一个罕见HLA—C等位基因间重组家系的遗传背景研究

目的 研究HLA-C等位基因座位上的交换重组,探讨HLA新等位基因产生的分子遗传背景.方法 采集拟进行造血干细胞移植的1例慢性粒细胞白血病患者、患者父母以及2名哥哥的静脉血,采用AlleleSEQR HLA 测序分型试剂进行HLA-A、C、B、DRB1和DQB1共5个位点的高分辨基因分型;再采用Protrans S4 HLA单倍体测序技术分离2个HLA-C等位基因,以确定序列异常的1个C等位基因;进一步采用分子克隆和测序方法进行患者及父母HLA-C等位基因的全长单倍体序列分析.按遗传规律分析该家系的HLA 5个位点的连锁单倍型,同时将HLA-C等位基因全长序列经IMGT/HLA Database中的＂BLAST＂程序进行序列的对比,以确定C等位基因重组发生的精确位置.结果 经HLA测序及遗传家系分析,该家系中父亲的2条HLA连锁单倍型分别为a：A＊0207-C＊010201-B＊550201-DRB1＊090102-DQB1＊030302与b：A＊240201-C＊120202-B＊5201-DRB1＊1502-DQB1＊0601;母亲的分别为：c：A＊300101-C＊060201-B＊130201-DRB1＊0405-DQB1＊0401与d：A＊110101-C＊070201-B＊4001-DRB1＊080302-DQB1＊0601.患者的2名哥哥均分别正常遗传了父母的2条单倍体a、d及b、c.患者的2条单倍体分别为母源单倍体c及父源重组单倍体a/b,其中A＊240201来自父亲的1条染色单体b,而B＊550201-DRB1＊090102-DQB1＊030302则来自父亲的另1条染色单体a.对比患者携带的C未知新等位基因与父亲的1对C＊010201 、C＊120202等位基因的全长单倍体序列,推断父亲的2条染色单体在减数分裂时,由于HLA-C等位基因的第273位至330位碱基区域之间发生了交换,重组后形成新的C等位基因及单倍型并遗传给了患者.该C新等位基因的全长序列已递交GenBank,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为C＊0121.结论 本研究发现了1个罕见的中国汉族人群HLA-C基因座位上的基因重组家系,阐明了HLA-C＊0121新等位基因及单倍型的产生来源,为更深入研究基因重组及HLA多态性形成机制提供了理论依据.

HLA-A和HLA-B与HLA-DRB1基因低分辨相合的无关供／受者对HLA高分辨水平匹配性分析

目的分析探讨HLA-A、HLA-B和HLA-DRBl基因低分辨相合无关供／受者对与HLA高分辨水平匹配的比例和特点。方法对318份HLA-A、B和DRBl基因低分辨相合的无关供／受者对标本进行HLA测序分型，从高分辨水平统计和分析HLA各基因座匹配的比例和特点，以及HLA系统中6个等位基因（HLA-A、HIA-B和HLA-DRB1位点）、8个等位基因（HLA-A、HLA-B、HLA-Cw和HIJA．DRB1位点）、10个等位基因（HLA-A、HLA—B、HIJA-Cw、HLA-DRB1和HLA-DQB1位点）的匹配性。结果单个HLA位点完全相合的比例为HLA-B[79．9％（254／318）]〉HIJA．DRB1[64．8％（206／318）]〉HLA-DQB1[62．3％（134／215）]=HLA-A[62．3％（198／318）]〉HLA-Cw[55．3％（119／215）]。6个等位基因完全相合的比例为36．2％（115／318），8个等位基因完全相合的比例下降为21．9％（47／215），10个等位基因完全相合的比例为20．5％（44／215）。在76份HLA-A、HIJA-B和HLA-DRBl等位基因6／6相合的样本中，等位基因8／8相合及10／10相合的比例分别为63．2％（48／76）和57．9％（44／76）；但其中1～2个HLA-Cw等位基因不相合的比例为36．8％（28／76），且主要为抗原水平不相合。结论实现HLA-A、HLA-B、HLA-DRBI的高分辨分型数据入库虽有助于提高无关供／受者对与HLA高分辨配型检索的成功率，但HLA-Cw抗原水平的不相合不能被忽视，建议将HLA-Cw基因分型纳入骨髓库骨髓志愿捐献者HLA入库数据的常规检测。