不同酶切体系对胶回收纯化DNA浓度的影响

目的通过建立不同的酶切体系,找寻酶切效果好、胶回收试剂盒纯化DNA得率高的实验设计。方法使用XhoⅠ单酶切重组质粒pcDNA3-P2X4,酶切体系的体积分别为:150μl、160μl、170μl、180μl;酶切体系组成为:dddH2O(补足体积)、BufferR(应用浓度是酶切体积的10%)、质粒DNA(无论所得质粒浓度如何,琼脂糖凝胶电泳胶回收的DNA上样量统一为23μg),XhoⅠ10μl(6μl、4μl两次加入);反应温度为:37℃;酶切的时间为2～3h。结果酶切体系越大,所需要的酶切时间越短、酶切效果越好、酶切条带越接近Marker标准条带(通过电泳拍照观察所得),但是胶回收纯化后DNA的浓度却越低:150μl体系DNA的浓度=308.96±8.71μg/ml,160μl体系DNA的浓度=286.62±8.37μg/ml,170μl体系DNA的浓度=245.80±15.64μg/ml,180μl体系DNA的浓度=198.00±16.54μg/ml(方差分析,P<0.05,n=5)。结论将酶切的体系放大,杂质将相对稀释,不需增加酶的用量就能取得较好的酶切效果;提取质粒的浓度和纯度也决定着酶切效果。