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杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析
1
作者
夏煜琪
孙宇
+4 位作者
刘志鑫
孙瑞青
杨楠
蒲金基
张贺
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期984-994,共11页
BES1/BZR1是植物中特有的一类转录因子且是油菜素内酯(BR)信号转导途径的唯一转录因子,为探讨其在植物抗病抗逆反应中的作用,本研究通过运用生物信息学研究方法分析了杧果BES1s家族成员的理化性质、结构域、蛋白质结构和在不同胁迫条件...
BES1/BZR1是植物中特有的一类转录因子且是油菜素内酯(BR)信号转导途径的唯一转录因子,为探讨其在植物抗病抗逆反应中的作用,本研究通过运用生物信息学研究方法分析了杧果BES1s家族成员的理化性质、结构域、蛋白质结构和在不同胁迫条件下的基因表达。研究表明,杧果BES1s家族理化性质预测结果显示,成员外显子个数相差较大;结构域预测结果显示,杧果BES1s成员均具有BES1_N结构域;系统进化分析和二级结构表明,成员可分成3组,不同组之间成员存在较大差异、蛋白质三级结构预测结果显示,存在3种结构。在qRT-PCR法测定基因表达量中发现,在胶孢炭疽菌(Cg)侵染过程中MiBES1.1和MiBES1.5持续上调表达;MiBES1.12和MiBES1.13持续下调表达。在细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,在12 h时除MiBES1.7和MiBES1.9,其他成员上调表达;在3 h时MiBES1.1~MiBES1.5和MiBES1.11下调表达。在茉莉酸甲酯(MeJA)处理过程中,MiBES1.7、MiBES1.9和MiBES1.2持续下调表达;在48 h时,除MiBES1.5和MiBES1.11~MiBES1.13其他成员下调表达。本研究结果可为杧果BES1s家族成员基因的功能研究提供依据。
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关键词
转录因子
杧果
生物信息学
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职称材料
题名
杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析
1
作者
夏煜琪
孙宇
刘志鑫
孙瑞青
杨楠
蒲金基
张贺
机构
海南大学植物保护学院热带作物学院
中国
热带
农业科
学院
环境与
植物保护
研究所/农业农村部
热带作物
有害生物综合治理重点实验室
中国
热带
农业科
学院
热带
生物技术研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期984-994,共11页
基金
国家重点研发计划(2019YFD1000504)
中国热带农业科学院基本科研业务费(1630032022007)
杧果病虫害监测与防治项目。
文摘
BES1/BZR1是植物中特有的一类转录因子且是油菜素内酯(BR)信号转导途径的唯一转录因子,为探讨其在植物抗病抗逆反应中的作用,本研究通过运用生物信息学研究方法分析了杧果BES1s家族成员的理化性质、结构域、蛋白质结构和在不同胁迫条件下的基因表达。研究表明,杧果BES1s家族理化性质预测结果显示,成员外显子个数相差较大;结构域预测结果显示,杧果BES1s成员均具有BES1_N结构域;系统进化分析和二级结构表明,成员可分成3组,不同组之间成员存在较大差异、蛋白质三级结构预测结果显示,存在3种结构。在qRT-PCR法测定基因表达量中发现,在胶孢炭疽菌(Cg)侵染过程中MiBES1.1和MiBES1.5持续上调表达;MiBES1.12和MiBES1.13持续下调表达。在细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,在12 h时除MiBES1.7和MiBES1.9,其他成员上调表达;在3 h时MiBES1.1~MiBES1.5和MiBES1.11下调表达。在茉莉酸甲酯(MeJA)处理过程中,MiBES1.7、MiBES1.9和MiBES1.2持续下调表达;在48 h时,除MiBES1.5和MiBES1.11~MiBES1.13其他成员下调表达。本研究结果可为杧果BES1s家族成员基因的功能研究提供依据。
关键词
转录因子
杧果
生物信息学
Keywords
transcription factor
mango
bioinformatics
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析
夏煜琪
孙宇
刘志鑫
孙瑞青
杨楠
蒲金基
张贺
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2022
0
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