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题名中国瘰螈皮肤转录组测序及活性多肽分析
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作者
唐兴
梁广男
刘雅莉
段志贵
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机构
衡阳师范学院生命科学与环境学院
衡阳师范学院南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室
东华理工大学江西省质谱科学与仪器重点实验室
湖南师范大学动物多肽药物创制国家地方联合工程实验室
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出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2022年第1期69-75,共7页
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基金
国家自然科学基金(31201718,31402025)
长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13054)
+3 种基金
湖南省生物发育工程及新产品研发协同中心项目(20134486)
衡阳师范学院科学基金科研项目(18D16)
“南岳山区生物资源保护与利用”湖南省重点实验室开放基金项目(NY20K05)
湖南省教育厅科学研究项目(20C0273)共同资助。
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文摘
首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽。提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建cDNA文库,采用Illumina HiSeq 4000进行测序。测序数据处理后获得unigene,并对其进行基因注释和生物信息学分析。共组装获得了74371个非冗余unigene(平均长度为762 bp),其中33627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释,5137个unigene的注释结果来自两栖类物种,约占注释总数的15%。另外,从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素,它们大多数具有皮肤免疫或防御功能,且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽。结果为阐明蝾螈皮肤免疫或防御机制提供了前期基础资料。
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关键词
中国瘰螈
转录组测序
活性多肽
CDNA文库
生物信息学分析
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Keywords
Paramesotriton chinensis
transcriptome sequencing
active peptide
cDNA library
bioinformatic analysis
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分类号
S865.4
[农业科学—野生动物驯养]
Q516
[生物学—生物化学]
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题名肿瘤基因组图谱之泛癌图谱
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作者
何询
胡昊良
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机构
深圳未名新鹏生物医药有限公司
湖南师范大学动物多肽药物创制国家地方联合工程实验室
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出处
《中国医药生物技术》
2020年第6期635-637,共3页
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文摘
根据肿瘤类型和病理过程不同,肿瘤治疗的传统方法主要包括手术、化疗和放疗等。肿瘤的靶向治疗和免疫治疗虽然具有更好的疗效和更小的副作用,但目前其效果仍受到如肿瘤异质性等多重因素的制约。有趣的是,的肿瘤在分子水平上具有相似性,这种相似性甚至比同种肿瘤不同分型之间的相似性更大[1]。
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关键词
肿瘤异质性
肿瘤治疗
肿瘤类型
免疫治疗
靶向治疗
病理过程
不同分型
副作用
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分类号
R730.5
[医药卫生—肿瘤]
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