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基于生物信息分析的结直肠癌表达和预后的关键基因筛选
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作者 陈晓玲 杨娟 +1 位作者 吕敏敏 贾亦真 《现代医药卫生》 2024年第7期1109-1117,共9页
目的识别结直肠癌中的差异表达基因(DEGs),探索结直肠癌的关键通路和基因。方法选取来自基因表达综合数据集的基因表达谱GSE211496、GSE6988和GSE29900数据集,使用GEO2R分析工具进行分析并下载相关数据,通过在线数据库miRDB和TargetScan... 目的识别结直肠癌中的差异表达基因(DEGs),探索结直肠癌的关键通路和基因。方法选取来自基因表达综合数据集的基因表达谱GSE211496、GSE6988和GSE29900数据集,使用GEO2R分析工具进行分析并下载相关数据,通过在线数据库miRDB和TargetScan对GSE29900数据集的差异miRNAs进行靶基因预测,然后使用韦恩图取3个数据库的DEGs交集,使用DAVID数据库工具进行GO和KEGG通路富集分析,接着使用PPI进行网络构建并由Cytoscape软件进行可视化,使用TCGA数据库验证Hub基因表达,使用pROC包对与TCGA数据库表达一致的Hub基因进行ROC曲线分析,最后,利用Kaplan-Meier绘图仪在线工具对结直肠癌患者进行预后分析。结果筛选出GSE211496数据集2570个DEGs(p.adj<0.01且|log 2FC|≥1),GSE6988数据集406个DEGs(p.adj<0.01且|log 2FC|≥1)和GSE29900数据集99个差异表达miRNA(p.adj<0.01且|log 2FC|≥1),预测出差异表达miRNAs的靶基因14938个,将靶基因与DEGs重叠共获得30个目标基因。KEGG通路结果显示,目标基因主要富集于血管平滑肌收缩和矿物吸收通路。通过连接度从PPI网络中筛选出前10个Hub基因;Hub基因经TCGA数据库验证,发现MYL9、ACTG2、AGT和PDGFRA与GSE211496数据集表达一致。分析这4个Hub基因对结直肠癌的诊断情况发现,基因AGT(AUC=0.901,95%CI 0.868~0.933)与预测结直肠癌的发生呈正相关,基因MYL9(AUC=0.820,95%CI 0.757~0.884)、ACTG2(AUC=0.855,95%CI 0.802~0.908)和PDGFRA(AUC=0.815,95%CI 0.772~0.858)与预测结直肠癌的发生呈负相关。基因MYL9、ACTG2和PDGFRA对结直肠癌诊断均有一定准确性,基因AGT对结直肠癌诊断具有较高准确性。Kaplan-Meier生存分析发现,PDGFRA、ACTG2和MYL9低表达均显示患者预后较好,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论该研究通过生物信息学分析筛选并鉴定出4个基因是结直肠癌中的枢纽基因,这些基因包括PDGFRA、ACTG2、MYL9和AGT,这将为结直肠癌研究提供一些新方向。 展开更多
关键词 结直肠癌 生物信息学 差异表达基因 ROC曲线分析 生存分析
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红细胞参数及运算公式在广东深圳地区儿童地中海贫血与缺铁性贫血鉴别诊断中的效能评价 被引量:14
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作者 申丽 罗燕婷 +3 位作者 陈志丹 张丽 杨娟 邹汉良 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1689-1693,共5页
目的:评价红细胞参数及运算公式在广东深圳地区儿童地中海贫血(thalassemia trait,TT)和缺铁性贫血(iron deficiency anemia,IDA)鉴别诊断中的效能。方法:选取849例来自广东深圳地区的儿童患者,其中TT 536例,IDA 313例。应用5个红细胞参... 目的:评价红细胞参数及运算公式在广东深圳地区儿童地中海贫血(thalassemia trait,TT)和缺铁性贫血(iron deficiency anemia,IDA)鉴别诊断中的效能。方法:选取849例来自广东深圳地区的儿童患者,其中TT 536例,IDA 313例。应用5个红细胞参数[分别为红细胞计数(RBC)、红细胞平均体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)、红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)和红细胞分布宽度(RDW)]及10个红细胞参数运算公式(分别为Mentzer公式、Green and King公式、Srivastava公式、Ricerca公式、RDWI公式、Sirdah公式、Huber-Herklotz公式、Ehsani公式、Shine and Lal公式和England and Fraser公式),对其敏感度(SEN)、特异度(SPE)、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)以及约登指数(YI)进行分析,绘制受试者工作特征(ROC)曲线。结果:Green and King公式的鉴别诊断价值最高,其YI最高(63.7%),诊断TT的SEN为82.5%,SPE为81.2%,ROC曲线下面积(AUC)最高,为0.875;其次是RDWI公式,其YI、SEN、SPE以及AUC分别为62.8%、79.1%、83.7%及0.870。结论:在广东深圳地区儿童群体中,Green and King公式和RDWI公式具有较好地鉴别诊断TT和IDA的能力。 展开更多
关键词 地中海贫血 缺铁性贫血 红细胞参数及运算公式 鉴别诊断 儿童
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不同化学萃取次数对同种异体肌腱生物学性能的影响 被引量:2
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作者 陈鹏 江长青 +4 位作者 申丽 陈国飞 尤田 江小成 李伟 《实用手外科杂志》 2017年第3期355-358,共4页
目的 通过体外形态学观察、生物力学及免疫原性检测实验,探究不同化学萃取次数对同种异体肌腱生物活性的影响.方法 选取体重2.5~3.0 kg的雄性新西兰大白兔16只,随机分为四组,每组4只,A组(萃取一遍组)、B组(萃取二遍组)、C组(萃取... 目的 通过体外形态学观察、生物力学及免疫原性检测实验,探究不同化学萃取次数对同种异体肌腱生物活性的影响.方法 选取体重2.5~3.0 kg的雄性新西兰大白兔16只,随机分为四组,每组4只,A组(萃取一遍组)、B组(萃取二遍组)、C组(萃取三遍组)及D组(空白对照组).将其跟腱取材后分别进行相应次数的化学萃取过程,然后再分别进行HE染色、电镜观察、生物力学检测及混合淋巴细胞培养测定.结果 A,B两组肌腱表面色泽及纤维束与空白对照组无明显差别,C组与空白对照组差别较大;四组间生物力学检测结果无明显差异;四组间淋巴细胞转化率结果差异有统计学意义.结论萃取二遍组肌腱在去除免疫原性的同时,较完整地保留了大部分原有的肌腱纤维,具有良好的生物学性能. 展开更多
关键词 同种异体肌腱 化学萃取 生物学性能
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个体化护理干预在手足口病患儿护理中的应用 被引量:2
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作者 杨艳梅 黄伟强 《锦州医科大学学报》 CAS 2018年第5期78-80,共3页
目的探讨个体化护理干预对手足口病患儿的护理效果。方法选取2016年05月至2017年04月在我院接受治疗的手足口病患儿110例作为本次研究的对象,根据随机数字表法将患者分为对照组和观察组,两组均为55例,对照组患儿给予常规护理进行干预,... 目的探讨个体化护理干预对手足口病患儿的护理效果。方法选取2016年05月至2017年04月在我院接受治疗的手足口病患儿110例作为本次研究的对象,根据随机数字表法将患者分为对照组和观察组,两组均为55例,对照组患儿给予常规护理进行干预,观察组患儿给予个体化护理联合健康教育进行干预。比较两组患儿的治疗效果、口腔溃疡愈合时间、住院时间和护理满意度。结果观察组患儿的总有效率明显高于对照组患儿的总有效率(P<0. 05),观察组患儿的口腔溃疡愈合时间和住院时间明显低于对照组(P<0. 05);观察组的护理满意度得分明显高于对照组(P<0. 05)。结论个体化护理干预可有效改善手足口病患儿的治疗效果,缩短口腔溃疡愈合时间、住院时间,提升护理满意度,值得临床推广应用。 展开更多
关键词 手足口病 个体化护理 护理效果
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家属协同护理模式联合健康教育对支气管肺炎患儿依从性、康复进程及家属满意度的影响 被引量:12
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作者 杨艳梅 黄伟强 《哈尔滨医药》 2019年第2期176-177,共2页
目的探讨家属协同护理模式联合健康教育对支气管肺炎患儿依从性、康复进程及家属满意度的影响。方法选取2017年1月至12月期间在我院接受治疗的支气管肺炎患儿160例,根据随机数字表法将其分为研究组和对照组,两组均为80例。对照组采用常... 目的探讨家属协同护理模式联合健康教育对支气管肺炎患儿依从性、康复进程及家属满意度的影响。方法选取2017年1月至12月期间在我院接受治疗的支气管肺炎患儿160例,根据随机数字表法将其分为研究组和对照组,两组均为80例。对照组采用常规护理进行干预,研究组采用家属协同护理模式联合健康教育进行干预。采用自制的量表评估患儿的治疗依从性和患儿家属的满意度,记录患儿的体温恢复时间、平喘时间、咯痰停止时间、咳嗽消失时间和住院时间。结果研究组患儿的体育锻炼、饮食控制、按时服药、自我管理和依从性总分均明显高于对照组(P<0.05)。研究组患儿的体温恢复时间、平喘时间、咯痰停止时间、咳嗽消失时间和住院时间均短于对照组(P<0.05)。研究组患儿家属的满意度高于对照组(P<0.05)。结论家属协同护理模式联合健康教育可有效提高支气管肺炎患儿的治疗依从性,加快患儿的康复进程,提高患儿家属的满意度。 展开更多
关键词 支气管肺炎 家属协同护理 健康教育 依从性 康复进程 满意度
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亚临床甲状腺功能减退症对习惯性流产史患者再次妊娠结局的影响分析 被引量:2
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作者 张丽 胡新欣 《中国医药科学》 2021年第1期186-188,199,共4页
目的分析习惯性流产(RPL)患者亚临床甲状腺功能减退症(SCH)患病率及再次妊娠结局。方法对2018年1月至2019年12月于深圳市坪山区妇幼保健院就诊的726例RPL患者进行跟踪分析,收集其年龄、流产次数、复发性流产原因等一般信息,排除前期经... 目的分析习惯性流产(RPL)患者亚临床甲状腺功能减退症(SCH)患病率及再次妊娠结局。方法对2018年1月至2019年12月于深圳市坪山区妇幼保健院就诊的726例RPL患者进行跟踪分析,收集其年龄、流产次数、复发性流产原因等一般信息,排除前期经确诊涉及RPL常见原因(血栓因素、子宫异常等)的患者,其余患者均接受甲状腺激素检查;统计RPL患者SCH患病率并分析甲状腺功能正常患者和SCH患者妊娠结局。结果二次筛选后的456例患者中,SCH组(78例,17.11%)、甲状腺功能正常组(337例,73.90%)患者年龄、流产次数、体重指数(BMI)、再次妊娠人数比较,差异无统计学意义(P>0.05);215例再次妊娠患者均为单胎妊娠,且SCH组再次妊娠患者自然流产、胎儿宫内生长受限、胎盘早剥、新生儿呼吸窘迫综合征出现率、低体重儿出生率远高于甲状腺功能正常组,足月分娩出现率远低于甲状腺功能正常组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SCH可增加习惯性流产患者再次妊娠不良结局发生率。 展开更多
关键词 亚临床甲状腺功能减退症 习惯性流产 妊娠结局 异质性疾病
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血清维生素D水平和维生素D受体基因多态性对儿童慢性荨麻疹的影响研究
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作者 唐德元 王燕 +2 位作者 邹汉良 杨明玉 赵毅 《重庆医学》 CAS 2024年第10期1479-1483,1490,共6页
目的研究血清维生素D水平和维生素D受体(VDR)基因多态性对儿童慢性荨麻疹发病的影响,为儿童慢性荨麻疹的遗传易感性的筛查提供临床依据。方法收集2021年12月至2023年1月深圳市坪山区妇幼保健院收治的儿童慢性荨麻疹100例(试验组)及同期... 目的研究血清维生素D水平和维生素D受体(VDR)基因多态性对儿童慢性荨麻疹发病的影响,为儿童慢性荨麻疹的遗传易感性的筛查提供临床依据。方法收集2021年12月至2023年1月深圳市坪山区妇幼保健院收治的儿童慢性荨麻疹100例(试验组)及同期健康儿童100例(对照组)的临床资料和外周血标本,用化学发光法测定25-羟基维生素D[25(OH)D]、IgE、IgG水平,通过PCR分别对VDR基因ApaI、BsmI、TaqI、FokI、Tru9I进行扩增,测序检测VDR基因多态性及相关的基因多态位点rs7975232、rs1544410、rs731236、rs2228570、rs757343的表达情况。结果试验组外周血中25(OH)D水平低于对照组,IgE和IgG水平高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示,rs757343位点T等位基因为儿童慢性荨麻疹发病的危险因素(OR=1.458,95%CI:1.015~2.153,P=0.047),rs757343位点CC基因型和25(OH)D为保护因素(OR=0.250,95%CI:0.056~0.786,P=0.031;OR=0.553,95%CI:0.373~0.713,P<0.001)。受试者工作特征(ROC)曲线分析显示,25(OH)D、白细胞计数、中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、嗜碱性粒细胞百分比的曲线下面积分别为0.928、0.701、0.808、0.797、0.753,均>0.7。结论维生素D可以辅助诊断儿童荨麻疹并评估病情进展。25(OH)D是儿童慢性荨麻疹发病的保护因素,VDR基因rs757343位点T等位基因为危险因素,CC基因型为保护因素。 展开更多
关键词 儿童 慢性荨麻疹 维生素D 维生素D受体 基因多态性
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CRP与PCT和免疫指标检测在膝关节置换术后早期感染诊断中的价值分析
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作者 陈尘 杨明玉 +2 位作者 杨晓玲 陈嘉俊 许业栋 《医学食疗与健康》 2022年第8期125-128,共4页
目的:探讨C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)与免疫指标检测用于早期诊断膝关节置换术后感染的应用价值。方法:选取2020年1月至2021年1月接收的40份膝关节置换术的血液标本,根据术后是否合并早期感染分成感染组(n=16)与非感染组(n=24),均... 目的:探讨C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)与免疫指标检测用于早期诊断膝关节置换术后感染的应用价值。方法:选取2020年1月至2021年1月接收的40份膝关节置换术的血液标本,根据术后是否合并早期感染分成感染组(n=16)与非感染组(n=24),均采集患者的血液指标,比较患者术前、术后1.d、术后3.d、术后7.d的CRP、PCT与免疫指标[免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)],并分析单项指标测定与联合测定诊断术后早期感染的价值。结果:感染组术后3.d、7.d血清CRP与PCT水平显著高于非感染组(P<0.05);感染组术后1.d、3.d、7.d的血清IgA、IgG、IgM水平显著低于非感染组(P<0.05);CRP、PCT与免疫指标联合检测的灵敏度、特异度与曲线下面积分别为90.22%、60.21%、0.913,均显著高于单一指标检测。结论:膝关节置换术后,早期感染可升高患者血清CRP与PCT水平,降低免疫学指标,而采取CRP、PCT与免疫学指标联合检测方式对诊断膝关节置换术后早期感染的价值突出,值得推广。 展开更多
关键词 CRP PCT 免疫学指标 膝关节置换术 早期感染
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血常规检测中应用末梢采血法和空腹静脉采血法对结果的影响分析 被引量:2
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作者 杨明玉 陈尘 +2 位作者 刁飞 唐德元 张丽 《医学食疗与健康》 2022年第8期142-144,154,共4页
目的:对比分析血常规检测中应用末梢采血法和空腹静脉采血法之间的区别,为临床血常规检测采血方式的选择提供参考依据。方法:选取2021年2~7月在笔者医院进行血常规检测的50例志愿者作为研究对象,随机分为两组:末梢组25例志愿者,应用末... 目的:对比分析血常规检测中应用末梢采血法和空腹静脉采血法之间的区别,为临床血常规检测采血方式的选择提供参考依据。方法:选取2021年2~7月在笔者医院进行血常规检测的50例志愿者作为研究对象,随机分为两组:末梢组25例志愿者,应用末梢采血法;空腹静脉组25例志愿者,使用空腹静脉采血法。比较分析两种检测方式检测的血红蛋白(HGB)、红细胞计数(RBC)、血小板计数(PLT)、红细胞压积(HCT)、白细胞计数(WBC)指标值及志愿者满意度之间的差异。结果:静脉组采血方法、采血后即刻、采血后3.h、采血后6.h等不同时间的HGB、RBC、PLT、HCT、WBC等各项指标均优于同一时间的末梢组,与参数均值更加接近,且志愿者满意度更高,差异有统计学意义(P<0.05)。静脉组与末梢组的平均穿刺时间、平均穿刺次数及疼痛等级三个观察指标比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:在血常规检测过程中,静脉采血法比末梢采血法检测的结果更加准确,而且更受志愿者欢迎,在临床上的应用价值更高、更广泛。 展开更多
关键词 血常规检测 末梢采血法 空腹静脉采血法 满意度
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