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浙江省天台县2011-2018年汉坦病毒基因型别和进化变异研究 被引量:5
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作者 姚苹苹 陈钢 +8 位作者 徐芳 杨章女 陈晨 孙一晟 卢杭景 庞卫龙 张云 朱函坪 项海青 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1285-1290,共6页
目的研究2011-2018年肾综合征出血热(HFRS)国家监测点浙江省天台县汉坦病毒(HV)的基因型别和进化变异情况,了解天台县HV分子流行病学特点.方法将天台县2011-2018年HV抗原阳性的鼠肺标本超声后提取核酸,利用HV型特异性引物,应用巢式PCR... 目的研究2011-2018年肾综合征出血热(HFRS)国家监测点浙江省天台县汉坦病毒(HV)的基因型别和进化变异情况,了解天台县HV分子流行病学特点.方法将天台县2011-2018年HV抗原阳性的鼠肺标本超声后提取核酸,利用HV型特异性引物,应用巢式PCR对部分M片段进行扩增分型和序列测定,将天台县2011-2018年的HV序列与国内外其他已知的HV序列进行比较,以明确该地区的基因型别,分析病毒的进化变异情况.结果HV抗原阳性的67份鼠肺标本经型特异性引物巢式PCR扩增后31份标本为阳性,其中30份为汉滩病毒(HTNV)、1份为汉城病毒(SEOV),31份PCR阳性鼠肺均来自黑线姬鼠.31份巢式PCR阳性产物的部分M片段核苷酸序列有30株分布在HTNV单元群,1株分布在SEOV单元群.HTNV单元群中的天台T2018-130株与天台其余29株及国内外其他株同源性为84.8%~87.9%,差异较大,天台其余29株亲缘关系较近;SEOV发生群中的T2016-31株来自黑线姬鼠的鼠肺标本,与SEOV天台以往分离株ZT71株、ZT10株和浙江温州分离株Z37株在系统发生树上分布于同一或临近分支.结论浙江省天台县HV流行的主要型别HTNV基因表现出明显的地理聚集现象,但也存在着基因差异较大的变异株T2018-130株;同时从病毒基因序列分析证实SEOV T2016-31株存在于黑线姬鼠中,可能意味着在SEOV进化过程中病毒在宿主间发生了“溢出”现象. 展开更多
关键词 汉坦病毒 基因型 进化变异 流行特征
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