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基于网络药理学和分子对接研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的作用机制
1
作者
陈劲果
王定国
+2 位作者
邢益涛
王之仕
黄卫
《中国性科学》
2024年第5期122-126,共5页
目的采用网络药理学和分子对接方法研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP及文献筛选桃核承气汤有效活性成分及作用靶点,并采用UniProt数据库将蛋白靶点转换为基因名称。从GeneCard和...
目的采用网络药理学和分子对接方法研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP及文献筛选桃核承气汤有效活性成分及作用靶点,并采用UniProt数据库将蛋白靶点转换为基因名称。从GeneCard和CTD数据库获取慢性前列腺炎的相关疾病靶点,与桃核承气汤作用靶点取交集,获得交集基因。将交集基因提交至STRING数据库获得蛋白互作关系,利用Cytoscape软件绘制蛋白互作网络并采用CytoNCA插件筛选核心蛋白。采用R软件进行KEGG信号通路富集分析。借助PubChem数据库、Chem3D软件、PDB数据库、PyMOL软件、AutoDockTools软件及Vina软件对活性成分与关键靶点进行分子对接。结果桃核承气汤共有136种有效活性成分,作用靶点与疾病靶点有154个交集靶点,去除不含交集靶点的活性成分,最终筛选得到120种活性成分。蛋白互作分析得到蛋白激酶B(AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)1、信号传导和转录激活因子3(STAT3)、MAPK3等15种核心蛋白,通路富集分析得到肿瘤坏死因子(TNF)、MAPK、酪氨酸激酶-信号转导和转录激活因子(JAK-STAT)、磷酯酰肌醇3激酶(PI3K)-AKT、核因子-κB(NF-κB)等31条与慢性前列腺炎相关的通路。分子对接显示活性成分与关键靶点具有良好的结合能力。结论桃核承气汤治疗慢性前列腺炎涉及多种中药活性成分、多个作用靶点及多条信号通路。
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关键词
桃核承气汤
慢性前列腺炎
网络药理学
分子对接
作用机制
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题名
基于网络药理学和分子对接研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的作用机制
1
作者
陈劲果
王定国
邢益涛
王之仕
黄卫
机构
海南省中医院
(
海南医学院
附属
中医院
)
泌
尿
外科
出处
《中国性科学》
2024年第5期122-126,共5页
基金
海南省自然科学基金青年基金项目(823QN356)
海南省自然科学基金高层次人才项目(821RC720)。
文摘
目的采用网络药理学和分子对接方法研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP及文献筛选桃核承气汤有效活性成分及作用靶点,并采用UniProt数据库将蛋白靶点转换为基因名称。从GeneCard和CTD数据库获取慢性前列腺炎的相关疾病靶点,与桃核承气汤作用靶点取交集,获得交集基因。将交集基因提交至STRING数据库获得蛋白互作关系,利用Cytoscape软件绘制蛋白互作网络并采用CytoNCA插件筛选核心蛋白。采用R软件进行KEGG信号通路富集分析。借助PubChem数据库、Chem3D软件、PDB数据库、PyMOL软件、AutoDockTools软件及Vina软件对活性成分与关键靶点进行分子对接。结果桃核承气汤共有136种有效活性成分,作用靶点与疾病靶点有154个交集靶点,去除不含交集靶点的活性成分,最终筛选得到120种活性成分。蛋白互作分析得到蛋白激酶B(AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)1、信号传导和转录激活因子3(STAT3)、MAPK3等15种核心蛋白,通路富集分析得到肿瘤坏死因子(TNF)、MAPK、酪氨酸激酶-信号转导和转录激活因子(JAK-STAT)、磷酯酰肌醇3激酶(PI3K)-AKT、核因子-κB(NF-κB)等31条与慢性前列腺炎相关的通路。分子对接显示活性成分与关键靶点具有良好的结合能力。结论桃核承气汤治疗慢性前列腺炎涉及多种中药活性成分、多个作用靶点及多条信号通路。
关键词
桃核承气汤
慢性前列腺炎
网络药理学
分子对接
作用机制
Keywords
Taohe Chengqi Decoction
Chronic prostatitis
Network pharmacology
Molecular docking
Effect mechanism
分类号
R275 [医药卫生—中医皮科]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于网络药理学和分子对接研究桃核承气汤治疗慢性前列腺炎的作用机制
陈劲果
王定国
邢益涛
王之仕
黄卫
《中国性科学》
2024
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