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基于rbcL和tufA基因的石莼和浒苔系统发育分析
被引量:
5
1
作者
姜芳燕
杨宁
+2 位作者
菅盼盼
马军
黄海
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期3012-3018,共7页
本研究对海南沿岸采集到石莼(Ulva sp.)和浒苔(Enteromorpha sp.)的rbc L和tuf A基因序列进行PCR扩增并测序,并从Gen Bank下载16种绿藻的rbc L基因序列和tuf A基因序列,排序后的18种绿藻的rbc L基因长度为680 bp,变异位点416个,保...
本研究对海南沿岸采集到石莼(Ulva sp.)和浒苔(Enteromorpha sp.)的rbc L和tuf A基因序列进行PCR扩增并测序,并从Gen Bank下载16种绿藻的rbc L基因序列和tuf A基因序列,排序后的18种绿藻的rbc L基因长度为680 bp,变异位点416个,保守位点为264个。序列中C+G的含量为40.4%,说明浒苔属和石莼属的rbc L序列的(C+G)%值较低。而排序后的18种绿藻的tuf A基因长度为582 bp,变异位点122个,保守位点为460个。序列中C+G的含量为33.1%,说明浒苔属和石莼属的tuf A序列的(C+G)%值较低。利用NJ法以rbc L和tuf A序列构建的系统进化树表明,浒苔属和石莼属的物种并未聚类成各自独立的进化枝,而是存在明显的属间交叉分布现象。
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关键词
石莼
浒苔
RBCL
TUFA
系统进化
原文传递
题名
基于rbcL和tufA基因的石莼和浒苔系统发育分析
被引量:
5
1
作者
姜芳燕
杨宁
菅盼盼
马军
黄海
机构
海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室
三亚市南繁科学技术研究院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期3012-3018,共7页
基金
三亚市专项科研试制项目(2014CZ14)
国家(省)重点科技项目三亚市配套资金(2014PT13)
海南省自然科学基金(20163071)共同资助
文摘
本研究对海南沿岸采集到石莼(Ulva sp.)和浒苔(Enteromorpha sp.)的rbc L和tuf A基因序列进行PCR扩增并测序,并从Gen Bank下载16种绿藻的rbc L基因序列和tuf A基因序列,排序后的18种绿藻的rbc L基因长度为680 bp,变异位点416个,保守位点为264个。序列中C+G的含量为40.4%,说明浒苔属和石莼属的rbc L序列的(C+G)%值较低。而排序后的18种绿藻的tuf A基因长度为582 bp,变异位点122个,保守位点为460个。序列中C+G的含量为33.1%,说明浒苔属和石莼属的tuf A序列的(C+G)%值较低。利用NJ法以rbc L和tuf A序列构建的系统进化树表明,浒苔属和石莼属的物种并未聚类成各自独立的进化枝,而是存在明显的属间交叉分布现象。
关键词
石莼
浒苔
RBCL
TUFA
系统进化
Keywords
Ulva sp.
Enteromorpha sp.
rbcL
tufa
Phylogenetic/analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于rbcL和tufA基因的石莼和浒苔系统发育分析
姜芳燕
杨宁
菅盼盼
马军
黄海
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
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