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拟南芥AGO基因家族分析及盐胁迫下的表达验证 被引量:9
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作者 岳路明 宋剑波 +4 位作者 徐晓峰 杨海奇 莫小为 宋军 莫蓓莘 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第4期352-357,共6页
argonaute(AGO)蛋白家族成员在小核糖核酸(RNA)介导的转录后调控中有重要作用.通过拟南芥AGO蛋白家族的结构域及各类植物中的AGO蛋白的进化关系进行分析,发现AGO蛋白在植物中结构和进化相对保守.根据已有的芯片数据,对拟南芥中AGO蛋白... argonaute(AGO)蛋白家族成员在小核糖核酸(RNA)介导的转录后调控中有重要作用.通过拟南芥AGO蛋白家族的结构域及各类植物中的AGO蛋白的进化关系进行分析,发现AGO蛋白在植物中结构和进化相对保守.根据已有的芯片数据,对拟南芥中AGO蛋白家族的组织表达进行分析,发现某些AGO基因具有组织表达的特异性.进一步通过基因上游启动子响应元件分析,以及盐等胁迫下的芯片和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)实验数据分析,发现AGO2、AGO3和AGO7等基因受到盐等非生物胁迫的诱导表达.初步探明了拟南芥中AGO基因家族在盐胁迫下的差异表达规律. 展开更多
关键词 植物生理学 拟南芥 小核糖核酸 argonaute蛋白 转录后调控 非生物胁迫
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拟南芥microRNA通路中新因子的筛选和突变体分析 被引量:1
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作者 赵庆喆 梁超 莫蓓莘 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第5期464-470,共7页
小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)是一类长度为20~24核苷酸(nucleotide,nt)的非编码的核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),在植物生长发育过程中具有重要作用.为鉴定参与植物miRNA合成、降解和运输等通路的因子,利用拟南芥转基因... 小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)是一类长度为20~24核苷酸(nucleotide,nt)的非编码的核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),在植物生长发育过程中具有重要作用.为鉴定参与植物miRNA合成、降解和运输等通路的因子,利用拟南芥转基因株系SUC2:amiR-SUL进行正向遗传筛选体系,通过对该株系进行甲基磺酸乙酯(ethylmethylsulfone,EMS)诱变筛选获得SUP-E45突变体.对该突变体进行表型观察、实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和全基因组测序实验.结果显示,突变的基因为Ago1(Argonaute 1),该基因编码的AGO1蛋白是miRNA通路中至关重要的蛋白,成熟的miRNA与AGO1蛋白结合形成miRISC沉默复合体(miRNA-induced silencing complex,miRISC)从而对靶基因的表达进行负调控.验证了该筛选体系的可行性.通过该筛选体系可筛选出其他参与miRNA合成、影响miRNA活性或miRNA运输等通路的因子,为后续拟南芥miRNA通路的研究奠定了基础. 展开更多
关键词 分子生物学 转基因株系SUC2:amiR-SUL 拟南芥 正向遗传筛选 小核糖核酸 AGO1蛋白 EMS诱变 实时荧光定量聚合酶链式反应 全基因组测序
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利用数字表达谱分析拟南芥叶片中盐响应基因
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作者 程华 杨梅燕 +4 位作者 吴佳辉 孙楠 黄健子 郑易之 刘昀 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第6期631-639,共9页
为揭示拟南芥在盐胁迫下基因表达谱的变化,为解决盐害提出新的方向,以哥伦比亚野生型拟南芥为材料,利用数字表达谱技术(digital gene expression profiling,DGEP)分析盐胁迫组(200 mmol/L Na Cl处理2 h)和对照组的拟南芥叶片互补脱氧核... 为揭示拟南芥在盐胁迫下基因表达谱的变化,为解决盐害提出新的方向,以哥伦比亚野生型拟南芥为材料,利用数字表达谱技术(digital gene expression profiling,DGEP)分析盐胁迫组(200 mmol/L Na Cl处理2 h)和对照组的拟南芥叶片互补脱氧核糖核酸(complementary deoxyribonucleic acid,c DNA)文库,鉴定盐胁迫下拟南芥中差异表达的基因.结果显示,盐胁迫组中共有4 400个基因发生了差异表达,其中,1 513个基因上调表达,约占34.39%;2 887个下调表达,约占65.61%.这些基因主要富集于22个基因本体(gene ontology,GO)条目,包括核糖体构成、细胞膜和细胞器组成、应答胁迫、脯氨酸代谢等过程.进一步的KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析表明,基础代谢、次生代谢以及光合和氧化代谢等32个通路的基因显著富集.此外,本研究筛选到6个显著差异表达的胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)基因,其中,3个LEA基因在盐胁迫条件下上调表达,3个下调表达,暗示着这6个LEA基因可能是拟南芥在应答盐胁迫过程发挥关键作用的抗逆基因. 展开更多
关键词 拟南芥 LEA基因 乙烯应答因子 盐胁迫 数字基因表达谱 差异表达基因
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肝细胞癌患者乙型肝炎病毒再激活与诊疗
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作者 雷进 左石 +1 位作者 刘哲睿 陆荫英 《医学综述》 CAS 2022年第22期4428-4433,共6页
乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝细胞癌(HCC)患者在接受免疫检查点抑制剂等药物治疗过程中可发生HBV的再激活。HBV再激活后会诱发炎症等,造成肝功能损害甚至肝衰竭,导致抗HCC治疗的中断或延迟,严重影响患者预后。HBV再激活的发生机制极其复杂... 乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝细胞癌(HCC)患者在接受免疫检查点抑制剂等药物治疗过程中可发生HBV的再激活。HBV再激活后会诱发炎症等,造成肝功能损害甚至肝衰竭,导致抗HCC治疗的中断或延迟,严重影响患者预后。HBV再激活的发生机制极其复杂,通常认为由机体受到自身或外界因素作用导致的免疫力降低引起。虽然抗HBV药物抑制HBV复制的效果显著,但HBV再激活事件常有发生。因此,深入研究并总结HBV再激活相关机制、影响因素以及抗病毒方案的选择,有助于更好地管理HBV再激活。 展开更多
关键词 肝癌 乙型肝炎病毒 抗病毒治疗
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植物pri-miRNA转录及加工过程中的重要因子 被引量:2
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作者 宋家会 蔡强 莫蓓莘 《生命科学》 CSCD 2017年第4期406-413,共8页
MicroRNA(miRNA)是真核生物内源的一类长度为20~24 nt的非编码小RNA,它们通过切割靶标基因mRNA或阻止其翻译在转录后水平调控基因的表达。miRNA广泛参与植物的生长发育、代谢及各类胁迫反应过程,在植物基因表达调控网络中发挥重要作用... MicroRNA(miRNA)是真核生物内源的一类长度为20~24 nt的非编码小RNA,它们通过切割靶标基因mRNA或阻止其翻译在转录后水平调控基因的表达。miRNA广泛参与植物的生长发育、代谢及各类胁迫反应过程,在植物基因表达调控网络中发挥重要作用。编码miRNA的MIR基因首先经过DNA依赖的RNA聚合酶Pol II复合体转录形成pri-miRNA,之后pri-miRNA再经过DCL1加工复合体的一系列加工形成成熟的miRNA。现介绍参与植物pri-miRNA转录和加工过程的重要蛋白及其作用方式,并阐述植物miRNA在转录及转录后水平复杂且精密的调控机制。 展开更多
关键词 植物MIRNA MIR基因转录 pri-miRNA加工 蛋白因子
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