染色体17q区拷贝数变异与肝细胞癌总生存的相关性及靶基因的筛选

目的探讨染色体17q拷贝数变异（copynumbervariation，CNV）与肝细胞癌（hepatocellularcarcinoma，HCC）术后总生存（overallsurvival，OS）的相关性以及预后相关CNV内的潜在靶基因。方法纳入HCC手术患者174例，其中66例有完整术后OS随访资料。应用AgilentHu-244A微阵列比较基因组杂交和AffymetrixU133Plus2．0表达芯片分别检测染色体17qCNV和基因表达。结果17q25．1—25．3增益与0S显著相关（P一0．00002）。多因素Cox回归分析显示，17q25．1-25．3增益是0S的独立不良预后因素（HR：3．17，95％CI：1.39～7。26，P=0。006）。基因CNV与mRNA表达的联合分析显示，SLC9A3R1、GRB2、TK1等18个基因mRNA表达水平在基因增益HCC中显著高于基因无增益HCC（FDR-q〈0．05，P〈0．01）及癌旁肝组织（P〈0．01）。结论17q25．1.25．3增益与HCC不良预后有关，可作为HCC的一个预后预测因子。SLC9A3R1、GRB2、TK1基因可能是17q25．1-25．3增益的潜在靶基因。