海南省澄迈县人群G6PD缺乏症基因突变分析

目的分析海南省澄迈县人群葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症(G6PD)的发病率及基因突变类型。方法用Zinkham法对1 299例(男650例,女649例)标本进行G6PD缺乏筛查;用多色探针荧光PCR熔解曲线法对初筛的阳性标本进行中国人常见的16种G6PD基因突变类型检测,对未检出突变的标本进行外显子测序。结果澄迈县人群的G6PD缺乏症总发生率为5.54%(72/1 299),其中男性发生率为6.62%(43/650),女性发生率为4.47%(29/649)。72例阳性标本中有61例检测出有突变,共检出6种基因点突变,含24例1 376 G>T(33.33%),19例1 388 G>A(26.39%),4例95 A>G(5.56%),6例1 024 C>T(8.33%),4例392 G>T(5.56%),3例871 G>A(4.17%),1例1 376 G>T复合1 388 G>A突变(1.39%)。未检出突变的11例(15.28%)标本经外显子测序未发现新突变。结论澄迈县G6PD缺乏症发生率高,以1 376 G>T和1 388 G>A突变基因型为主。

人Mcl-1基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在1700、1147、368和32个可能的转录因子结合位点,包含Arid3a,Atoh1,ETV6,Gata1,GATA3,KLF5,LMX1A,LMX1B,MZF1,Prrx2,SPI1,TBX4,USF1,YY1,ZEB1等。结论:人Mcl-1基因5'调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与肿瘤发生,红细胞生成及神经发育等有关。

人Sirt6基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

目的:对人Sirt6基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Sirt6基因5’调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在939、276、70和9个可能的转录因子结合位点,包含Ahr、SPIB、Pdx1、Prrx2、MZF1、Mafb和KLF5等。结论:人Sirt6基因5’调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与免疫系统调节、肿瘤发生和代谢调节等有关。

人G6PD基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

目的:对人G6PD基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人G6PD基因5’调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:获得人G6PD基因5’调控区序列2200 bp(-2000^+200 bp)。Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在805、258、66和17个可能的转录因子结合位点,包含Maf G、Pdx1、Prrx2、MZF1、SPIB、KLF5和SP1等因子。结论:人G6PD基因5’调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与胰腺发育、肿瘤发生和氧化应激有关。

人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析

目的：探讨人Daintain基因5’调控区的序列特征。方法：利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter2．0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TFSEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点。结果：人Daintain基因5’调控区存在1个CAAT盒。Daintain基因可能存在6个启动子位点，CpG岛可能位于216bp区间（23～238bp）。评分85分以上时，该序列存在251个可能的转录因子结合位点；评分90分以上时，该序列存在70个可能的转录因子结合位点；评分95分以上时，该序列存在16个可能的转录因子结合位点；评分100分以上时，该序列存在7个可能的转录因子结合位点；这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论：人Daintain基因5’调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控，为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础。

过表达Daintain促进RAW264.7细胞增殖和吞饮功能

[目的]研究过表达Daintain对巨噬细胞RAW264.7增殖和吞饮功能的影响。[方法]培养RAW264.7细胞,脂质体法导入过表达Daintain的质粒(pc DNA-DT)和空质粒(pc DNA),经G418筛选单克隆细胞株。Western Blot检测稳定转染细胞株中Daintain的表达,MTT法检测Daintain过表达对RAW264.7细胞增殖的影响,中性红染色法检测Daintian过表达对LPS诱导的RAW264.7细胞吞饮功能的影响。[结果]1对比转染pc DNA质粒的细胞株,转染pc DNA-DT质粒的细胞株中Daintian表达量增加28.7%,说明成功建立稳定过表达Daintian的RAW264.7细胞株;2在48h和72h,相对转染pc DNA的细胞株,转染pc DNA-DT的细胞株增殖明显增强;3在0.1和1μg/m L LPS诱导下,相对转染pc DNA的细胞株,转染pc DNA-DT的细胞株的吞饮作用增强。[结论]过表达Daintain促进RAW264.7细胞增殖和吞饮功能。