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高通量测序技术在地中海贫血基因携带者产前筛查中的应用研究
1
作者
黎文雅
孙波
+3 位作者
赵卫华
叶家秀
周凯苏
周娟芳
《深圳中西医结合杂志》
2024年第7期30-34,共5页
目的:探讨高通量测序技术(NGS)在产前筛查地中海贫血基因携带者的应用价值。方法:随机选取2018年11月至2019年1月在深圳市第二人民医院产科门诊产检的1036例孕妇,所有孕妇均进行血常规、血红蛋白电泳筛查,对血常规、血红蛋白电泳筛查阳...
目的:探讨高通量测序技术(NGS)在产前筛查地中海贫血基因携带者的应用价值。方法:随机选取2018年11月至2019年1月在深圳市第二人民医院产科门诊产检的1036例孕妇,所有孕妇均进行血常规、血红蛋白电泳筛查,对血常规、血红蛋白电泳筛查阳性的孕妇进一步行常规地中海贫血基因检测[裂隙聚合酶链反应(Gap-PCR)技术结合膜反向斑点杂交(RBD)技术],同时对全部1036例孕妇进行NGS地中海贫血基因检测,了解地中海贫血基因在深圳地区孕妇群体中的携带情况,比较不同筛查模式下地中海贫血基因携带者的筛查效果及NGS的额外检出情况。结果:(1)所入组的孕妇群体中,地中海贫血基因总体携带率为8.98%,其中α地中海贫血携带率为7.05%,β地中海贫血携带率为1.54%,α合并β地中海贫血携带率为0.39%。人群中共检出15种地中海贫血基因型别,包括1例基因型为Hb Phnom Penh(HBA1:c.354_355insATC)的α地中海贫血和2例基因型为-50(G>A)的β地中海贫血。(2)不同血液学指标筛查地中海贫血的模式中,血常规、血红蛋白电泳联合筛查的灵敏度最高,但仍存在至少12.50%的漏诊率,且同时产生大量假阳性。(3)在本研究人群中,NGS与传统三级筛查结果完全一致,并且相比常规地中海贫血基因检测可额外检出3例非常见型别和4例意义不明的罕见β珠蛋白基因点突变。结论:NGS一次性筛查在产前阶段可显著降低地中海贫血基因携带者的漏诊率,并可额外检出罕见型别和未知基因变异。
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关键词
地中海贫血
基因筛查
高通量测序
孕妇
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职称材料
沙眼衣原体mRNA和DNA检测的临床应用评价
被引量:
3
2
作者
罗茗月
熊礼宽
+2 位作者
夏勇
肖克林
邵聪文
《检验医学与临床》
CAS
2017年第12期1784-1787,共4页
目的比较实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)检测沙眼衣原体mRNA和聚合酶链反应(PCR)检测质粒DNA的灵敏度和特异度,探讨其临床应用价值。方法分别通过SAT和PCR检测尿液或生殖道分泌物标本789例,两种方法结果不一致的标本采用巢式PCR扩增沙...
目的比较实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)检测沙眼衣原体mRNA和聚合酶链反应(PCR)检测质粒DNA的灵敏度和特异度,探讨其临床应用价值。方法分别通过SAT和PCR检测尿液或生殖道分泌物标本789例,两种方法结果不一致的标本采用巢式PCR扩增沙眼衣原体外膜蛋白(omp1)基因验证。结果 759例(96.2%)标本SAT和PCR结果一致(Kappa=0.64)。SAT和PCR方法的检测结果差异有统计学意义(P<0.01),SAT方法检出的阳性率更高。30例不一致标本通过巢式PCR扩增外膜蛋白验证,14例与SAT检测mRNA相符,16例与PCR检测质粒DNA相符。以两种检测结果一致为"扩大标准",SAT技术的灵敏度和特异度分别为97.6%和98.0%,PCR技术为71.4%和99.7%;沙眼衣原体感染率为5.3%,男性和女性感染率差异无统计学意义(P>0.05),不同年龄组感染率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 SAT技术灵敏度高、特异度好、耗时短且无需昂贵设备,值得临床推广应用。
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关键词
沙眼衣原体
实时荧光核酸恒温扩增技术
聚合酶链反应
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职称材料
题名
高通量测序技术在地中海贫血基因携带者产前筛查中的应用研究
1
作者
黎文雅
孙波
赵卫华
叶家秀
周凯苏
周娟芳
机构
深圳市
第二人民医
院
深圳
大学
附属
第一医
院
深圳市宝安区妇幼保健院暨南大学医学院附属宝安妇幼保健院
出处
《深圳中西医结合杂志》
2024年第7期30-34,共5页
基金
深圳市卫生健康委学科建设能力提升项目(SZXJ2017001)。
文摘
目的:探讨高通量测序技术(NGS)在产前筛查地中海贫血基因携带者的应用价值。方法:随机选取2018年11月至2019年1月在深圳市第二人民医院产科门诊产检的1036例孕妇,所有孕妇均进行血常规、血红蛋白电泳筛查,对血常规、血红蛋白电泳筛查阳性的孕妇进一步行常规地中海贫血基因检测[裂隙聚合酶链反应(Gap-PCR)技术结合膜反向斑点杂交(RBD)技术],同时对全部1036例孕妇进行NGS地中海贫血基因检测,了解地中海贫血基因在深圳地区孕妇群体中的携带情况,比较不同筛查模式下地中海贫血基因携带者的筛查效果及NGS的额外检出情况。结果:(1)所入组的孕妇群体中,地中海贫血基因总体携带率为8.98%,其中α地中海贫血携带率为7.05%,β地中海贫血携带率为1.54%,α合并β地中海贫血携带率为0.39%。人群中共检出15种地中海贫血基因型别,包括1例基因型为Hb Phnom Penh(HBA1:c.354_355insATC)的α地中海贫血和2例基因型为-50(G>A)的β地中海贫血。(2)不同血液学指标筛查地中海贫血的模式中,血常规、血红蛋白电泳联合筛查的灵敏度最高,但仍存在至少12.50%的漏诊率,且同时产生大量假阳性。(3)在本研究人群中,NGS与传统三级筛查结果完全一致,并且相比常规地中海贫血基因检测可额外检出3例非常见型别和4例意义不明的罕见β珠蛋白基因点突变。结论:NGS一次性筛查在产前阶段可显著降低地中海贫血基因携带者的漏诊率,并可额外检出罕见型别和未知基因变异。
关键词
地中海贫血
基因筛查
高通量测序
孕妇
Keywords
Thalassemia
Genetic screening
Next-generation sequencing
Pregnant woman
分类号
R556.61 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
沙眼衣原体mRNA和DNA检测的临床应用评价
被引量:
3
2
作者
罗茗月
熊礼宽
夏勇
肖克林
邵聪文
机构
广东省
深圳市
宝安区
妇幼保健
院
/
暨南大学医学院
附属
宝安
妇幼保健
院
中心实验室
出处
《检验医学与临床》
CAS
2017年第12期1784-1787,共4页
基金
广东省深圳市宝安区科技计划项目(2016CX235)
广东省深圳市知识创新计划基础研究项目(JC20140302120929060)
文摘
目的比较实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)检测沙眼衣原体mRNA和聚合酶链反应(PCR)检测质粒DNA的灵敏度和特异度,探讨其临床应用价值。方法分别通过SAT和PCR检测尿液或生殖道分泌物标本789例,两种方法结果不一致的标本采用巢式PCR扩增沙眼衣原体外膜蛋白(omp1)基因验证。结果 759例(96.2%)标本SAT和PCR结果一致(Kappa=0.64)。SAT和PCR方法的检测结果差异有统计学意义(P<0.01),SAT方法检出的阳性率更高。30例不一致标本通过巢式PCR扩增外膜蛋白验证,14例与SAT检测mRNA相符,16例与PCR检测质粒DNA相符。以两种检测结果一致为"扩大标准",SAT技术的灵敏度和特异度分别为97.6%和98.0%,PCR技术为71.4%和99.7%;沙眼衣原体感染率为5.3%,男性和女性感染率差异无统计学意义(P>0.05),不同年龄组感染率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 SAT技术灵敏度高、特异度好、耗时短且无需昂贵设备,值得临床推广应用。
关键词
沙眼衣原体
实时荧光核酸恒温扩增技术
聚合酶链反应
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量测序技术在地中海贫血基因携带者产前筛查中的应用研究
黎文雅
孙波
赵卫华
叶家秀
周凯苏
周娟芳
《深圳中西医结合杂志》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
沙眼衣原体mRNA和DNA检测的临床应用评价
罗茗月
熊礼宽
夏勇
肖克林
邵聪文
《检验医学与临床》
CAS
2017
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
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