大豆花叶病毒黄淮5号株系的基因组全序列分析

测定了大豆花叶病毒 (SMV)我国黄淮 5号 (Y5 )株系的基因组全序列。该病毒基因组全长 95 85个核苷酸 ,3′-末端具 poly(A)尾 ,包含单一开放读码框 ,编码一个 349 2kD的多聚蛋白。基因组全序列和美国SMVG2和G7株系的核苷酸同源性分别为 97 4 %和 96 9%。多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的 10个成熟蛋白。Y5、G2和G73个株系的不同成熟蛋白间氨基酸序列的同源性为 89 6 %～ 10 0 %。多重比较分析表明 ,Y5株系P1蛋白N -末端区域与G2和G7存在明显差异。进一步分析显示 ,这 3个株系的 6K1、6K2、NIa -Pro、NIa -VPg、NIb蛋白中心区域和CP蛋白高度保守 ,P1蛋白N -末端 ,CI和P3蛋白C -末端以及HC -Pro蛋白变异较大 。