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肉桂醛改善糖代谢作用靶点及生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
徐丽华
刘银河
+4 位作者
钟篇
张海林
王丽丽
钟泳滢
赵洪磊
《中国医药科学》
2022年第7期57-60,97,共5页
目的利用数据挖掘构建组合网络,通过生物信息学分析获取肉桂醛改善糖代谢作用靶点。方法首先应用网络药理学方法挖掘出数据库中肉桂醛改善糖代谢作用的32条通路;再基于R软件包“graphite”将数据库中的通路转换为生物网络,在线进行富集...
目的利用数据挖掘构建组合网络,通过生物信息学分析获取肉桂醛改善糖代谢作用靶点。方法首先应用网络药理学方法挖掘出数据库中肉桂醛改善糖代谢作用的32条通路;再基于R软件包“graphite”将数据库中的通路转换为生物网络,在线进行富集分析;然后用Cytoscape构建代谢组学与网络药理学的组合网络;最后推测改善糖代谢作用的关键靶点和潜在的关联机制。结果筛选出10个与肉桂醛改善糖代谢有关的关键靶点,其中IRS-1、AMPK-1、AMPK-2、PRKAB-1和PRKAB-2这5个靶点最有可能受肉桂醛调控。结论采用网络比较和比对方法建立生物通路组合网络,分析肉桂醛的候选关键靶点的方法是有效可行的。
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关键词
肉桂醛
糖代谢
生物途径
组合网络
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职称材料
题名
肉桂醛改善糖代谢作用靶点及生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
徐丽华
刘银河
钟篇
张海林
王丽丽
钟泳滢
赵洪磊
机构
深圳市
中国医学科学院阜外医院
深圳医院
药剂
科
深圳市中国医学科学院阜外医院深圳医院检验科
深圳市
中国医学科学院阜外医院
深圳医院
内分泌
科
深圳市
中国医学科学院阜外医院
深圳医院
中医
科
深圳市
中国医学科学院阜外医院
深圳医院
心内
科
深圳市
中国医学科学院阜外医院
深圳医院
临床
医学
研究中心
出处
《中国医药科学》
2022年第7期57-60,97,共5页
基金
广东省深圳市科技计划项目(JCYJ20210324125002006)。
文摘
目的利用数据挖掘构建组合网络,通过生物信息学分析获取肉桂醛改善糖代谢作用靶点。方法首先应用网络药理学方法挖掘出数据库中肉桂醛改善糖代谢作用的32条通路;再基于R软件包“graphite”将数据库中的通路转换为生物网络,在线进行富集分析;然后用Cytoscape构建代谢组学与网络药理学的组合网络;最后推测改善糖代谢作用的关键靶点和潜在的关联机制。结果筛选出10个与肉桂醛改善糖代谢有关的关键靶点,其中IRS-1、AMPK-1、AMPK-2、PRKAB-1和PRKAB-2这5个靶点最有可能受肉桂醛调控。结论采用网络比较和比对方法建立生物通路组合网络,分析肉桂醛的候选关键靶点的方法是有效可行的。
关键词
肉桂醛
糖代谢
生物途径
组合网络
Keywords
Cinnamaldehyde
Glucose metabolism
Biological pathway
Combina torial network
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肉桂醛改善糖代谢作用靶点及生物信息学分析
徐丽华
刘银河
钟篇
张海林
王丽丽
钟泳滢
赵洪磊
《中国医药科学》
2022
3
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