为了获得白假丝酵母菌WO-1的完整分泌蛋白质组及其生物学信息,采用分析软件SignalP v 4.1、TMHMM server v 2.0、Phobius、TargetP 1.1及Big-PI Fungal Predictor v 3.1,对白假丝酵母菌WO-1全基因组6170个ORFs进行分泌蛋白预测和解析。...为了获得白假丝酵母菌WO-1的完整分泌蛋白质组及其生物学信息,采用分析软件SignalP v 4.1、TMHMM server v 2.0、Phobius、TargetP 1.1及Big-PI Fungal Predictor v 3.1,对白假丝酵母菌WO-1全基因组6170个ORFs进行分泌蛋白预测和解析。结果表明,白假丝酵母菌WO-1的预测分泌蛋白质组共包含216个蛋白质,信号肽切割位点前后-3^+3氨基酸组成丙氨酸(A)最多,切割位点相对不保守;31.90%的分泌蛋白已明确注释了细胞外定位,33.33%并无明确的细胞分布定位;预测的分泌蛋白共检索到生物学功能124个,其中具有水解酶活性的蛋白最多,占11.57%,同时存在40.28%的预测蛋白未注释明确的生物学功能。因此,分泌蛋白参与了白假丝酵母菌多种核心致病过程,分泌蛋白质组的获得将为揭示白假丝酵母菌WO-1的致病机理提供更加完备的参考。展开更多
文摘为了获得白假丝酵母菌WO-1的完整分泌蛋白质组及其生物学信息,采用分析软件SignalP v 4.1、TMHMM server v 2.0、Phobius、TargetP 1.1及Big-PI Fungal Predictor v 3.1,对白假丝酵母菌WO-1全基因组6170个ORFs进行分泌蛋白预测和解析。结果表明,白假丝酵母菌WO-1的预测分泌蛋白质组共包含216个蛋白质,信号肽切割位点前后-3^+3氨基酸组成丙氨酸(A)最多,切割位点相对不保守;31.90%的分泌蛋白已明确注释了细胞外定位,33.33%并无明确的细胞分布定位;预测的分泌蛋白共检索到生物学功能124个,其中具有水解酶活性的蛋白最多,占11.57%,同时存在40.28%的预测蛋白未注释明确的生物学功能。因此,分泌蛋白参与了白假丝酵母菌多种核心致病过程,分泌蛋白质组的获得将为揭示白假丝酵母菌WO-1的致病机理提供更加完备的参考。