亚胺及其相关离子在区分赖氨酸和谷氨酰胺残基中的应用

完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸的存在,但该特征能否用于区分赖氨酸和谷氨酰胺仍存在争议。本工作以合成肽段和蛋白质胰酶水解肽段为研究体系,利用基质辅助激光解吸电离的高能碰撞诱导解离模式产生的亚胺及其相关离子的相对强度区分这两种氨基酸。结果表明:谷氨酰胺更易产生m/z101离子,而赖氨酸更易产生m/z84和m/z129离子。对于不同时含有赖氨酸和谷氨酰胺的肽段,使用m/z84离子与亚胺离子m/z101的相对强度比值,而非它们的绝对强度,以及m/z101离子的测量值,可以直接判断序列中存在的是赖氨酸还是谷氨酰胺。对于含有谷氨酰胺,并以赖氨酸结尾或含有漏切赖氨酸的肽段,该强度比可为序列中谷氨酰胺的个数和位置提供参考。因此,低质量区提供的亚胺及其相关离子信息有助于区分赖氨酸和谷氨酰胺。

细菌活的非可培养(VBNC)状态及其机理研究进展

细菌活的非可培养(Viable but non-culturable,VBNC)状态是指在一定环境胁迫条件下,一些不形成芽孢的细菌仅保留很低代谢活性但无法分裂,失去在培养基上形成菌落能力的状态.细菌的这一状态也可逆转而恢复生长形成菌落,称为复苏.自1982年这一状态被发现以来,已有60余种非芽孢菌被报道可进入VBNC状态,其中包括许多常见致病菌,从而给以菌落培养为基础的常规检测手段带来了挑战.目前VBNC菌研究领域仍以现象报道为主,对其形成条件、生物学特性、遗传机制等尚未完全了解.本综述重点介绍了近期关于VBNC状态与群体感应效应及环境应力机制相关的一些发现和假说,并简述了VBNC状态细菌在细胞形态结构、蛋白表达及毒性方面的变化规律,以及在不同细菌中发现的与复苏过程相关的细胞复苏因子类似物等;揭示了VBNC作为适应机制在不同细菌种群中的普遍性存在及其与细胞间信号传导之间可能存在的密切联系;最后列举了用于VBNC细菌检测的新技术,并提出该领域未来的研究范围应从致病菌扩大到所有环境细菌.