基于铁死亡相关基因的生物信息学分析及结肠癌预后模型构建

目的筛选结肠癌(CC)差异预后铁死亡基因(CFRGs)并构建CC预后模型。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)、FerrDb数据库获取相关数据,采用生物信息学方法筛选出CFRGs;通过TCGA数据库对所筛选出的CFRGs进行表达差异分析;采用Kaplan-Meier曲线与时间依赖性ROC曲线对所筛选出的CFRGs进行预后分析;采用单因素和多因素Cox回归分析构建CFRGs Nomogram图,并采用Calibration分析验证该模型的预测能力。结果共获取CFRGs 3个,即ALOXE3、CRYAB、CDKN2A;其中ALOXE3、CDKN2A表达上调,CRYAB表达下调。ALOXE3、CRYAB、CDKN2A高表达的CC患者生存结局均较差。联合3个基因的风险评分系统公式为0.172×ALOXE3_(exp)+0.126×CRYAB_(exp)+0.171×CDKN2A_(exp)-0.772,其预测CC患者1、3、5年生存的AUC分别为0.642、0.643、0.593。以年龄、性别、风险评分为因子构建CFRGs Nomogram图,预测能力较好(C指数为0.651);Calibration分析显示其预测的1、3、5年生存率与理想线段吻合良好。结论ALOXE3、CRYAB、CDKN2A与CC患者的生存预后显著相关,联合3个基因构建的风险评分系统和以年龄、性别、风险评分为因子构建的CFRGs Nomogram图均有良好的预测效能。