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基于全基因组重测序技术的浙江近岸海域耐盐金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)耐药机制解析
1
作者
张旨轩
王子言
+7 位作者
王泽
刘岩
刘松怡
钱鹏宇
叶欢
韩姣姣
周君
苏秀榕
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期394-404,共11页
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是近岸海域海水中的主要病原菌,严重威胁接触者的安全。抗生素处理是治疗金黄色葡萄球菌感染的重要手段,其耐药性的发生受到了高度重视。采用全基因组重测序与KEGG富集分析结合的方法,对红霉素(er...
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是近岸海域海水中的主要病原菌,严重威胁接触者的安全。抗生素处理是治疗金黄色葡萄球菌感染的重要手段,其耐药性的发生受到了高度重视。采用全基因组重测序与KEGG富集分析结合的方法,对红霉素(erythromycin)、氯霉素(chloramphenicol)和万古霉素(vancomycin)处理后的耐盐金黄色葡萄球菌(S.aureus ZS01)和不耐盐金黄色葡萄球菌(S.aureus 502A)进行耐药机制研究。结果表明,S.aureus 502A经抗生素处理后发生突变的程度大于S.aureus ZS01,二者在经过氯霉素处理发生了更大程度的突变。红霉素、氯霉素和万古霉素处理主要影响了金黄色葡萄球菌的致病能力;红霉素和氯霉素可能通过影响金黄色葡萄球菌脂类的代谢引起其耐药性的变化。除此之外,三种抗生素处理均出现了较多TIGR01741家族蛋白和假设蛋白基因的突变,推测与菌株的耐药性和致病性相关。耐盐金黄色葡萄球菌可通过外排系统作用产生红霉素耐药性,不耐盐菌株因细胞壁成分相关基因的突变提高了对万古霉素的耐受性。研究结果可为耐盐和不耐盐金黄色葡萄球菌的耐药机制及抗生素对金黄色葡萄球菌致病性影响的研究提供基础数据。
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关键词
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus
aureus)
全基因组重测序
KEGG富集分析
耐药机制
致病性
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职称材料
基于高通量测序的象山港水域细菌多样性的研究
被引量:
4
2
作者
刘岩
李志恩
+8 位作者
袁一鸣
张真
钱鹏宇
叶欢
刘松怡
王泽
韩姣姣
周君
苏秀榕
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期645-653,共9页
象山港位于浙江省宁波市东南部沿海,属于半封闭式海湾,是以海水养殖区和海洋牧场示范区为主的重要多功能水域,近年来生态环境问题日益突出。为研究象山港海域在早春低水温环境中细菌的多样性,通过高通量测序方法对3月份的象山港水域进...
象山港位于浙江省宁波市东南部沿海,属于半封闭式海湾,是以海水养殖区和海洋牧场示范区为主的重要多功能水域,近年来生态环境问题日益突出。为研究象山港海域在早春低水温环境中细菌的多样性,通过高通量测序方法对3月份的象山港水域进行检测。沿象山港南部海湾随机选取6个取样点(G04,G06,G08,G09,G011,G012),共检出836属和2166种细菌,隶属33个门、91纲、186目和352科。其中优势细菌类群主要包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。变形菌门在G04中占比最高(91.45%),拟杆菌门在G09中占比最高(18.05%);而放线菌门在G12中占比最高(7.95%)。在经度较高且离海岸较远的水域,细菌丰富度也越高;同时随着取样位点纬度的增加,γ-变形菌丰度逐步增高,其中在G04中最高(72.76%),在G12中最低(29.11%)。各取样点的细菌分离培养结果也表明弧菌属丰度较高,且主要集中在G04中。利用高通量测序方法揭示了象山港早春全水域的细菌结构组成框架图,可为象山港的水产养殖和可持续发展提供参考依据。
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关键词
象山港水域
细菌分离培养
高通量测序
细菌多样性
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职称材料
题名
基于全基因组重测序技术的浙江近岸海域耐盐金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)耐药机制解析
1
作者
张旨轩
王子言
王泽
刘岩
刘松怡
钱鹏宇
叶欢
韩姣姣
周君
苏秀榕
机构
宁波大学海洋学院
浙江正合谷生物科技有限公司
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期394-404,共11页
基金
国家重点研发计划资助项目,2017YFC1404505号
海洋经济创新发展区域示范专项,甬海办[2016]71号。
文摘
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是近岸海域海水中的主要病原菌,严重威胁接触者的安全。抗生素处理是治疗金黄色葡萄球菌感染的重要手段,其耐药性的发生受到了高度重视。采用全基因组重测序与KEGG富集分析结合的方法,对红霉素(erythromycin)、氯霉素(chloramphenicol)和万古霉素(vancomycin)处理后的耐盐金黄色葡萄球菌(S.aureus ZS01)和不耐盐金黄色葡萄球菌(S.aureus 502A)进行耐药机制研究。结果表明,S.aureus 502A经抗生素处理后发生突变的程度大于S.aureus ZS01,二者在经过氯霉素处理发生了更大程度的突变。红霉素、氯霉素和万古霉素处理主要影响了金黄色葡萄球菌的致病能力;红霉素和氯霉素可能通过影响金黄色葡萄球菌脂类的代谢引起其耐药性的变化。除此之外,三种抗生素处理均出现了较多TIGR01741家族蛋白和假设蛋白基因的突变,推测与菌株的耐药性和致病性相关。耐盐金黄色葡萄球菌可通过外排系统作用产生红霉素耐药性,不耐盐菌株因细胞壁成分相关基因的突变提高了对万古霉素的耐受性。研究结果可为耐盐和不耐盐金黄色葡萄球菌的耐药机制及抗生素对金黄色葡萄球菌致病性影响的研究提供基础数据。
关键词
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus
aureus)
全基因组重测序
KEGG富集分析
耐药机制
致病性
Keywords
Staphylococcus aureus
whole-genome resequencing
KEGG enrichment analysis
drug resistance mechanism
pathogenicity
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
Q938.8 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
基于高通量测序的象山港水域细菌多样性的研究
被引量:
4
2
作者
刘岩
李志恩
袁一鸣
张真
钱鹏宇
叶欢
刘松怡
王泽
韩姣姣
周君
苏秀榕
机构
宁波大学海洋学院
国家海洋局东海环境监测中心
浙江正合谷生物科技有限公司
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期645-653,共9页
基金
国家重点研发计划资助项目,2017YFC1404505号
海洋经济创新发展区域示范专项,甬海办[2016]71号。
文摘
象山港位于浙江省宁波市东南部沿海,属于半封闭式海湾,是以海水养殖区和海洋牧场示范区为主的重要多功能水域,近年来生态环境问题日益突出。为研究象山港海域在早春低水温环境中细菌的多样性,通过高通量测序方法对3月份的象山港水域进行检测。沿象山港南部海湾随机选取6个取样点(G04,G06,G08,G09,G011,G012),共检出836属和2166种细菌,隶属33个门、91纲、186目和352科。其中优势细菌类群主要包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。变形菌门在G04中占比最高(91.45%),拟杆菌门在G09中占比最高(18.05%);而放线菌门在G12中占比最高(7.95%)。在经度较高且离海岸较远的水域,细菌丰富度也越高;同时随着取样位点纬度的增加,γ-变形菌丰度逐步增高,其中在G04中最高(72.76%),在G12中最低(29.11%)。各取样点的细菌分离培养结果也表明弧菌属丰度较高,且主要集中在G04中。利用高通量测序方法揭示了象山港早春全水域的细菌结构组成框架图,可为象山港的水产养殖和可持续发展提供参考依据。
关键词
象山港水域
细菌分离培养
高通量测序
细菌多样性
Keywords
Xiangshan harbor
bacterial isolation and culture
high-throughput sequencing
community structure
分类号
Q958.1 [生物学—动物学]
X171 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组重测序技术的浙江近岸海域耐盐金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)耐药机制解析
张旨轩
王子言
王泽
刘岩
刘松怡
钱鹏宇
叶欢
韩姣姣
周君
苏秀榕
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
基于高通量测序的象山港水域细菌多样性的研究
刘岩
李志恩
袁一鸣
张真
钱鹏宇
叶欢
刘松怡
王泽
韩姣姣
周君
苏秀榕
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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职称材料
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