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基于网络药理学和分子对接探讨厚朴酚治疗胆管癌的分子机制
被引量:
1
1
作者
任红岳
侯文蓉
+2 位作者
杨晓帆
张辉
张春斌
《黑龙江医药科学》
2023年第2期34-39,共6页
目的:基于网络药理学和分子对接筛选厚朴酚作用胆管癌的具体靶点,探讨厚朴酚治疗胆管癌的潜在机制。方法:基于TCMSP、Swiss Target Prediction、STITCH、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出厚朴酚以及胆管癌的靶点基因,通过Venny 2.1.0平...
目的:基于网络药理学和分子对接筛选厚朴酚作用胆管癌的具体靶点,探讨厚朴酚治疗胆管癌的潜在机制。方法:基于TCMSP、Swiss Target Prediction、STITCH、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出厚朴酚以及胆管癌的靶点基因,通过Venny 2.1.0平台分析得到两者的共同靶点。利用STRING数据库探索厚朴酚以及胆管癌共同靶点之间的相互作用关系,使用CytoScape3.9.1软件筛选Top10-Hub(核心)靶点。通过DAVID数据库对厚朴酚和胆管癌的共同靶点基因进行GO和KEGG富集分析,使用Auto Dock Tools-1.5.6软件进行分子对接验证结果可信性。结果:厚朴酚治疗胆管癌的交集靶点基因47个,核心靶点为AKT1、IL6、CASP3、CCND1、PTGS2、EGFR、ERBB2、MMP9、MMP2和KDR。GO生物过程富集分析中共得到230条结果,主要包括负调控凋亡过程、正向调节细胞增殖和蛋白质自身磷酸化等。KEGG信号通路分析得到120条,主要涉及癌症信号通路、内分泌耐药和膀胱癌等。分子对接结果显示核心靶点与厚朴酚的结合能均<-5.0 kcal/mol,表明整体结合情况良好。结论:厚朴酚可以通过调控PTGS2和MMP9等关键分子影响胆管癌细胞的凋亡和增殖等生物学过程,进而发挥治疗胆管癌的作用。
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关键词
厚朴酚
胆管癌
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨厚朴酚治疗胆管癌的分子机制
被引量:
1
1
作者
任红岳
侯文蓉
杨晓帆
张辉
张春斌
机构
漳州卫生职业学院基础医学部/基础医学部科研平台
佳木斯大学
基础医学
院
漳州卫生职业学院
医学
技术系/转化
医学
检测应用技术协同创新中心
出处
《黑龙江医药科学》
2023年第2期34-39,共6页
基金
福建省中青年教师教育科研项目,编号:JAT220697
漳州卫生职业学院2022年院级科研项目,编号:ZWYXJ202101
福建省自然科学基金,编号:2022J01531和2022J011362。
文摘
目的:基于网络药理学和分子对接筛选厚朴酚作用胆管癌的具体靶点,探讨厚朴酚治疗胆管癌的潜在机制。方法:基于TCMSP、Swiss Target Prediction、STITCH、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出厚朴酚以及胆管癌的靶点基因,通过Venny 2.1.0平台分析得到两者的共同靶点。利用STRING数据库探索厚朴酚以及胆管癌共同靶点之间的相互作用关系,使用CytoScape3.9.1软件筛选Top10-Hub(核心)靶点。通过DAVID数据库对厚朴酚和胆管癌的共同靶点基因进行GO和KEGG富集分析,使用Auto Dock Tools-1.5.6软件进行分子对接验证结果可信性。结果:厚朴酚治疗胆管癌的交集靶点基因47个,核心靶点为AKT1、IL6、CASP3、CCND1、PTGS2、EGFR、ERBB2、MMP9、MMP2和KDR。GO生物过程富集分析中共得到230条结果,主要包括负调控凋亡过程、正向调节细胞增殖和蛋白质自身磷酸化等。KEGG信号通路分析得到120条,主要涉及癌症信号通路、内分泌耐药和膀胱癌等。分子对接结果显示核心靶点与厚朴酚的结合能均<-5.0 kcal/mol,表明整体结合情况良好。结论:厚朴酚可以通过调控PTGS2和MMP9等关键分子影响胆管癌细胞的凋亡和增殖等生物学过程,进而发挥治疗胆管癌的作用。
关键词
厚朴酚
胆管癌
网络药理学
分子对接
分类号
R735.8 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨厚朴酚治疗胆管癌的分子机制
任红岳
侯文蓉
杨晓帆
张辉
张春斌
《黑龙江医药科学》
2023
1
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