关键靶点的分子对接。结果:共检索到荆防颗粒符合筛选标准(OB≥30%、DL≥0.18)的成分159个,检索到流感的靶点2574个,取交集得到54个靶点作为荆防颗粒治疗流感的潜在靶点。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,荆防颗粒主要通过作用于Influenza A、MAPK和TNF信号通路等发挥治疗流感的作用。槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山柰酚、柚皮素和汉黄芩素是荆防颗粒治疗流感的重要有效成分,PTGS2、PRSS1、ADRB2、MAPK14和RELA是治疗中的关键靶点。经过分子对接验证发现,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素与相关靶点的结合能较低,亲和力较好。结论:荆防颗粒可能通过作用于PTGS2、PRSS1、ADRB2、MAPK14和RELA等靶点,调控甲型流感信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路和IL-17信号通路等,实现对流感病毒的抑制和对机体免疫反应的调节。展开更多
文摘目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨荆防颗粒治疗流感的机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)查询荆防颗粒的成分以及靶点,通过GeneCards数据库查询流感的靶点,进而取交集得到荆防颗粒治疗流感的潜在靶点。通过STRING数据库对潜在靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,利用R软件RStudio对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.2构建“药物-成分-潜在靶点”网络。应用Autodock开展重要有效成分和关键靶点的分子对接。结果:共检索到荆防颗粒符合筛选标准(OB≥30%、DL≥0.18)的成分159个,检索到流感的靶点2574个,取交集得到54个靶点作为荆防颗粒治疗流感的潜在靶点。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,荆防颗粒主要通过作用于Influenza A、MAPK和TNF信号通路等发挥治疗流感的作用。槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山柰酚、柚皮素和汉黄芩素是荆防颗粒治疗流感的重要有效成分,PTGS2、PRSS1、ADRB2、MAPK14和RELA是治疗中的关键靶点。经过分子对接验证发现,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素与相关靶点的结合能较低,亲和力较好。结论:荆防颗粒可能通过作用于PTGS2、PRSS1、ADRB2、MAPK14和RELA等靶点,调控甲型流感信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路和IL-17信号通路等,实现对流感病毒的抑制和对机体免疫反应的调节。
