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刺葡萄ISSR分子标记体系的建立及种质资源聚类分析
被引量:
9
1
作者
王美军
黄乐
+6 位作者
刘昆玉
杨国顺
钟晓红
徐丰
白描
金燕
石雪晖
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期279-287,共9页
【目的】建立刺葡萄(Vitis davidii Fo?x.)的ISSR分子标记体系以及分析刺葡萄种质资源的亲缘关系,为刺葡萄的保护和利用提供依据。【方法】以8份外缘葡萄品种或类型为对照,52份刺葡萄类型为材料,采用改良CTAB法提取植物基因组DNA,以基因...
【目的】建立刺葡萄(Vitis davidii Fo?x.)的ISSR分子标记体系以及分析刺葡萄种质资源的亲缘关系,为刺葡萄的保护和利用提供依据。【方法】以8份外缘葡萄品种或类型为对照,52份刺葡萄类型为材料,采用改良CTAB法提取植物基因组DNA,以基因组DNA为模板,用同一试验考察多个因素及水平的筛选方式对ISSR-PCR扩增反应体系中的Mg2+、d NTPs、引物、模板DNA的浓度及循环数进行优化,建立适用于刺葡萄的最佳ISSR-PCR反应体系;在优化的反应体系中进行多态性引物的筛选并进行分析,同时根据Jaccard遗传相似系数进行UPGMA聚类分析。【结果】采取改良CTAB法提取的刺葡萄DNA质量优于常规的CTAB法,在优化的ISSR-PCR反应体系中,从100条ISSR引物筛选出了13个具有多态性的引物,共检测到139个位点,其中多态性位点116个,多态位点百分率为83.45%。聚类结果显示,对照组8份外缘资源均在刺葡萄种群外,刺葡萄与华东葡萄的遗传距离较腺枝葡萄近;52份刺葡萄类型分为三大组群,两大江西刺葡萄组群及湖南与福建刺葡萄组群,而在湖南与福建刺葡萄种群中又分为4个群组。【结论】刺葡萄种质资源具有丰富的遗传多样性,ISSR分子标记可有效揭示刺葡萄种质资源的遗传多样性和亲缘关系,对刺葡萄种质资源的保护和利用有重要的意义。
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关键词
刺葡萄
ISSR分子标记
多态性分析
聚类分析
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职称材料
题名
刺葡萄ISSR分子标记体系的建立及种质资源聚类分析
被引量:
9
1
作者
王美军
黄乐
刘昆玉
杨国顺
钟晓红
徐丰
白描
金燕
石雪晖
机构
湖南农业大学园艺园林学院.湖南省葡萄工程技术研究中心
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期279-287,共9页
基金
国家农业产业技术体系专项(CARS-30)
湖南省葡萄工程技术研究中心(2012TP4012)
+2 种基金
湖南省科技厅农业重点项目(2009Ck-2010)
湖南省高校科技成果产业化培育项目(09CY008)
湖南省教育厅科学研究项目(15C0669)
文摘
【目的】建立刺葡萄(Vitis davidii Fo?x.)的ISSR分子标记体系以及分析刺葡萄种质资源的亲缘关系,为刺葡萄的保护和利用提供依据。【方法】以8份外缘葡萄品种或类型为对照,52份刺葡萄类型为材料,采用改良CTAB法提取植物基因组DNA,以基因组DNA为模板,用同一试验考察多个因素及水平的筛选方式对ISSR-PCR扩增反应体系中的Mg2+、d NTPs、引物、模板DNA的浓度及循环数进行优化,建立适用于刺葡萄的最佳ISSR-PCR反应体系;在优化的反应体系中进行多态性引物的筛选并进行分析,同时根据Jaccard遗传相似系数进行UPGMA聚类分析。【结果】采取改良CTAB法提取的刺葡萄DNA质量优于常规的CTAB法,在优化的ISSR-PCR反应体系中,从100条ISSR引物筛选出了13个具有多态性的引物,共检测到139个位点,其中多态性位点116个,多态位点百分率为83.45%。聚类结果显示,对照组8份外缘资源均在刺葡萄种群外,刺葡萄与华东葡萄的遗传距离较腺枝葡萄近;52份刺葡萄类型分为三大组群,两大江西刺葡萄组群及湖南与福建刺葡萄组群,而在湖南与福建刺葡萄种群中又分为4个群组。【结论】刺葡萄种质资源具有丰富的遗传多样性,ISSR分子标记可有效揭示刺葡萄种质资源的遗传多样性和亲缘关系,对刺葡萄种质资源的保护和利用有重要的意义。
关键词
刺葡萄
ISSR分子标记
多态性分析
聚类分析
Keywords
Vitis davidii Fo x
ISSR
Polymorphism analysis
Cluster analysis
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
刺葡萄ISSR分子标记体系的建立及种质资源聚类分析
王美军
黄乐
刘昆玉
杨国顺
钟晓红
徐丰
白描
金燕
石雪晖
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
9
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