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基于网络药理学的白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤的作用机制研究
1
作者
刘飞飞
韩丽君
+1 位作者
申友奎
陶开亮
《心电与循环》
2023年第3期240-244,249,I0002,I0003,I0004,共9页
目的基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法检索TCMSP、BATMAN-TCM、SuperPred、PharmMapper、SwissTargetPrediction和Drugbank数据库筛选获得白藜芦醇作用靶点577个,检索TTD、Drugbank、CTD、GeneCards...
目的基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法检索TCMSP、BATMAN-TCM、SuperPred、PharmMapper、SwissTargetPrediction和Drugbank数据库筛选获得白藜芦醇作用靶点577个,检索TTD、Drugbank、CTD、GeneCards、OMIM和Malacards数据库获得TBI相关靶点1100个,利用UniProt数据库获得交集靶点(即白藜芦醇治疗TBI的作用靶点)165个,构建药物-靶点-疾病网络。采用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)。采用Metascape数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用AutoDockTools 1.5.6、Pymol 2.4.0、DiscoveryStudio 2020软件进行白藜芦醇与核心靶点的分子对接分析。结果165个交集靶点中,PPI排名前10的节点(即核心靶点)包括胰岛素(INS)、胰岛素样生长因子1、肿瘤坏死因子、TP53、白蛋白、白细胞介素(IL)-6、SRC、信号转导和转录活化因子3、血管内皮生长因子A、基质金属蛋白酶(MMP)-9。交集靶点的GO富集分析显示,生物过程主要涉及转移酶活性的正调控、细胞迁移的积极调控、活性氧代谢过程、对受伤的反应、内皮细胞增殖等;分子功能主要涉及激酶结合、蛋白激酶活性、蛋白磷酸酶结合、细胞因子受体结合、蛋白酶结合、转录因子结合等;细胞组分主要涉及膜筏、囊泡腔、突触后膜、树突、内质网腔、细胞间连接等。交集靶点的KEGG富集分析显示,信号通路主要涉及癌症途径、AGEs-RAGE信号通路、FoxO信号通路、补体与凝血级联等。分子对接显示白藜芦醇与IL-6、MMP-9、INS、SRC均有较好的结合活性。分子对接结果显示,白藜芦醇与10个核心靶点成功对接,其中白藜芦醇与IL-6、MMP-9、INS、SRC的对接结合能<-5 kJ/mol。结论白藜芦醇可能通过多靶点、多通路发挥减轻TBI和促进神经功能恢复的治疗作用。
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关键词
白藜芦醇
创伤性颅脑损伤
网络药理学
分子对接
生物信息学
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职称材料
血浆纤维连接蛋白1对颅内动脉瘤破裂的预测价值
2
作者
刘飞飞
韩丽君
+1 位作者
申友奎
徐良
《心电与循环》
2022年第2期130-133,共4页
目的 探讨血浆纤维连接蛋白1(FN1)对颅内动脉瘤(IA)破裂的预测价值。方法 选取2019年11月至2020年11月在浙江大学医学院附属第二医院住院治疗的201例IA患者为研究对象,其中IA破裂94例,未破裂107例。比较IA破裂与未破裂患者的临床资料,...
目的 探讨血浆纤维连接蛋白1(FN1)对颅内动脉瘤(IA)破裂的预测价值。方法 选取2019年11月至2020年11月在浙江大学医学院附属第二医院住院治疗的201例IA患者为研究对象,其中IA破裂94例,未破裂107例。比较IA破裂与未破裂患者的临床资料,采用多因素logistic回归分析IA破裂的影响因素,绘制ROC曲线分析血浆FN1水平预测IA破裂的效能。结果 IA破裂与未破裂患者在动脉瘤位置、形态、有无子囊及血浆FN1水平等方面比较,差异均有统计学意义(均P<0.05);在性别、年龄、体重指数、合并高血压比例、动脉瘤直径、多发动脉瘤比例等方面比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。多因素logistic回归分析显示,血浆FN1水平、非颈内动脉的动脉瘤、有无子囊是IA破裂的独立影响因素(均P<0.05)。血浆FN1水平预测IA破裂的AUC为0.621(最佳截断值为389 mg/L),灵敏度、特异度、约登指数分别为0.489、0.748、0.237。结论 血浆FN1水平是IA破裂的独立影响因素,且对IA破裂具有一定的预测效能。
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关键词
颅内动脉瘤
纤维连接蛋白1
危险因素
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职称材料
题名
基于网络药理学的白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤的作用机制研究
1
作者
刘飞飞
韩丽君
申友奎
陶开亮
机构
浙江
中医药大学
附属
杭州市中医院
神经外科
浙江中医药大学附属杭州市中医院体检中心
出处
《心电与循环》
2023年第3期240-244,249,I0002,I0003,I0004,共9页
基金
浙江省中医药科技计划项目(2021ZA105)。
文摘
目的基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法检索TCMSP、BATMAN-TCM、SuperPred、PharmMapper、SwissTargetPrediction和Drugbank数据库筛选获得白藜芦醇作用靶点577个,检索TTD、Drugbank、CTD、GeneCards、OMIM和Malacards数据库获得TBI相关靶点1100个,利用UniProt数据库获得交集靶点(即白藜芦醇治疗TBI的作用靶点)165个,构建药物-靶点-疾病网络。采用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)。采用Metascape数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用AutoDockTools 1.5.6、Pymol 2.4.0、DiscoveryStudio 2020软件进行白藜芦醇与核心靶点的分子对接分析。结果165个交集靶点中,PPI排名前10的节点(即核心靶点)包括胰岛素(INS)、胰岛素样生长因子1、肿瘤坏死因子、TP53、白蛋白、白细胞介素(IL)-6、SRC、信号转导和转录活化因子3、血管内皮生长因子A、基质金属蛋白酶(MMP)-9。交集靶点的GO富集分析显示,生物过程主要涉及转移酶活性的正调控、细胞迁移的积极调控、活性氧代谢过程、对受伤的反应、内皮细胞增殖等;分子功能主要涉及激酶结合、蛋白激酶活性、蛋白磷酸酶结合、细胞因子受体结合、蛋白酶结合、转录因子结合等;细胞组分主要涉及膜筏、囊泡腔、突触后膜、树突、内质网腔、细胞间连接等。交集靶点的KEGG富集分析显示,信号通路主要涉及癌症途径、AGEs-RAGE信号通路、FoxO信号通路、补体与凝血级联等。分子对接显示白藜芦醇与IL-6、MMP-9、INS、SRC均有较好的结合活性。分子对接结果显示,白藜芦醇与10个核心靶点成功对接,其中白藜芦醇与IL-6、MMP-9、INS、SRC的对接结合能<-5 kJ/mol。结论白藜芦醇可能通过多靶点、多通路发挥减轻TBI和促进神经功能恢复的治疗作用。
关键词
白藜芦醇
创伤性颅脑损伤
网络药理学
分子对接
生物信息学
Keywords
Resveratrol
Traumatic brain injury
Network pharmacology
Molecular docking
Bioinformatics
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
血浆纤维连接蛋白1对颅内动脉瘤破裂的预测价值
2
作者
刘飞飞
韩丽君
申友奎
徐良
机构
浙江
中医药大学
附属
杭州市中医院
神经外科
浙江中医药大学附属杭州市中医院体检中心
浙江
大学
医学院
附属
第二
医院
神经外科
出处
《心电与循环》
2022年第2期130-133,共4页
基金
浙江省中医药科技计划项目(2021ZA105)
浙江省基础公益研究计划项目(LQ19H160039)。
文摘
目的 探讨血浆纤维连接蛋白1(FN1)对颅内动脉瘤(IA)破裂的预测价值。方法 选取2019年11月至2020年11月在浙江大学医学院附属第二医院住院治疗的201例IA患者为研究对象,其中IA破裂94例,未破裂107例。比较IA破裂与未破裂患者的临床资料,采用多因素logistic回归分析IA破裂的影响因素,绘制ROC曲线分析血浆FN1水平预测IA破裂的效能。结果 IA破裂与未破裂患者在动脉瘤位置、形态、有无子囊及血浆FN1水平等方面比较,差异均有统计学意义(均P<0.05);在性别、年龄、体重指数、合并高血压比例、动脉瘤直径、多发动脉瘤比例等方面比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。多因素logistic回归分析显示,血浆FN1水平、非颈内动脉的动脉瘤、有无子囊是IA破裂的独立影响因素(均P<0.05)。血浆FN1水平预测IA破裂的AUC为0.621(最佳截断值为389 mg/L),灵敏度、特异度、约登指数分别为0.489、0.748、0.237。结论 血浆FN1水平是IA破裂的独立影响因素,且对IA破裂具有一定的预测效能。
关键词
颅内动脉瘤
纤维连接蛋白1
危险因素
Keywords
Intracranial aneurysm
Fibronectin 1
Risks factors
分类号
R743 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学的白藜芦醇治疗创伤性颅脑损伤的作用机制研究
刘飞飞
韩丽君
申友奎
陶开亮
《心电与循环》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
血浆纤维连接蛋白1对颅内动脉瘤破裂的预测价值
刘飞飞
韩丽君
申友奎
徐良
《心电与循环》
2022
0
下载PDF
职称材料
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