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浙江省天台县2011-2018年汉坦病毒基因型别和进化变异研究
被引量:
5
1
作者
姚苹苹
陈钢
+8 位作者
徐芳
杨章女
陈晨
孙一晟
卢杭景
庞卫龙
张云
朱函坪
项海青
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1285-1290,共6页
目的研究2011-2018年肾综合征出血热(HFRS)国家监测点浙江省天台县汉坦病毒(HV)的基因型别和进化变异情况,了解天台县HV分子流行病学特点.方法将天台县2011-2018年HV抗原阳性的鼠肺标本超声后提取核酸,利用HV型特异性引物,应用巢式PCR...
目的研究2011-2018年肾综合征出血热(HFRS)国家监测点浙江省天台县汉坦病毒(HV)的基因型别和进化变异情况,了解天台县HV分子流行病学特点.方法将天台县2011-2018年HV抗原阳性的鼠肺标本超声后提取核酸,利用HV型特异性引物,应用巢式PCR对部分M片段进行扩增分型和序列测定,将天台县2011-2018年的HV序列与国内外其他已知的HV序列进行比较,以明确该地区的基因型别,分析病毒的进化变异情况.结果HV抗原阳性的67份鼠肺标本经型特异性引物巢式PCR扩增后31份标本为阳性,其中30份为汉滩病毒(HTNV)、1份为汉城病毒(SEOV),31份PCR阳性鼠肺均来自黑线姬鼠.31份巢式PCR阳性产物的部分M片段核苷酸序列有30株分布在HTNV单元群,1株分布在SEOV单元群.HTNV单元群中的天台T2018-130株与天台其余29株及国内外其他株同源性为84.8%~87.9%,差异较大,天台其余29株亲缘关系较近;SEOV发生群中的T2016-31株来自黑线姬鼠的鼠肺标本,与SEOV天台以往分离株ZT71株、ZT10株和浙江温州分离株Z37株在系统发生树上分布于同一或临近分支.结论浙江省天台县HV流行的主要型别HTNV基因表现出明显的地理聚集现象,但也存在着基因差异较大的变异株T2018-130株;同时从病毒基因序列分析证实SEOV T2016-31株存在于黑线姬鼠中,可能意味着在SEOV进化过程中病毒在宿主间发生了“溢出”现象.
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关键词
汉坦病毒
基因型
进化变异
流行特征
原文传递
题名
浙江省天台县2011-2018年汉坦病毒基因型别和进化变异研究
被引量:
5
1
作者
姚苹苹
陈钢
徐芳
杨章女
陈晨
孙一晟
卢杭景
庞卫龙
张云
朱函坪
项海青
机构
浙江省疾病预防控制中心微生物检验所浙江省传染病疫苗与预防控制研究重点实验室
天台县
疾病预防控制中心
南京军区军事医学
研究
所
杭州市卫生事业发展
中心
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1285-1290,共6页
基金
国家自然科学基金(81473036,81171609)
国家重点研发计划(2017YFC1601503)
国家科技重大专项(2018ZX10714002)。
文摘
目的研究2011-2018年肾综合征出血热(HFRS)国家监测点浙江省天台县汉坦病毒(HV)的基因型别和进化变异情况,了解天台县HV分子流行病学特点.方法将天台县2011-2018年HV抗原阳性的鼠肺标本超声后提取核酸,利用HV型特异性引物,应用巢式PCR对部分M片段进行扩增分型和序列测定,将天台县2011-2018年的HV序列与国内外其他已知的HV序列进行比较,以明确该地区的基因型别,分析病毒的进化变异情况.结果HV抗原阳性的67份鼠肺标本经型特异性引物巢式PCR扩增后31份标本为阳性,其中30份为汉滩病毒(HTNV)、1份为汉城病毒(SEOV),31份PCR阳性鼠肺均来自黑线姬鼠.31份巢式PCR阳性产物的部分M片段核苷酸序列有30株分布在HTNV单元群,1株分布在SEOV单元群.HTNV单元群中的天台T2018-130株与天台其余29株及国内外其他株同源性为84.8%~87.9%,差异较大,天台其余29株亲缘关系较近;SEOV发生群中的T2016-31株来自黑线姬鼠的鼠肺标本,与SEOV天台以往分离株ZT71株、ZT10株和浙江温州分离株Z37株在系统发生树上分布于同一或临近分支.结论浙江省天台县HV流行的主要型别HTNV基因表现出明显的地理聚集现象,但也存在着基因差异较大的变异株T2018-130株;同时从病毒基因序列分析证实SEOV T2016-31株存在于黑线姬鼠中,可能意味着在SEOV进化过程中病毒在宿主间发生了“溢出”现象.
关键词
汉坦病毒
基因型
进化变异
流行特征
Keywords
Hantavirus
Genotype
Gene variation
Epidemiological characteristic
分类号
R51 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
浙江省天台县2011-2018年汉坦病毒基因型别和进化变异研究
姚苹苹
陈钢
徐芳
杨章女
陈晨
孙一晟
卢杭景
庞卫龙
张云
朱函坪
项海青
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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