适用于结核分枝杆菌RNA抽提的实验方法学研究

目的分枝杆菌的细胞壁结构和成分特殊而复杂,在RNA提取的实验方法学上是否区别于一般的细菌,有待考察。本文使用了异硫氰酸胍提取法与商业化的细菌RNA抽提试剂盒法进行对照,对减活牛型分枝杆菌卡介苗(BCG)进行RNA的抽提,进而确定了适用于分枝杆菌RNA抽提的最优方法。方法分别用异硫氰酸胍提取法和E.Z.N.A.^(TM)Bacterial RNA提取试剂盒从一定量的卡介苗细菌培养物中提取RNA,用Nanodrop2000c检测抽提所得的RNA的浓度和纯度。结果用异硫氰酸胍法从1到30 mg的BCG中均能提取到大量的RNA,而用E.Z.N.A.TMBacterial RNA提取试剂盒几乎未提取到RNA,而且在纯度上前者好于后者。结论异硫氰酸胍的裂解效率远远高于溶菌酶。对于分枝杆菌例如结核分枝杆菌RNA的提取应该使用异硫氰酸胍法。