鱼类基因组研究进展

鱼类基因组研究利用大规模测序获取有关物种的基因组序列信息,进而阐明鱼类生物学特性、表型变异与基因组结构之间的关系,在鱼类的种质鉴定、遗传育种、动物营养、环境毒理和病害防治等领域具有巨大的应用潜力。自2001年首先对斑马鱼的基因组测序起,到目前为止已有近40个鱼类物种的全基因组测序完成,且其相关的生物学特征、遗传进化规律等得到较全面的解析。将从鱼类全基因组测序技术发展历程和鱼类基因组解析两大部分对鱼类基因组研究进展进行综述,旨在进一步了解鱼类基因组的研究现状、发展趋势和应用前景,为后续鱼类基因组研究提供参考。

鱼类褪黑素合成酶系编码基因的系统进化与生理功能

褪黑素是一种小分子神经递质,主要在脊椎动物的松果腺中合成与分泌,到达机体各部位来参与调控生物节律、生殖、生长与发育等生理过程。在鱼类中,松果腺是一个复合体,主要由类光感细胞构成,具有感光与内分泌双重功能。褪黑素的生物合成从色氨酸开始,涉及色氨酸羟化酶(TPH)、芳香族L-氨基酸脱羧酶(AAAD)、芳香烷胺-N-乙酰转移酶(AANAT)和乙酰色胺甲基转移酶(ASMT)。前期,我们通过对众多脊椎动物开展比较基因组学研究,发现这4个褪黑素合成酶系编码基因的系统进化与脊椎动物的物种进化基本一致,表明这些基因(同褪黑素一样)都很保守。有意思的是,在鱼类中各催化酶基因拷贝数出现显著增加,但四倍体与二倍体鱼中的拷贝数并不一定是2∶1,这是因为鱼类基因组复制后存在部分基因丢失的现象。此外,在大多数鱼类基因组中还鉴定到一些新基因,譬如aaad-like和asmt-like,可能拥有新的功能;有的催化酶基因缺失、出现移码突变或假基因化,可提升物种对特殊生境(诸如洞穴或深海)的生存适应性。本综述主要以我们团队近十年来的相关工作为主线,综合简介鱼类褪黑素合成酶系编码基因的系统进化与生理功能,以期深入理解褪黑素对鱼类生殖内分泌活动的影响,为进一步促进鱼类性腺发育、人工繁殖和分子育种等提供指导和支撑。

日本鳗鲡肌肉中风味氨基酸的多组学研究

鳗鱼是辐鳍鱼纲、鳗鲡目、鳗鲡科、鳗鲡属鱼的总称,又名河鳗、鳗鲡。全球约有鳗鱼20余种,比较常见的有欧洲鳗鲡(Anguilla anguilla)、美洲鳗鲡(Anguilla rostrata)、日本鳗鲡(Anguilla japonica)、鲈鳗(Anguilla mormorata)和澳洲鳗鲡(Anguilla australis)。

胎儿常见染色体非整倍体无创基因检测结果分析与遗传咨询

目的探讨无创基因检测技术在胎儿常见染色体非整倍体中的临床应用价值。方法应用高通量测序对7050份孕妇外周血浆进行胎儿21三体、18三体和13三体检测分析。结果7050份样本中，发现常染色体非整倍体阳性57例（0．81％），其中3例为假阳性，其余6993例阴性结果出生后随访，未发现21三体、18三体和13三体患儿。无创基因检测的敏感性为100％，特异性为99．96％。结论无创基因检测技术用于胎儿常染色体非整倍体的检测有较高的准确性，提高了产前筛查与诊断的效价比，降低了漏筛率。

中国正式启动水产生物“十百千”组学育种计划

2016年6月17日,中国水产科学研究院（Chinese Academy of Fishery Sciences,CAFS）和深圳华大水产科技有限公司（Shenzhen BGI Fisheries Sci＆Tech Co.Ltd.;BGI Fisheries）在中国深圳揭牌成立＂水产生物基因组研究中心＂,正式启动中国水产生物＂十百千＂组学育种计划（the China Aquatic 10-100-1000 Genomics Program,以下简称＂十百千＂计划）,