深圳市龙华区2018年手足口病病原学特征

目的分析2018年深圳市龙华区手足口病病原学特点,为辖区手足口病预防和控制策略的制定和调整提供科学依据。方法采用荧光定量RT-PCR方法对哨点医院送检的223份手足口病临床诊断病例的肛拭子样本进行肠道病毒(Enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(Enteroviurs A71,EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)、柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)、柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)核酸检测,并对EV核酸阳性样本进行VP1区序列测定、同源性分析、亚型鉴定和系统进化分析。结果实验室确诊病例有166例,阳性率为74.44%,构成比前3位的病毒亚型依次为CV-A6(43.37%),CV-A16(31.33%),CV-A10(13.86%);2018年深圳市龙华区流行的主要肠道病毒中,EV-A71属于C4a进化分支;CV-A16(n=18)核苷酸同源性为89.0%~99.9%,氨基酸同源性为98.3%~99.7%,属于B1a(38.89%,7/18)和B1b(61.11%,11/18)进化分支;CV-A6(n=45)核苷酸同源性为95.1%~99.9%,氨基酸同源性为98.1%~99.0%,均属于D3进化分支;CV-A10(n=12)核苷酸同源性为93.5%~99.8%,氨基酸同源性为97.6%~99.7%,均属于C进化分支。结论深圳市龙华区应进一步加强辖区手足口病监测,持续关注病原谱构成和重要病原体进化情况。

2016-2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点

目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道（观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜）29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标本，共计317份，采用荧光定量PCR方法对样品进行诺如病毒检测，阳性样本进一步用逆转录PCR法同时对聚合酶区-衣壳区进行基因扩增，并进行测序和进化分析以鉴定其基因型。结果317例疑似病例中，实验室确诊156例，其中5岁以下儿童99例（63．46％，99／156）。29起聚集性胃肠炎疫情报告单位主要为幼儿园，占75．9％（22／29）。在317份标本中，156份为诺如病毒GII核酸阳性，阳性率为49．21％。未检出诺如病毒GI。对156份诺如病毒GH核酸阳性的标本进行聚合酶区-衣壳区序列逆转录PCR扩增，共82份阳性，获得82株毒株序列。系统发生树构建结果发现，2016年10月—2017年9月期间，引起深圳市龙华区诺如病毒疫情的基因型有4种，包括GII．P16-G11．2、GII．Pe-GII．4Sydney2012、GII．P17-GII．17和GH．P12-GII．3。其中，GII．P16-GII．2引起的有18起，占62．1％（18／29）。结论深圳市龙华区应进一步加强诺如病毒聚集性疫情监测，重点关注幼儿园5岁及以下儿童，并且要重点监测是否有变异株出现。

深圳市龙华区疱疹性咽峡炎病原学特点

目的分析深圳市龙华区疱疹性咽峡炎病原学特点,为辖区疱疹性咽峡炎预防和控制策略的制定和调整提供科学依据。方法采用荧光定量RT-PCR方法对手足口病哨点医院送检的疱疹性咽峡炎临床诊断病例的肛拭子样本进行肠道病毒(enteroviurs,EVs)、肠道病毒71型(enteroviurs-A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirusA16, CV-A16)核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒的VP1区序列进行测定,亚型鉴定和系统进化分析。结果临床诊断病例肛拭子样本38份中实验室确诊病例29例,确诊率为76.32%(29/38),病原谱监测共发现有9种人肠道病毒(EV-A71、CV-A16、CV-A6、CV-A10、CV-A2、CV-A4、CV-A5、Echo9和CV-B4),其中构成比占前3位的病原体分别CV-A2(24.14%,7/29)、CV-A10(20.69%,6/29)和CV-A6(17.24%,5/29)。实验室确诊病例中,男性有19例(65.52%,19/29),女性有10例(34.48%,10/29);3岁以下儿童25例(86.21%,25/29)。病例发病时间主要集中在4—6月份,有23例(占79.31%,23/29)。系统进化树分析结果显示,CV-A6属于D3进化分支,CV-A10(66.67%)属于C进化分支,CV-A2属于D进化分支。结论深圳市龙华区应开展疱疹性咽峡炎常规监测,重点关注3岁以下儿童,并关注病原谱构成及重要病原体进化情况。

2017年深圳市龙华区手足口病病原学特征分析

目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病（hand,foot,and mouth disease,HFMD）病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒（enteroviurs,EV）、肠道病毒A组71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16,CV A16）核酸检测,并对非EV71非CV A16的其他肠道病毒和EV71的VP1区序列进行测定,亚型鉴定和系统进化分析.结果 实验室确诊病例有190例,阳性率为78.51％（190/242）,其中,EV71感染32例（16.84％,32/190）、CV A16感染11例（5.79％,11/190）、CV A6感染126例（66.32％,126/190）.实验室确诊病例中,男性占57.9％ （110/190）,女性占42.1％（80/190）;3岁以下儿童占78.95％（50/190）.系统进化树分析结果显示,2017年深圳市龙华区流行的EV71属于C4a进化分支,CV A6属于D3进化分支,CV A10属于C进化分支.结论 深圳市龙华区应进一步加强辖区HFMD监测,重点关注3岁以下儿童及病原谱构成和重要病原体进化情况.

2015-2016年深圳市龙华区手足口病流行病学和病原学特征

目的本研究对深圳市龙华区手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的流行病学和病原学特征进行分析,为辖区HFMD预防和控制策略的制订提供重要科学依据。方法从中国疾病预防控制信息系统获取深圳市龙华区2015-2016年HFMD流行病学数据;采用荧光定量聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法对辖区447例HFMD进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒71型(enteroviurs 71,EV-A71)和柯萨奇病毒A16(coxsackievirus A16,CV-A16)核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒进行VP1区序列亚型鉴定和进化分析。采用X^2检验对不同年龄层的HFMD病原体分型结果进行分析。结果2015-2016年深圳市龙华区HFMD发病率较高的两个街道分别是龙华街道和观澜街道;发病曲线呈双峰分布,5~7月份为主高峰,9~11月份为次高峰;5岁及以下儿童占全部发病数的96.40%;不同年龄层HFMD病原体分型结果的差异有统计学意义(X^2=25.01,P<0.001)。结论 CV-A6为2015-2016年龙华区HFMD的主要病原,2015年流行的CV-A6存在两条支系。而2016年CV-A6存在多条支系。应重点做好5岁及以下儿童的手足口病防治工作。

2015-2016年深圳市龙华区手足口病病原谱分析

目的分析深圳市龙华区2015-2016年手足口病(HFMD)病原谱,为辖区内HFMD预防和控制策略的制订提供参考。方法采用荧光定量RT-PCR方法对2015-2016年辖区内447例HFMD病例样本及2016年辖区内疫情监测的75例HFMD病例样本进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A16型(CV-A16)核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒进行VP1区序列测定、亚型鉴定及进化分析。结果 2015-2016年辖区内447例HFMD病例样本实验室检测阳性率为81.21%(363/447),主要优势病原体为EV-A71、CV-A16和柯萨奇病毒A6型(CV-A6),总构成比为82.92%(301/363);2016年辖区内75例HFMD病例样本实验室检测阳性率为52.00%(39/75);EV-A71检出高峰集中在4-6月份,CV-A16的检出高峰集中在4-8月份,CV-A6检出集中在9-10月份;2015-2016辖区内HFMD中CV-A6呈多支分布。结论深圳市龙华区应进一步加强HFMD的病原谱监测及遗传分析,为进一步完善HFMD防控策略提供科学数据。

深圳市龙华区2016年手足口病流行病学和病原学特征

目的本研究对深圳市龙华区2016年手足口病(Hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的流行病学和病原学特征进行分析,为辖区内HFMD预防和控制策略的制订提供重要科学依据。方法从中国疾病预防控制信息系统获取深圳市龙华区2016年HFMD的流行病学数据;采用荧光定量RT-PCR方法对辖区278例HFMD病例样本进行肠道病毒(Enteroviurs,EV)、肠道病毒71型(Enteroviurs 71,EV-A71)和柯萨奇病毒A16(Coxsackievirus A16,CV-A16)核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒进行VP1区序列测定进行亚型鉴定和进化分析。结果 2016年深圳市龙华区HFMD发病率较高的两个街道分别是龙华街道和观澜街道;发病曲线呈双峰分布,分别为5—7月份和9—11月份;5岁以下儿童占全部发病数的96.06%;2016年深圳市龙华区HFMD的优势病原为柯萨奇病毒A16(Coxsackievirus A16,CV-A16),构成比为41.53%。结论深圳市龙华区应进一步加强HFMD的流行病学和病原学监测,为进一步完善HFMD防控策略提供科学数据支持。

深圳市龙华区一起输入性登革热疫情的分子流行病学研究

目的对2017年深圳市龙华区一起输入性登革热病原体进行分子遗传学分析。方法利用C6/36细胞从病人血清中分离登革热病毒(Dengue virus,DENV),对分离得到的DENV的E基因进行测定和系统发生树构建,结合现场流行病学资料对其分子遗传学进行分析。结果成功分离得到1株DENV-1,命名为SZLH_17JB00855_2017。E基因的扩增获得两条目的产物,分别为1 010 bp和829 bp。目的产物经测序拼接后,最终得到长为1 485 bp DNA序列;NCBI数据库多序列在线比对结果显示SZLH_17JB00855_2017毒株E基因与越南2007、2008及2011年分离毒株E基因序列的覆盖率在99%~100%之间;系统发生树分析结果显示,SZLH_17JB00855_2017与VNBID-V1686/2007、VNBID-V1691/2007、VNBID-V3908/2008、VNBID-V3909/2008、VN09DX879/2011亲缘性最近,与近年来广东省各地市暴发的分离株亲缘性较远。结论现场流行病资料和实验室分子遗传学分析都提示本案例报告的登革热病例属于输入性病例,输入地极有可能是越南。