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基于分子对接技术从虾夷扇贝中筛选抗SARS-CoV-2活性肽研究
被引量:
4
1
作者
步营
何玮
+5 位作者
王飞
朱文慧
李学鹏
仪淑敏
徐永霞
励建荣
《食品科学技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期54-62,共9页
为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段进行毒性和生物活性预测。选取活性评分超过0.5且无毒性的肽段,...
为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段进行毒性和生物活性预测。选取活性评分超过0.5且无毒性的肽段,以SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和COVID-19 Mpro水解酶为靶标进行分子对接,鉴定其病毒抗性。结果表明:肽段CSNAIPEL可以与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的GLN42和GLU329两个关键氨基酸结合,LibDock Score为136.03;肽段LPIY不仅能与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的ASP38和TYR491氨基酸结合,还能够与COVID-19 Mpro上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score分别为142.85和168.04;肽段QRPR与COVID-19 Mpro水解酶晶体上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score为154.93。研究表明,肽段CSNAIPEL、LPIY和QRPR三者表现出较好的抗SARS-CoV-2能力。本研究旨在为抗新型冠状病毒功能食品的研发提供新的思路。
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关键词
分子模拟
模拟酶解
SARS-CoV-2
虚拟筛选
分子对接
抗新型冠状病毒肽段
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职称材料
碱性蛋白酶对鲢肌原纤维蛋白凝胶特性的影响
被引量:
6
2
作者
仪淑敏
豁艳
+4 位作者
李睿智
张智铭
刘瑞
李学鹏
励建荣
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期18-24,共7页
以鲢肌原纤维蛋白为研究对象,通过测定碱性蛋白酶处理前后鲢肌原纤维的降解率、巯基含量、表面疏水性、Ca 2+-ATPase活性、凝胶特性等的变化,研究在不同的贮藏条件下(25℃和4℃)碱性蛋白酶对鲢鱼肉中肌原纤维蛋白的降解情况及凝胶特性...
以鲢肌原纤维蛋白为研究对象,通过测定碱性蛋白酶处理前后鲢肌原纤维的降解率、巯基含量、表面疏水性、Ca 2+-ATPase活性、凝胶特性等的变化,研究在不同的贮藏条件下(25℃和4℃)碱性蛋白酶对鲢鱼肉中肌原纤维蛋白的降解情况及凝胶特性的影响。结果发现,经过碱性蛋白酶处理后,在不同温度下,鲢肌原纤维蛋白的降解率均随着时间的延长而增大;表面疏水性、Ca 2+-ATPase活性、总巯基及活性巯基含量均先增高后降低;在反应温度25℃、酶解时间2.0 h以及反应温度4℃、酶解时间2.5 h处理条件下,鲢肌原纤维蛋白的表面疏水性、总巯基及活性巯基含量均达到最高值;在反应温度25℃和4℃下,酶解时间0.5 h时,Ca 2+-ATPase活性达到最高值;蛋白凝胶的持水力与凝胶强度均呈下降趋势;凝胶白度值先降低后增加;扫描电镜结果显示,碱性蛋白酶对鲢肌原纤维蛋白凝胶网络结构产生了一定的破坏作用。
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关键词
鲢
肌原纤维蛋白
碱性蛋白酶
凝胶性质
巯基含量
表面疏水性
Ca
2+-ATPase活性
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职称材料
题名
基于分子对接技术从虾夷扇贝中筛选抗SARS-CoV-2活性肽研究
被引量:
4
1
作者
步营
何玮
王飞
朱文慧
李学鹏
仪淑敏
徐永霞
励建荣
机构
渤海大学食品科学与工程学院/生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心/国家鱼糜及鱼糜制品加工技术研发分中心
大连工业
大学
海洋
食品
精深
加工
关键
技术
省部共建协同创新
中心
出处
《食品科学技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期54-62,共9页
基金
“十三五”国家重点研发计划项目(2018YFD0400603)
辽宁兴辽英才项目(XLYC1807133)。
文摘
为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段进行毒性和生物活性预测。选取活性评分超过0.5且无毒性的肽段,以SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和COVID-19 Mpro水解酶为靶标进行分子对接,鉴定其病毒抗性。结果表明:肽段CSNAIPEL可以与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的GLN42和GLU329两个关键氨基酸结合,LibDock Score为136.03;肽段LPIY不仅能与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的ASP38和TYR491氨基酸结合,还能够与COVID-19 Mpro上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score分别为142.85和168.04;肽段QRPR与COVID-19 Mpro水解酶晶体上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score为154.93。研究表明,肽段CSNAIPEL、LPIY和QRPR三者表现出较好的抗SARS-CoV-2能力。本研究旨在为抗新型冠状病毒功能食品的研发提供新的思路。
关键词
分子模拟
模拟酶解
SARS-CoV-2
虚拟筛选
分子对接
抗新型冠状病毒肽段
Keywords
molecular simulation
simulated enzymatic hydrolysis
SARS-CoV-2
virtual screening
molecular docking
anti-SARS-CoV-2 peptides
分类号
TS254.1 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
Q518 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
碱性蛋白酶对鲢肌原纤维蛋白凝胶特性的影响
被引量:
6
2
作者
仪淑敏
豁艳
李睿智
张智铭
刘瑞
李学鹏
励建荣
机构
渤海大学食品科学与工程学院/生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心/国家鱼糜及鱼糜制品加工技术研发分中心
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期18-24,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(31571868)
中央引导地方科技发展专项(2018107005)
+1 种基金
辽宁省重点研发计划指导计划项目(2017205004)
辽宁省自然科学基金项目(辽科发[2018]25号)
文摘
以鲢肌原纤维蛋白为研究对象,通过测定碱性蛋白酶处理前后鲢肌原纤维的降解率、巯基含量、表面疏水性、Ca 2+-ATPase活性、凝胶特性等的变化,研究在不同的贮藏条件下(25℃和4℃)碱性蛋白酶对鲢鱼肉中肌原纤维蛋白的降解情况及凝胶特性的影响。结果发现,经过碱性蛋白酶处理后,在不同温度下,鲢肌原纤维蛋白的降解率均随着时间的延长而增大;表面疏水性、Ca 2+-ATPase活性、总巯基及活性巯基含量均先增高后降低;在反应温度25℃、酶解时间2.0 h以及反应温度4℃、酶解时间2.5 h处理条件下,鲢肌原纤维蛋白的表面疏水性、总巯基及活性巯基含量均达到最高值;在反应温度25℃和4℃下,酶解时间0.5 h时,Ca 2+-ATPase活性达到最高值;蛋白凝胶的持水力与凝胶强度均呈下降趋势;凝胶白度值先降低后增加;扫描电镜结果显示,碱性蛋白酶对鲢肌原纤维蛋白凝胶网络结构产生了一定的破坏作用。
关键词
鲢
肌原纤维蛋白
碱性蛋白酶
凝胶性质
巯基含量
表面疏水性
Ca
2+-ATPase活性
Keywords
sliver carp
myofibrillar protein
alkali protease
gel property
sulfhydryl content
surface hydrophobicity
Ca 2+-ATPase activity
分类号
TS254.1 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子对接技术从虾夷扇贝中筛选抗SARS-CoV-2活性肽研究
步营
何玮
王飞
朱文慧
李学鹏
仪淑敏
徐永霞
励建荣
《食品科学技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
下载PDF
职称材料
2
碱性蛋白酶对鲢肌原纤维蛋白凝胶特性的影响
仪淑敏
豁艳
李睿智
张智铭
刘瑞
李学鹏
励建荣
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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职称材料
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