嗜酸热原体菌的超氧化物歧化酶的结构模建和进化踪迹分析(英文)

为考察来源于极端高温酸性环境中的超氧化物歧化酶,建立了一个由嗜酸热原体菌的sod基因编码的蛋白质的可靠三维分子结构,并对这个蛋白质进行进化踪迹分析识别出了11个踪迹残基?其中,残基Asn39,Gly105和Glu162的位置随机遍布整个结构,其余的残基却全部都明显地聚于一个靠近铁原子的子类当中?由此从在三维结构确认sod基因编码含铁的超氧化物歧化酶。此外,那些被识别的靠近铁原子的踪迹残基可能跟铁的绑定和催化功能直接相关?

腾冲嗜热厌氧菌的超氧化物歧化酶的进化踪迹分析

通过同源模建和分子动力学模拟,一个由腾冲嗜热厌氧菌的sod基因编码的蛋白质的可靠的分子结构被建立.对建立的结构进行进化踪迹分析识别出了11个踪迹残基.在它们当中,残基Asn36,Gly101和Glu158的位置遍布整个结构,无规可循;其余的残基都明显地聚于一个靠近铁原子的子类当中.这些结果表明,该基因编码含铁的超氧化物歧化酶;同时,那些铁原子附近的踪迹残基跟铁的绑定和催化功能直接相关.