汉坦病毒与宿主线粒体D-loop和cyt b基因共进化分析

目的比较汉坦病毒(HV)抗原阳性和阴性的宿主动物线粒体D环区(D-loop)和细胞色素b(Cyt b)基因序列变化及与HV共进化的关系。方法采用直接免疫荧光法检测715份宿主动物鼠肺HV感染情况,提取HV抗原阳性和阴性黑线姬鼠鼠肺组织总DNA,应用聚合酶链反应(PCR)扩增宿主动物线粒体的D-loop和Cyt b基因,PCR产物纯化后测定序列,应用Clustal X生物学软件进行多重序列同源性分析,M ega软件绘制系统发生树进行分析比较。结果 HV抗原检测阳性和阴性鼠的遗传距离较小,阳性和阴性鼠的D-loop和Cyt b基因均有分布在同一个分支上。结论 HV感染与否与宿主线粒体基因无直接联系。