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HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值
1
作者
纪凯
于冠宇
+5 位作者
周乐其
张天帅
凌潜龙
满文江
朱冰
张卫
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期1685-1695,共11页
目的通过生物信息学和细胞实验探究HNRNP A1在结直肠癌中的临床意义及其在肿瘤组织中的表达情况。方法使用HPA、TIMER和GEPIA数据库,分析HNRNP A1在结直肠癌组织中的表达水平,并检验HNRNP A1与Ki-67/VEGFA在结直肠癌中表达的相关性。使...
目的通过生物信息学和细胞实验探究HNRNP A1在结直肠癌中的临床意义及其在肿瘤组织中的表达情况。方法使用HPA、TIMER和GEPIA数据库,分析HNRNP A1在结直肠癌组织中的表达水平,并检验HNRNP A1与Ki-67/VEGFA在结直肠癌中表达的相关性。使用Kaplan-Meier Plotter数据库评估HNRNP A1 mRNA水平与结直肠癌患者生存率之间的联系。通过基因富集途径分析,预测HNRNP A1在结直肠癌中的潜在生物学作用。通过免疫组织化学(IHC)和Western blotting技术检测HNRNP A1在结直肠癌及其癌旁组织中的蛋白表达。利用TIMER数据库网站对HNRNP A1在免疫浸润细胞中的表达进行预测。使用慢病毒敲低RKO/Caco2细胞中HNRNP A1的表达;通过CCK-8实验检测细胞增殖,使用克隆形成实验检测HNRNP A1对细胞增殖能力的影响;利用细胞划痕实验和Transwell迁移实验评估两组细胞(RKO/Caco2-nc、RKO/Caco2-sh)的迁移能力。最后验证HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)对肿瘤细胞增殖的影响。结果在结直肠癌(CRC)肿瘤组织中HNRNP A1的表达显著上调并与患者的不良预后显著相关(P<0.01)。TIMER数据库的分析结果指出,HNRNP A1与肿瘤微环境中的免疫细胞之间存在一定的相关性。根据GEPIA数据库的分析,CRC组织中HNRNP A1、MKI67和VEGFA的表达均较高(P<0.05),且HNRNP A1与这两者之间存在正相关关系。通过Kaplan-Meier Plotter进行的生存分析表明,在CRC中,HNRNP A1的高表达预示着较差的总生存期(P=0.0081)和无进展生存期(P=0.012)。基因富集通路分析的数据显示,HNRNP A1可能参与到多个与CRC进展相关的生物途径中。HNRNP A1影响RKO/Caco2细胞的增殖和迁移能力,对照组(RKO/Caco2-nc)的增殖能力、克隆形成能力和迁移能力均优于实验组(RKO/Caco2-sh),差异有统计学意义(P<0.05);HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)可以有效抑制结直肠癌增殖活性,并具有时间和浓度依赖性;IHC显示HNRNP A1在结直肠癌中高表达,且与肿瘤分期有密切关系(P<0.0001)。结论HNRNP A1基因在CRC组织中表达较高,并可调节细胞的增殖和迁移能力,与不良预后密切相关,同时HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)也可以抑制结直肠癌细胞的增殖,因而可作为CRC治疗过程中新的潜在治疗靶点。
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关键词
结直肠癌
HNRNP
A1
增殖与转移
预后
生物信息学
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职称材料
SPHK1靶向NF-κB信号通路调控胃癌细胞的迁移与侵袭
2
作者
凌潜龙
纪凯
+4 位作者
陈金业
管佳佳
王睿朋
满文江
朱冰
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期2163-2171,共9页
目的探讨鞘氨醇激酶-1(SPHK1)在胃癌(GC)组织中的表达及其靶向核因子-κB(NF-κB)调控GC细胞迁移和侵袭能力的分子机制。方法基于TIMER2.0、GEPIA与HPA数据库分析SPHK1在GC组织中的表达。使用Kaplan-Meier Plotter数据库预测SPHK1与GC...
目的探讨鞘氨醇激酶-1(SPHK1)在胃癌(GC)组织中的表达及其靶向核因子-κB(NF-κB)调控GC细胞迁移和侵袭能力的分子机制。方法基于TIMER2.0、GEPIA与HPA数据库分析SPHK1在GC组织中的表达。使用Kaplan-Meier Plotter数据库预测SPHK1与GC患者预后的关联。利用IHC检测GC及癌旁组织中SPHK1和MKI67的表达并分析两者相关性。运用Western blotting与qRT-PCR检测GC各细胞系中SPHK1蛋白及mRNA水平。基因富集通路数据库检索SPHK1对GC进展的生物学功能。使用慢病毒敲低HGC-27/过表达MGC-803细胞中SPHK1的表达;采用细胞划痕实验探究SPHK1对GC细胞迁移能力的影响;Transwell实验探究SPHK1对GC细胞迁移和侵袭能力的作用;通过Western blotting检测各蛋白表达情况。体内成瘤实验中,将裸鼠随机分为shNC组、shSPHK1组、oeNC组与oeSPHK1组,利用稳转株验证SPHK1的促癌作用。结果生物信息学表明SPHK1在GC组织中显著高表达(P<0.001);同时高表达的SPHK1预示着较差的总生存期(P<0.001)和进展后总生存期(P<0.001)以及更差的无复发生存期(P<0.001)。IHC结果表明GC组织中SPHK1与MKI67表达明显上调(P<0.001)且呈正相关(P<0.001)。基因富集通路数据库提示,SPHK1参与GC中的细胞黏附、迁移及血管生成等,且NF-κB参与GC进展(P<0.05)。细胞实验数据显示,抑制SPHK1减弱GC细胞的迁移和侵袭能力,而过表达SPHK1会产生相反的结果(P<0.01);SPHK1正向调节磷酸化P65(p-P65)、血管内皮生长因子(VEGFA)和白细胞介素(IL-17)蛋白表达(P<0.05);利用PDTC阻断NF-κB信号通路可削弱SPHK1促进的GC细胞迁移与侵袭能力以及各蛋白表达水平(P<0.01);动物实验表明,与NC组相比,shSPHK1组肿瘤大小和质量明显减小,而oeSPHK1组显著增加(P<0.001)。结论SPHK1可靶向NF-κB信号通路表达进而调控GC细胞的迁移与侵袭,提示SPHK1可能是GC进展的潜在诊断分子标志物。
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关键词
胃癌
鞘氨醇激酶-1
NF-ΚB
迁移
侵袭
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职称材料
题名
HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值
1
作者
纪凯
于冠宇
周乐其
张天帅
凌潜龙
满文江
朱冰
张卫
机构
蚌埠医科
大学
第一
附属
医院
胃
肠
外科
海军军医大学第一附属医院//上海长海医院肛肠外科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期1685-1695,共11页
基金
国家自然科学基金(82072750)
安徽省高校科学研究重大项目(KJ2021ZD0090)
+2 种基金
促进市级医院临床技能与临床创新三年行动计划-研究型医师创新转化能力培训项目(SHDC2022CRT007)
蚌埠医学院研究生科研创新项目(Byycx22090)
安徽省2023年度新时代育人省级质量工程项目(2023xscx125)。
文摘
目的通过生物信息学和细胞实验探究HNRNP A1在结直肠癌中的临床意义及其在肿瘤组织中的表达情况。方法使用HPA、TIMER和GEPIA数据库,分析HNRNP A1在结直肠癌组织中的表达水平,并检验HNRNP A1与Ki-67/VEGFA在结直肠癌中表达的相关性。使用Kaplan-Meier Plotter数据库评估HNRNP A1 mRNA水平与结直肠癌患者生存率之间的联系。通过基因富集途径分析,预测HNRNP A1在结直肠癌中的潜在生物学作用。通过免疫组织化学(IHC)和Western blotting技术检测HNRNP A1在结直肠癌及其癌旁组织中的蛋白表达。利用TIMER数据库网站对HNRNP A1在免疫浸润细胞中的表达进行预测。使用慢病毒敲低RKO/Caco2细胞中HNRNP A1的表达;通过CCK-8实验检测细胞增殖,使用克隆形成实验检测HNRNP A1对细胞增殖能力的影响;利用细胞划痕实验和Transwell迁移实验评估两组细胞(RKO/Caco2-nc、RKO/Caco2-sh)的迁移能力。最后验证HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)对肿瘤细胞增殖的影响。结果在结直肠癌(CRC)肿瘤组织中HNRNP A1的表达显著上调并与患者的不良预后显著相关(P<0.01)。TIMER数据库的分析结果指出,HNRNP A1与肿瘤微环境中的免疫细胞之间存在一定的相关性。根据GEPIA数据库的分析,CRC组织中HNRNP A1、MKI67和VEGFA的表达均较高(P<0.05),且HNRNP A1与这两者之间存在正相关关系。通过Kaplan-Meier Plotter进行的生存分析表明,在CRC中,HNRNP A1的高表达预示着较差的总生存期(P=0.0081)和无进展生存期(P=0.012)。基因富集通路分析的数据显示,HNRNP A1可能参与到多个与CRC进展相关的生物途径中。HNRNP A1影响RKO/Caco2细胞的增殖和迁移能力,对照组(RKO/Caco2-nc)的增殖能力、克隆形成能力和迁移能力均优于实验组(RKO/Caco2-sh),差异有统计学意义(P<0.05);HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)可以有效抑制结直肠癌增殖活性,并具有时间和浓度依赖性;IHC显示HNRNP A1在结直肠癌中高表达,且与肿瘤分期有密切关系(P<0.0001)。结论HNRNP A1基因在CRC组织中表达较高,并可调节细胞的增殖和迁移能力,与不良预后密切相关,同时HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)也可以抑制结直肠癌细胞的增殖,因而可作为CRC治疗过程中新的潜在治疗靶点。
关键词
结直肠癌
HNRNP
A1
增殖与转移
预后
生物信息学
Keywords
colorectal cancer
HNRNP A1
proliferation and metastasis
prognosis
bioinformatics
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
SPHK1靶向NF-κB信号通路调控胃癌细胞的迁移与侵袭
2
作者
凌潜龙
纪凯
陈金业
管佳佳
王睿朋
满文江
朱冰
机构
蚌埠医科
大学
第一
附属
医院
胃
肠
外科
安徽省第二人民
医院
外科
海军军医大学第一附属医院//上海长海医院肛肠外科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期2163-2171,共9页
基金
安徽省高校科学研究重大项目(KJ2021ZD0090)
蚌埠医学院研究生科研创新项目(Byycx22090)
安徽省2023年度新时代育人质量工程(研究生教育)项目(2023xscx125)。
文摘
目的探讨鞘氨醇激酶-1(SPHK1)在胃癌(GC)组织中的表达及其靶向核因子-κB(NF-κB)调控GC细胞迁移和侵袭能力的分子机制。方法基于TIMER2.0、GEPIA与HPA数据库分析SPHK1在GC组织中的表达。使用Kaplan-Meier Plotter数据库预测SPHK1与GC患者预后的关联。利用IHC检测GC及癌旁组织中SPHK1和MKI67的表达并分析两者相关性。运用Western blotting与qRT-PCR检测GC各细胞系中SPHK1蛋白及mRNA水平。基因富集通路数据库检索SPHK1对GC进展的生物学功能。使用慢病毒敲低HGC-27/过表达MGC-803细胞中SPHK1的表达;采用细胞划痕实验探究SPHK1对GC细胞迁移能力的影响;Transwell实验探究SPHK1对GC细胞迁移和侵袭能力的作用;通过Western blotting检测各蛋白表达情况。体内成瘤实验中,将裸鼠随机分为shNC组、shSPHK1组、oeNC组与oeSPHK1组,利用稳转株验证SPHK1的促癌作用。结果生物信息学表明SPHK1在GC组织中显著高表达(P<0.001);同时高表达的SPHK1预示着较差的总生存期(P<0.001)和进展后总生存期(P<0.001)以及更差的无复发生存期(P<0.001)。IHC结果表明GC组织中SPHK1与MKI67表达明显上调(P<0.001)且呈正相关(P<0.001)。基因富集通路数据库提示,SPHK1参与GC中的细胞黏附、迁移及血管生成等,且NF-κB参与GC进展(P<0.05)。细胞实验数据显示,抑制SPHK1减弱GC细胞的迁移和侵袭能力,而过表达SPHK1会产生相反的结果(P<0.01);SPHK1正向调节磷酸化P65(p-P65)、血管内皮生长因子(VEGFA)和白细胞介素(IL-17)蛋白表达(P<0.05);利用PDTC阻断NF-κB信号通路可削弱SPHK1促进的GC细胞迁移与侵袭能力以及各蛋白表达水平(P<0.01);动物实验表明,与NC组相比,shSPHK1组肿瘤大小和质量明显减小,而oeSPHK1组显著增加(P<0.001)。结论SPHK1可靶向NF-κB信号通路表达进而调控GC细胞的迁移与侵袭,提示SPHK1可能是GC进展的潜在诊断分子标志物。
关键词
胃癌
鞘氨醇激酶-1
NF-ΚB
迁移
侵袭
Keywords
gastric cancer
sphingosine kinase-1
NF-κB
migration
invasion
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
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被引量
操作
1
HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值
纪凯
于冠宇
周乐其
张天帅
凌潜龙
满文江
朱冰
张卫
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
SPHK1靶向NF-κB信号通路调控胃癌细胞的迁移与侵袭
凌潜龙
纪凯
陈金业
管佳佳
王睿朋
满文江
朱冰
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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