测量不确定性下的种猪生长性能人工与电子测定工作数据正确性表现(上)

种猪生长性能的电子测定设备对加快育种做出了重大贡献,我国养猪界对电子测定技术在种猪育种领域的应用价值也有所熟知,但很多猪场并没有使所测定数据发挥应有的作用,原因是人们普遍质疑测定数据的正确性,是测定人员对电子测定的工作数据的正确性表现存在认识误区,从而不能采取有效的测定管理。本文探讨了被测量值与测量误差在人工测定和电子测定工况下的表现和特点,以帮助人们正确认识电子测定设备在种猪生长性能测定中的价值,加快我国种猪的遗传育种进展。

测量不确定性下的种猪生产性能电子测定工作数据的监测和可信度评估方法

电子测定技术是在现代育种技术需要和现代科技进步下发展起来的一种针对饲料报酬测定的新技术,不仅极大提高了测定工作效率,也提供了现代育种技术所需要的动物生长全过程的表型值信息。但电子测定工作数据也带来了与传统习惯认知不同的表现,主要是在工作数据的正确性表述上。测量不确定观点认为,测量过程中的不确定性广泛存在于所有的测量工作中,被测量值(“真值”)是一个理想化概念,而且测量得到的量值(“测量结果”)也必定存在某些不确定的误差。电子测定与传统习惯的人工测定在工作数据正确性表述上不同的原因是测量不确定效应对这两种数据的影响不同,而且电子测定工作数据到目前为止还是一个没有测定意义的纯记录性质的观测列数据。在电子测定过程中,对测定过程的监测和测定数据正确程度的评估是测定管理中一个很重要的工作内容,监测是监视工作数据中的异常表现,评估计算工作数据中的异常表现对其正确性的影响程度。本文在测量不确定性观点下,从监测和评估电子测定工作数据正确性的可行性上分析电子测定过程中可能出现的问题和评定测定工作数据质量可信度的方法。

猪FRZB、ABCF1基因多态性与生长性状的关联分析

FRZB基因通过抑制Wnt信号途径调控细胞生长,ABCF1(也称为ABC50)结合e IF2,在翻译起始中发挥着重要的作用,可作为猪生长性状相关的候选基因。本研究采用直接测序法检测FRZB基因和ABCF1基因5'非翻译区中单核苷酸多态性(SNPs)基因型分布,并分析基因型与生长性状的相关性。结果表明:在美系大白猪中,FRZB基因位点ins(A-532G)多态性与背膘厚呈极显著相关(P<0.01),与体长接近显著水平(P=0.05);ABCF1基因254A/G多态性与背膘厚、左乳头数和右乳头数均呈显著相关(P<0.05);在法系大白中,ABCF1基因254A/G多态性与初生重呈显著相关(P<0.05)。结果表明,FRZB和ABCF1基因是潜在的影响猪生长性状的候选基因。

哺乳期经产母猪背膘变化对其繁殖性能的影响

母猪繁殖性能是影响猪场经济效益的重要指标之一，在一定程度上也反映了猪场的整体生产管理水平。膘情是一个衡量母猪体况的重要指标，它可以反映出母猪在不同生理阶段的营养状况和能量储备，并且影响母猪繁殖性能。母猪的膘情会受到生理阶段、饲料营养、

大白猪PTGS2基因外显子2多态性及其与繁殖性状的关联分析

试验旨在研究前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)基因的单核苷酸多态性,并将其与大白猪的繁殖性状进行关联分析,为猪分子遗传标记提供依据。以美系及法系纯种大白猪基因组DNA为模板,构建DNA混合池,通过克隆测序比对,检测猪PTGS2基因的遗传变异;采用PCR-RFLP技术对多态性位点进行基因分型,并与目标性状进行关联分析。结果显示,在猪PTGS2基因外显子2上存在1个g.86A>G碱基突变,并具有MspⅠ酶切位点多态性,且在大白猪群体中检测到AA、AG和GG 3种基因型;哈迪-温伯格平衡检验结果显示,在法系大白猪群体中,PTGS2基因g.86A>G多态性分布达到遗传平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在美系大白猪群体中,AA基因型初产母猪弱仔数显著少于AG基因型(P<0.05),AA基因型经产母猪初生窝重显著高于AG基因型(P<0.05);在法系大白猪群体中,GG基因型个体总产仔数、健仔数和初生窝重均高于AA和AG基因型,但未达到显著水平(P>0.05)。PTGS2基因外显子2g.86A>G多态性位点显著影响初生窝重和弱仔数,可作为猪分子标记辅助选择育种的潜在位点。

大白猪FSHβ和RBP4基因多态性与繁殖性状的相关性研究

分子标记辅助选择(Marker-assisted selection,MAS)相对于传统的育种技术,在早期选择、选择准确性等方面具有显著的优越性。该研究以633头美系大白猪和963头法系大白猪为研究对象,利用PCR-RFLP技术对fSHβ和RBP4基因的多态性进行检测,并进行关联分析。研究结果表明:在美系和法系大白猪中均检测到FSHβ和RBP4基因存在三种基因型(AA、AB和BB基因型);在美系初产和经产大白母猪中,FSHβ基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AA基因型个体(P<0.05);在美系和法系大白猪中,初产和经产母猪RBP4基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AA基因型个体(P<0.05)。然而,FSHβ和RBP4基因研究结果与现有报道不尽一致,其用于大白母猪育种工作还有待进一步验证。

大白猪ESR基因多态性与繁殖性状的相关性研究

猪产仔数是重要的经济性状,提高产仔数可以增加猪肉的产量,为养猪业带来巨大的经济效益。该研究以美系大白猪(633头)和法系大白猪(963头)为研究对象,利用PCR-RFLP技术对ESR基因的多态性进行检测,并进行关联分析。研究结果表明:在美系和法系大白猪中均检测到ESR基因存在3种基因型(AA、AB和BB基因型);在美系和法系大白猪中,初产和经产母猪ESR基因BB基因型个体的总产仔数、健仔数和初生窝重均显著高于AB基因型和AA基因型个体(P<0.05)。综合来看,ESR基因变异对美系和法系大白母猪的产仔数和初生窝重具有显著的遗传效应,可以应用于大白母猪产仔数的标记辅助选择。

大白、长白达100kg体重时体长校正公式的研究

（上接2015年12期97页） 2．2．3 法系大白猪达100kg体重时体长的校正公式 以法系大白猪的体重为X轴，体长为Y轴做散点图（图4），发现体重与体长存在线性关系。

大白、长白达100kg体重时体长校正公式的研究

本试验以大白猪和长白猪为试验对象,采集了2085头猪的体重和体长数据。利用SAS9.0软件分析了体长与体重间的相关系数,建立了大白猪和长白猪达100 kg体重的体长回归模型和体长校正公式。大白和长白猪体长与体重的相关系数分别为0.7321和0.7828,均达到了极显著水平(P<0.01)。大白猪的体长校正公式为:100 kg体重校正体长(cm)=实测体长×112.9/[112.9+0.4067×(实测体重-100)];长白猪的体长校正公式为:100 kg体重校正体长(cm)=实测体长×115.6995/[115.6995+0.4529×(实测体重-100)]。

美系大白猪LEF-1基因多态性与乳头数及生长性状的相关性研究

乳头数是衡量母猪整体繁殖性能的重要指标之一,增加母猪有效乳头数对于提高仔猪哺乳成活率具有重要意义。该试验采用PCR-RFLP技术,在美系大白(633头)群体中,对LEF-1基因的多态性进行检测和遗传效应分析。研究结果发现,在美系大白猪中检测到LEF-1基因三种基因型(AA、AG和GG基因型)的存在,但不同基因型个体之间乳头数无显著差异。

大白猪群中HDAC1基因多态性与重要经济性状的相关性研究

该研究利用PCR-RFLP技术检测343头法系大白猪HDAC1基因酶切位点多态性,并对乳头数、达100 kg体重日龄、校正背膘厚、初生重和体长等性状进行关联分析。结果显示:在法系大白群体中检测到HDAC1基因3种基因型(分别为AA、AG和GG基因型)的存在。HDAC1基因HinfⅠ位点与大白猪达100 kg体重日龄显著相关,G等位基因具有显著降低达100 kg体重日龄的遗传效应,而GG基因型个体的初生重要高于AA基因型个体,GG基因型个体的生长性能有着明显优势。

大白猪群中CTSL基因多态性与生长性状的关联分析

组织蛋白酶L(CTSL)基因属于组织蛋白酶(cathepsin)家族成员之一,该基因在调控肉质嫩度上发挥着重要作用,可以作为猪生长和胴体性状的候选基因。实验采用PCR-RFLP技术在大白猪群体中对CTSL基因第5外显子g.143 C>T单核苷酸多态性位点进行检测,分析该位点与生长及胴体性状的关联性。结果表明:在大白猪群体中共有3种基因型,分别是TT、TC和CC基因型,CC基因型个体达100 kg体重日龄天数显著小于TT基因型个体(P<0.05),但其他性状关联分析结果未达到显著水平。

大白猪群中PIT1基因多态性与生长性状的相关性研究

猪的生长性状能反映猪的生长速度,研究其遗传机理具有重要意义。本研究利用PCR-RFLP技术检测343头法系大白猪PIT1基因Msp I酶切位点多态性,并对乳头数、达100 kg体重日龄、校正背膘厚、初生重和体长等性状进行关联分析。结果显示在法系大白群体中检测到PIT基因3种基因型(分别为DD、CD、CC基因型)的存在,其中PIT1基因DD基因型个体左乳头数高于CC基因型个体,且显著(P<0.05)高于CD基因型个体,而CC基因型个体的活体背膘厚和100 kg体重日龄要低于DD基因型个体,但并没有达到显著水平。

种猪自动测定设备数据中的单次最大采食量和单次最小采食量的监控阈值探讨

种猪自动测定设备是收集表型饲料采食数据、日增重、猪只采食行为等的集机械、电气电子和计算机、数据软件为一体的专门测定工具,也是现场育种和分子育种的重要工具。只有正确度高且可靠的测定数据,才能进行后续的日增重、料比等分析,才能对生产进行可靠的指导。然而自动测定设备所处的测定环境却相对比较恶劣,影响数据正确性的因素也很多。在多年的实践过程中发现测定数据会出现不少不合理甚至有悖常理的数据,对这些现象的科学分析是理解数据的正确性和提高测定数据正确性的管理的重要途径之一。笔者在测定过程中,发现单次采食有高有低,高的一次采食3 kg或以上,最低的甚至是出现负值的典型错误数据现象。文章进行了单次采食量最大值和最小值阈值的探讨,希望能抛砖引玉,供同仁参考。

种猪生长性能自动测定设备数据的特点及其正确性监控内容

种猪生长性能自动测定设备所获得的测定数据受到的影响因素比其他行业多,它不仅在环境比较恶劣的猪舍中运行,加上测定对象是有丰富动物行为的活猪,为此自动测定设备的测定工作会经常处于被干扰和测定数据容易出错的状态。笔者在现场多年的实践过程中发现其测定数据会出现不少不合理甚至有悖常理的数据,文章对此现象对测定数据出现的特点和测定数据正确性问题进行了分析和探讨,望能抛砖引玉,供同行参考。

直观影响种猪生长性能自动测定设备测定数据质量的因素及其阈值探讨

种猪自动测定设备采集表型饲料采食数据、日增重、猪只采食行为等数据,是集机械、电气电子和计算机、数据软件为一体的专门测定工具,也是现场育种和分子育种的重要又精密的测定数据采集工具。然而自动测定设备所处的测定环境却相对比较恶劣,影响数据正确性的因素也很多。影响数据正确性的因素中还有比较直观的影响因素,这些因素表现在一些明显差错类型的测定数据上,如相邻日体重变化量、数据链中断、零耳牌事件、饲料称重稳定性等。这些类型的异常数据也直接和间接地影响了测定数据的正确性,本文就这些影响因素对数据质量的影响及其阈值进行初步探讨。

建立数据质量管理系统来管理种猪生长性能自动测定设备的测定数据

性能测定是所有育种工作的前提和基础,自动测定设备的测定又是比较精确的测定工作,但人们囿于对集成化测定设备的理解,误认为从中获取的数据可以直接拿来分析,用分析后的结论进行育种或生产指导。因为自动测定设备的工作环境(猪舍)相对比较复杂、工作对象(猪)又非常活跃,它的测定工作就会受到较多因素的影响。不同的影响因素对测定数据的影响程度是不一样的。该文中从借鉴工业数据质量管理的思路,通过实践逐步在现场建立"种猪生长性能自动测定设备数据质量管理系统",以期获得符合猪只真实行为的真实性能水平数据,以便能进一步增加使用这些数据的可靠性。