雄性中华狼蛛毒素多肽的分离及鉴定

采用反向高效液相色谱对雄性中华狼蛛粗毒进行分离,再用MALDI–TOF–TOF质谱进行相对分子质量测定。结果表明:从雄性中华狼蛛粗毒中一共鉴定到195种毒素多肽组分,这些毒素多肽的相对分子质量为1 000~10 000,其中大多数多肽的相对分子质量为1 000~3 500和4 500~7 500。这些毒素多肽的相对分子质量的分布特征与已报道的其他蜘蛛的不同,这可能是因为不同种类蜘蛛的毒素成分具有不同的多样性特点。

蓝尾蝾螈皮肤转录组及活性多肽分析

通过对蓝尾蝾螈皮肤进行转录组测序,首次报道了蓝尾蝾螈皮肤的转录组及其活性多肽成分.采用Illumina Hiseq4000共测定了6.65 Gb数据;组装和去冗余后共获得75462个unigene,其N50、GC含量、平均长度、总长度分别为1617 bp、45.64%、818 bp、61801999 bp.通过基因注释,共获得34850个非冗余注释unigene(占unigene总数的46.18%),注释结果为两栖类物种的unigene数目约占注释总数的16%.根据unigene的COG和GO注释结果,统计了各自的功能分类.其中,对鉴定到的多种活性多肽进行了初步的生物信息学分析,为诠释蓝尾蝾螈皮肤生理学功能提供依据.

触形大疣蛛毒素多肽的分离和鉴定

蜘蛛是种类最多的有毒动物,其毒液主要成分是富含二硫键的毒素多肽。蜘蛛毒素多肽主要功能是作用于昆虫神经系统的离子通道或受体。触形大疣蛛隶属于蜘蛛目,原蛛下目,异纺蛛科。通过反相高效液相色谱分离触形大疣蛛粗毒,再通过MALDI-TOF-TOF质谱对各个洗脱峰进行分子量测定。实验结果显示,从触形大疣蛛粗毒中一共鉴定到108种的毒素多肽,其分子量在2 000~7 500 Da均有分布,主要分子量范围分布在2 000~4 500 Da(占63.9%),还有一部分分布在4 500~6 000 Da,而在6 000~7 500 Da范围内分布很少。其分子量的分布特征与已报道的原蛛下目蜘蛛均不同,反映了这种蜘蛛毒液成分具有独特的多样性。

沟纹硬皮地蛛粗毒的多肽成分初探

通过高效液相色谱结合MALDI-TOF-TOF质谱对沟纹硬皮地蛛粗毒所含多肽成分进行分离和鉴定.从沟纹硬皮地蛛粗毒中一共鉴定到105种毒素多肽.大多数毒素多肽的分子质量分布范围在1 000~3 500 u(占总数84.8%),还有一部分毒素多肽的分子质量分布范围在3 500~4 500和6 500~8 500 u.与其他蜘蛛种类比较,沟纹硬皮地蛛毒素多肽的分子质量分布特征均不相同,这体现了地蛛科蜘蛛毒液成分的特异性.

中华狼蛛抗肿瘤肽的序列分析

中华狼蛛与穴居狼蛛在进化上亲缘性较近,均属于狼蛛科狼蛛属。该研究从中华狼蛛毒腺cDNA文库筛选到与穴居狼蛛抗肿瘤肽LSTX-A1的前体序列(或cDNA序列)具有高度相似性的3个毒素多肽(LS-toxin-A1、LS-toxin-A2、LS-toxin-A3)。与LSTX-A1比较,由于发生同义突变使得它们与LSTX-A1的信号肽和中间肽的氨基酸序列完全相同。而在成熟肽区域,由于非同义突变导致LS-toxin-A1和LS-toxin-A2与LSTX-A1的氨基酸序列不同;但LS-toxin-A3仅发生同义突变,因此它与LSTX-A1的氨基酸序列相同。这些中华狼蛛毒素的成熟肽含有4对二硫键(其排列方式为-C-C-CC-C-C-C-C-),而且它们在C末端残基均发生酰胺化修饰。由于该研究鉴定的中华狼蛛毒素与LSTX-A1具有极高的序列相似性,因此作者推断它们具有类似的抗肿瘤活性。

中国瘰螈皮肤转录组测序及活性多肽分析

首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽。提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建cDNA文库,采用Illumina HiSeq 4000进行测序。测序数据处理后获得unigene,并对其进行基因注释和生物信息学分析。共组装获得了74371个非冗余unigene(平均长度为762 bp),其中33627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释,5137个unigene的注释结果来自两栖类物种,约占注释总数的15%。另外,从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素,它们大多数具有皮肤免疫或防御功能,且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽。结果为阐明蝾螈皮肤免疫或防御机制提供了前期基础资料。

肿瘤基因组图谱之泛癌图谱

根据肿瘤类型和病理过程不同,肿瘤治疗的传统方法主要包括手术、化疗和放疗等。肿瘤的靶向治疗和免疫治疗虽然具有更好的疗效和更小的副作用,但目前其效果仍受到如肿瘤异质性等多重因素的制约。有趣的是,的肿瘤在分子水平上具有相似性,这种相似性甚至比同种肿瘤不同分型之间的相似性更大[1]。