苹果茎沟病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆和序列分析

选取生物学和血清学特性存在较大差异的苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)梨分离物P-6-1-17、P-4- 1-69、P-L2和P-D-21,采用RT-PCR法对3’端进行扩增,所获扩增片段经序列测定,全长分别为1089 nt(P-6-1-17、P-L2)和 1069 nt(P-4-1-69、P-D-21)。4个分离物的CP基因均由714 nt组成,其核苷酸和推导编码蛋白氨基酸序列同源性分别为 89．8％-96．4％和94．9％-97．9％。将我国4个分离物的CP基因与已报道ASGV分离物及分子变种进行序列同源性比较和系统进化树分析,结果表明我国ASGV分离物至少可分为2个组群,其中生物学表现明显不同于其它分离物的P-L2, 其CP基因核苷酸序列显示较大的变异。