结直肠癌患者二代测序鉴定微小RNA单核苷酸多态性位点及其对微小RNA功能的影响

目的：探讨微小RNA（ miRNA）相关单核苷酸多态性（ SNP ）与结直肠癌发生发展之间的关系。方法收集30例结直肠癌患者的癌和癌旁组织，提取基因组DNA。将癌和癌旁组织混合，应用NimbleGen私人订制的芯片对685个miRNA基因目的区域进行捕获，经过洗脱扩增处理后，采用二代测序技术对捕获区域进行深度测序，并对测序数据进行分析。结果共鉴定43个miRNA的64个SNPs，其中60个SNPs为新发现。 TargetScan和mirSNP 检测结果显示， hsa-mir-1273-G／A、hsa-mir-548h-3-C／U、hsa-mir-1290-A／G和hsa-mir-1273-C／U突变后，其成熟miRNA的表达量降低。 hsa-mir-1268-U／C、hsa-mir-1268-C／U和hsa-mir-1285-1-U／C突变后其表达量增加。 hsa-mir-376b-C／G、hsa-mir-604-T／C、hsa-mir-1268-T／G 和 hsa-mir-146a-C／G 突变前后的靶基因均发生改变。 mir-146a rs1052918 C＞G突变促进肿瘤的发展。结论 miRNA突变影响肿瘤的发生发展，在无Wnt信号的情况下，hsa-mir-146a突变后导致Wnt信号通路一直处于激活状态，导致细胞无限增殖。