基于SRAP技术的姜科植物遗传多样性分析

为姜科植物资源的保护与利用提供科学依据,以采自海南岛内的11种姜科样品为材料,采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术对基因组进行提取与扩增,并分析其遗传多样性。结果表明:姜科植物提取的DNA条带明显清晰、未见降解、质量良好;SRAPPCR扩增共获得条带59条,均为多态性条带,多态性比率均为100%;姜科植物的遗传相似系数在0.500 0~0.838 4,其中草豆蔻与大苞闭鞘姜、海南砂仁与皱叶山姜、红豆蔻与光叶山姜、阳春砂与阳荷两两间遗传相似系数最大,均为0.838 4,表明其亲缘关系最近;在遗传相似系数0.500 0处,11种姜科药用植物分为两大类,Ⅰ类包括益智、草豆蔻、大苞闭鞘姜、海南砂仁和皱叶山姜,Ⅱ类包括红豆蔻、光叶山姜、高良姜、阳春砂、阳荷和爪哇白豆蔻。

改进TRIzol法提取不同发育时期海葵的总RNA

获得海葵纯度高、完整性好的高质量RNA,为海葵高通量转录组测序等分子生物学的深入研究提供基础,以南海海葵为研究对象,采用改进TRIzol法提取不同发育时期海葵的总RNA,并利用琼脂糖凝胶电泳、Nano Drop TM 2000分光光度计和Agilent 2100生物分析仪检测其质量。结果表明:改进TRIzol法从不同发育时期的海葵中提取的RNA电泳条带清晰、海葵-大与海葵-中的RNA完整性好,海葵-小RNA完整性不合格;海葵-大、海葵-中和海葵-小的纯度(OD260/280)分别为1.981、1.983和2.071,浓度分别为335ng/μL、357ng/μL和232ng/μL。改进TRIzol法可有效从海葵中提取高质量RNA。