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传统中药东亚钳蝎基因在毒液腺特征分布的转录组学分析
被引量:
1
1
作者
张鸿飞
葛得龙
+7 位作者
黄晓斐
梅迪
郭莉
王艺蓉
李海梅
孙同毅
贾光韬
李文辉
《昆明医科大学学报》
CAS
2021年第5期35-40,共6页
目的研究东亚钳蝎Buthus martensii Karsch转录组信息特征。方法以山东省临沂地区特色东亚钳蝎为研究对象,利用二代高通量测序平台Illumina HiSeq 4000150PE分别对东亚钳蝎的前腹部、后腹部、毒液腺进行转录组测序。利用测定的转录组数...
目的研究东亚钳蝎Buthus martensii Karsch转录组信息特征。方法以山东省临沂地区特色东亚钳蝎为研究对象,利用二代高通量测序平台Illumina HiSeq 4000150PE分别对东亚钳蝎的前腹部、后腹部、毒液腺进行转录组测序。利用测定的转录组数据将毒液腺基因分别与前腹部和后腹部基因集进行比较,然后取两两比较之后的交集进行分析,筛选差异基因集进行GO和KO分析。结果GO功能分类共有60个大项,含有23个生物学途径,13个细胞组分和24个分子功能。富集最显著的前20个KEGG通路中与毒素密切相关的为钙离子信号通路、磷脂酶信号通路。结论通过无参转录组测序,构建了东亚钳蝎转录组序列数据库,为今后东亚钳蝎功能基因的挖掘提供了序列基础并为代谢产物的生物合成提供了数据支撑,为传统中药在临床应用乃至精准医学方面提供了新的思路。
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关键词
东亚钳蝎
毒液腺
前腹部
后腹部
转录组测序
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职称材料
题名
传统中药东亚钳蝎基因在毒液腺特征分布的转录组学分析
被引量:
1
1
作者
张鸿飞
葛得龙
黄晓斐
梅迪
郭莉
王艺蓉
李海梅
孙同毅
贾光韬
李文辉
机构
潍坊医学院山东省蛋白质与多肽药物工程实验室
中国科
学院
昆明动物研究所
出处
《昆明医科大学学报》
CAS
2021年第5期35-40,共6页
基金
云南省科技厅重点领域科技计划基金资助项目(2019ZF003-002)。
文摘
目的研究东亚钳蝎Buthus martensii Karsch转录组信息特征。方法以山东省临沂地区特色东亚钳蝎为研究对象,利用二代高通量测序平台Illumina HiSeq 4000150PE分别对东亚钳蝎的前腹部、后腹部、毒液腺进行转录组测序。利用测定的转录组数据将毒液腺基因分别与前腹部和后腹部基因集进行比较,然后取两两比较之后的交集进行分析,筛选差异基因集进行GO和KO分析。结果GO功能分类共有60个大项,含有23个生物学途径,13个细胞组分和24个分子功能。富集最显著的前20个KEGG通路中与毒素密切相关的为钙离子信号通路、磷脂酶信号通路。结论通过无参转录组测序,构建了东亚钳蝎转录组序列数据库,为今后东亚钳蝎功能基因的挖掘提供了序列基础并为代谢产物的生物合成提供了数据支撑,为传统中药在临床应用乃至精准医学方面提供了新的思路。
关键词
东亚钳蝎
毒液腺
前腹部
后腹部
转录组测序
Keywords
Buthus martensii
Venom gland
Preabdomen
Postabdomen
Transcriptome sequencing
分类号
R282.7 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
传统中药东亚钳蝎基因在毒液腺特征分布的转录组学分析
张鸿飞
葛得龙
黄晓斐
梅迪
郭莉
王艺蓉
李海梅
孙同毅
贾光韬
李文辉
《昆明医科大学学报》
CAS
2021
1
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