深圳市2005-2007年H3N2亚型流行性感冒病毒流行病学和分子变异特征

目的探讨深圳市2005-2007年季节性流行性感冒（简称流感）流行病学特征和甲3亚型流感病毒可能的分子变异。方法对深圳市2005-2007年流感监测网络（由9所医院、6个区和市疾病预防控制中心共16个主要机构组成）的运行质量进行控制，按周统计分析主要监测医院流感样病例占就诊者的百分比（ILI百分比），并采集流感样病例鼻咽拭子进行流感病毒分离鉴定，对分离到的毒株提取病毒RNA，用反转录聚合酶链式反应（RT—PER）扩增血凝素基因重链区（HA1区）基因片段，产物纯化后测序并进行核苷酸相似性、基因进化树和氨基酸变异分析。结果深圳市2005-2007年流感活动水平在各年间有所波动，呈现夏季高峰，2006和2007年5-7月为流行高峰期。2005-2007年流感病毒的分离率分别为4．78％（114／2385）、5．77％（212／3674）和12．12％（343／2831），分离毒株数多少与ILI百分比的季节波动相关，按周分离率与ILI百分比的变化趋势基本一致。2005和2006年甲3亚型所占比例分别为25．46％（28／114）和2．83％（6／212），而2007年成为优势毒株，占62．68％（215／343）。甲3亚型病毒HA1区序列进化树分析发现，虽然进化树的主干基本按照毒株分离的时间先后发展，与不同年度WHO推荐的疫苗株先后一致，但2005-2007年的主要流感毒株共分为5个分支，2005-2006年毒株在第Ⅰ～Ⅲ分支，2007年4—6月和5—12月形成2个分支，与同期WHO推荐的疫苗株不在一个进化分支，深圳甲3亚型流感病毒的变化较早，出现疫苗株滞后现象。所有毒株未见HA1区序列缺失和插入，受体结合位点和二硫键位点氨基酸也显保守，一些位点出现了不同属性氨基酸的置换，并导致个别潜在的糖基化位点的丢失或增加，但尚不能判定为新变种。结论深圳市可能属于我国流感病毒变异较早的地区之一，甲3亚型流感病毒在人群中呈活跃状态；常规季节性流感监测与病毒分子变异分析结合，能为毒株的演变及其流行病学意义提供及时、重要的信息。