芍药GPPS基因克隆及生物信息学分析

以芍药根为试材,应用RT-PCR技术克隆芍药GPPS基因并对其进行综合生物信息学分析,研究了该基因在芍药萜类化合物合成途径中的功能,以期为GPPS基因的功能及其调控芍药萜类物质代谢提供参考依据。结果表明:芍药GPPS基因cDNA全长1 557 bp, GenBank登录号为KP645373,编码421个氨基酸,分子量为46.31 kDa,等电点为7.63,为不含跨膜结构域和信号肽位点、定位于细胞质的稳定疏水蛋白;BlastP分析表明芍药GPPS蛋白质与印楝GPPS相似性最高,达78.07%;蛋白质多序列比对分析结果表明GPPS蛋白质的氨基末端高度变异;分子系统发育分析表明芍药GPPS与其它植物GPPS亲缘关系相对较远。