基于线粒体16S rRNA探讨渤海海区矮拟帽贝的种群生态遗传

采用聚合酶链式反应和直接测序的方法研究了渤海海区15个矮拟帽贝Patelloida pygmaea种群遗传多样性与环境因子的关系。180个个体的16S rRNA部分序列(615 bp)共发现264个多态性位点,153个转换,114个颠换,界定32个单倍型。所有个体碱基含量依次为C(18.12%)、T(27.74%)、A(33.07%)、G(21.07%);单倍型多样性为0.835 1±0.019 1,核苷酸多样性为0.449±0.214。矮拟帽贝大陆沿岸种群核苷酸多样性(0.191 8±0.091 7)高于岛屿种群(0.107 3±0.081 6)。种群历史动态结果显示,矮拟帽贝经历了种群近期扩张。与环境因子相关性研究发现,遗传距离、序列变异、核苷酸多样性与日照时数、日照百分率分别呈显著正相关(P<0.05);形态相关分析结果表明,变异主成分(壳长、壳宽)与年均降水量呈显著负相关(P<0.05);年均降水量、日照时数、日照百分率是影响矮拟帽贝形态变异、遗传多样性的主导因子,环境越稳定地区种群的遗传多样性越高。

基于RNA-seq技术的北草蜥转录组中SSR位点信息分布

北草蜥(Takydromus septentrionalis)是蜥蜴科草蜥属的一种爬行动物,为中国特有种,分布广泛。不同分布种群的北草蜥的体色存在差别。为了获得北草蜥皮肤组织内的简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,以备后续对其不同生境中的体色进行差异性分析,基于转录组测序(RNAseq)组装了417190条转录本序列,合计全长479055094 bp。共识别到60968个SSR位点,含有SSR位点的转录本数目为56456条,占总转录本数目的13.53%。其中:有1个以上的SSR位点的Unigenes有10644个,存在复合形式SSR位点的数量有4513个。在SSR位点中包含1~6个核苷酸重复的所有类型,不同核苷酸重复类型的含量差异较大。单核苷酸重复型有27028个(44.33%);2核苷酸重复型和3核苷酸重复型分别有17876个(29.31%)和13332个(21.87%);4~6核苷酸重复型含量极少,位点总数占比只有4.48%。其中:4核苷酸重复型有2580个(4.23%),5核苷酸重复型和6核苷酸重复型分别只有112个(0.18%)和40个(0.07%)。从整体上看,在北草蜥转录组中,平均约7.86 kb出现1个SSR位点。

平颏海蛇毒鼠源单链抗体噬菌体展示文库的构建

为了研发新型小分子类抗海蛇毒药物,本研究利用平颏海蛇(Hydrophis curtus)毒免疫成年小鼠,使其产生免疫应答,以小鼠的脾脏总RNA为基础,反转录构建cDNA文库,分别扩增抗体轻链和重链可变区片段并通过重叠延伸PCR技术构建平颏海蛇毒小鼠单链抗体基因.构建完成后,该基因随后被成功重组至噬菌体,并利用大肠杆菌原核表达系统建立了单链抗体噬菌体展示文库.经多轮富集后,最终获得弱阳性克隆.本研究获得了一套构建平颏海蛇毒鼠源单链抗体噬菌体文库并筛选阳性克隆的方案.

两种国产海蛇排毒量的种间差异及形态相关性

以青环海蛇(Hydrophis cyanocinctus)和平颏海蛇(Hydrophis curtus)为实验对象,探讨2种海蛇排毒量的种间差异及与形态特征的关系。研究结果显示,2种海蛇头体长(SVL)频次分布均符合正态分布且无显著性别差异,青环海蛇的SVL大于平颏海蛇。雄性青环海蛇的尾长(TL)显著大于雌性,而头长(HL)和头宽(HW)无性别差异;雌性平颏海蛇的HW显著大于雄性,而TL和HL无性别差异。2种海蛇的TL、HL和HW存在显著的种间差异。青环海蛇雌性和雄性排毒量的鲜质量、干质量和干物质含量分别为43.18 mg和33.36 mg、9.14 mg和8.05 mg、21.51%和25.01%,平颏海蛇雌性和雄性排毒量的鲜质量、干质量和干物质含量分别为33.16 mg和34.71 mg、4.40 mg和5.30 mg、13.30%和15.05%。2种海蛇排毒量的鲜质量、干质量和干物质含量无性别差异。2种海蛇的SVL、HL与排毒量鲜质量、干质量存在显著的正相关;青环海蛇HW与排毒量鲜质量存在正相关,但与干质量无显著性相关;平颏海蛇HW与排毒量鲜质量无关,但与干质量呈负相关;2种海蛇SVL、HL与干物质含量无关,但HW与干质量呈负相关。2种海蛇排毒量鲜质量、干质量和干物质含量存在显著的种间差异。本研究初步阐明了2种海蛇的排毒量特征及其形态相关性,为海蛇咬伤的临床诊疗、抗海蛇毒血清的研制及蛇毒天然活性药物的开发提供参考。