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基于中心碳代谢和基因表达谱的结直肠癌相关分子研究
1
作者
袁炜嗣
陈银杏
+2 位作者
曾虹
林芳
陈秀娜
《中国科技期刊数据库 医药》
2023年第7期20-25,共6页
研究结直肠组织中心的碳代谢情况和基因表达情况对期及期患者的复发情况的影响。方法 采用贝叶斯相容聚类算法(Bayesian Complex Calculated Component Calculation, BCC),对结直肠癌基因表达谱及其相应的拷贝变异谱进行了综合,并对结...
研究结直肠组织中心的碳代谢情况和基因表达情况对期及期患者的复发情况的影响。方法 采用贝叶斯相容聚类算法(Bayesian Complex Calculated Component Calculation, BCC),对结直肠癌基因表达谱及其相应的拷贝变异谱进行了综合,并对结直肠癌的分子亚型进行了研究。通过对结直肠癌病人的生存率、复发率等资料进行生存率分析,评估每种亚型在肿瘤发生发展中的预后价值,并应用基因系列富集软件对每种亚型中表达的生物信息进行分析。结果 从50名结直肠癌病人中选择了50名病人, BCC方法比单独使用基因表达谱分型更为精确,克雷默氏 V为0,通过对基因组数据、基因复制数谱数据和表达谱数据的分析, BCC方法可以较好地将结直肠癌的分型划分出来。本课题组前期研究发现,BCC-Ⅰ亚型患者预后最佳,BCC-Ⅱ亚型患者预后最差,BCC-(+)亚型患者预后中等。另外,将结直肠癌标本中的BCC-亚型及BCC-Ⅰ亚型采用 DNA损伤修复方法进行再分类后,可明显改善患者预后,且与 BCC分类结果有明显的相关性(Cmmer′ s V=0.39, P<0.001)。结论 BCC法是结直肠癌中综合多种组学信息进行癌症分类的一种行之有效的方法。
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关键词
结肠肿瘤/病理学
代谢组
基因表达
聚类分析
分子生物学
预后
下载PDF
职称材料
基于生物信息学数据库的结肠癌SDC4基因表达调控机制及作用研究
2
作者
唐梓涵
袁炜嗣
+6 位作者
吴泽强
张粤烽
詹涵
王琛瑶
李恩民
陈滋凯
周飞
《韩山师范学院学报》
2023年第3期13-23,共11页
为了揭示SDC4基因在结肠癌中的功能及其表达调控机制.通过GEPIA2、Ualcan与Oncolnc等数据库研究分析SDC4基因在结肠癌的表达及其对患者总生存期的影响.通过Wanderer、UCSC、Cistrome DB、miRcode和miRDB等数据库研究分析结肠癌SDC4基因...
为了揭示SDC4基因在结肠癌中的功能及其表达调控机制.通过GEPIA2、Ualcan与Oncolnc等数据库研究分析SDC4基因在结肠癌的表达及其对患者总生存期的影响.通过Wanderer、UCSC、Cistrome DB、miRcode和miRDB等数据库研究分析结肠癌SDC4基因启动子区的甲基化、组蛋白修饰,调控其表达的转录因子和miRNAs.通过GEPIA2、Ualcan、HCMdb与DAVID等数据库研究分析在结肠癌中与SDC4基因共表达的基因及其生物学作用.基于以上生物信息学数据库,研究发现,在结肠癌中:SDC4基因的表达水平显著增高,并与肿瘤组织分期、淋巴结转移正相关,与患者预后负相关.SDC4基因启动子区的甲基化水平显著升高,转录激活性组蛋白修饰H3K4Me1与H3K27Ac显著富集.SP1、TEAD4、JUND、FOSL1、NR1H3、PPARG、SRF、TFAP4共8个转录因子可能调控SDC4基因的转录表达.与此同时hsa-miR-194和hsa-miR-124也可能调控SDC4基因表达.hsa-miR-194和hsa-miR-124的表达下调.SERINC3、DNTTIP1、ATP9A、CHMP4B、BCL2L1、STAU1、SYS1、YWHAB、OSBPL2、SLC35C2、TM9SF4与SDC4基因共表达.SDC4基因可能参与调控结肠癌细胞凋亡、细胞通讯、物质运输与定位等生物学过程.基于生物信息学数据库研究发现的结果,为进一步阐明SDC4基因在结肠癌中的功能及其表达调控机制提供重要的线索.
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关键词
生物信息学
结肠癌
SDC4
表达调控机制
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职称材料
3D腹腔镜右半结肠癌CME术对术前CT成像血管变异患者的临床效果研究
3
作者
谢裕强
庄丹
林锡汉
《中华普外科手术学杂志(电子版)》
2022年第4期431-434,共4页
目的探讨3D腹腔镜右半结肠癌完整结肠系膜切除(CME)术对术前CT成像显示血管变异患者的临床效果。方法回顾性分析2018年12月至2020年7月行腹腔镜下右半结肠癌CME术治疗的95例术前CT成像显示血管变异患者临床资料,根据术式不同将患者分为3...
目的探讨3D腹腔镜右半结肠癌完整结肠系膜切除(CME)术对术前CT成像显示血管变异患者的临床效果。方法回顾性分析2018年12月至2020年7月行腹腔镜下右半结肠癌CME术治疗的95例术前CT成像显示血管变异患者临床资料,根据术式不同将患者分为3D组(n=44例)和2D组(n=51例),3D组:行3D腹腔镜右半结肠癌CME术;2D组:行2D腹腔镜右半结肠癌CME术。采用SPSS 22.0统计软件进行数据分析,围手术期各项指标和炎性指标等计量资料以(x±s)表示,采用独立样本t检验;不同时间计量资料采用重复测量方差分析;术后并发症等计数资料采用χ^(2)检验或Fisher精确检验。P<0.05为差异有统计学意义。结果3D组患者的手术时间、术中出血量、淋巴结清扫时间及住院时间均小于2D组(P<0.05);两组患者淋巴结清扫数目和术后并发症总发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。3D组患者术后3d、5d血清白细胞计数(WBC)均低于2D组,术后1d、3d、5d血清白细胞介素-6(IL-6),肿瘤坏死因子α(TNF-α),C反应蛋白(CRP)均低于2D组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论对于术前CT成像显示血管变异患者,3D腹腔镜右半结肠癌CME术可缩短手术时间,减少术中出血量,缩短住院时间且术后恢复更快,是一种安全可靠的术式。
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关键词
结肠肿瘤
腹腔镜
完整结肠系膜切除
血管变异
原文传递
题名
基于中心碳代谢和基因表达谱的结直肠癌相关分子研究
1
作者
袁炜嗣
陈银杏
曾虹
林芳
陈秀娜
机构
潮州市中心医院结直肠肛门外科
潮州市
中心医院
胸心
外科
出处
《中国科技期刊数据库 医药》
2023年第7期20-25,共6页
文摘
研究结直肠组织中心的碳代谢情况和基因表达情况对期及期患者的复发情况的影响。方法 采用贝叶斯相容聚类算法(Bayesian Complex Calculated Component Calculation, BCC),对结直肠癌基因表达谱及其相应的拷贝变异谱进行了综合,并对结直肠癌的分子亚型进行了研究。通过对结直肠癌病人的生存率、复发率等资料进行生存率分析,评估每种亚型在肿瘤发生发展中的预后价值,并应用基因系列富集软件对每种亚型中表达的生物信息进行分析。结果 从50名结直肠癌病人中选择了50名病人, BCC方法比单独使用基因表达谱分型更为精确,克雷默氏 V为0,通过对基因组数据、基因复制数谱数据和表达谱数据的分析, BCC方法可以较好地将结直肠癌的分型划分出来。本课题组前期研究发现,BCC-Ⅰ亚型患者预后最佳,BCC-Ⅱ亚型患者预后最差,BCC-(+)亚型患者预后中等。另外,将结直肠癌标本中的BCC-亚型及BCC-Ⅰ亚型采用 DNA损伤修复方法进行再分类后,可明显改善患者预后,且与 BCC分类结果有明显的相关性(Cmmer′ s V=0.39, P<0.001)。结论 BCC法是结直肠癌中综合多种组学信息进行癌症分类的一种行之有效的方法。
关键词
结肠肿瘤/病理学
代谢组
基因表达
聚类分析
分子生物学
预后
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
基于生物信息学数据库的结肠癌SDC4基因表达调控机制及作用研究
2
作者
唐梓涵
袁炜嗣
吴泽强
张粤烽
詹涵
王琛瑶
李恩民
陈滋凯
周飞
机构
韩山师范学院生命科学与食品工程学院
潮州市中心医院结直肠肛门外科
汕头大学医学院
出处
《韩山师范学院学报》
2023年第3期13-23,共11页
基金
广东省科技创新战略专项资金(大学生科技创新培育)项目(项目编号:PDJH2023B0342)
韩山师范学院教育教学改革项目(项目编号:粤韩师教[2021]148号)
+1 种基金
韩山师范学院科研项目(项目编号:XPY202106)
广东省教育厅科研项目(项目编号:2021ZDZX2066).
文摘
为了揭示SDC4基因在结肠癌中的功能及其表达调控机制.通过GEPIA2、Ualcan与Oncolnc等数据库研究分析SDC4基因在结肠癌的表达及其对患者总生存期的影响.通过Wanderer、UCSC、Cistrome DB、miRcode和miRDB等数据库研究分析结肠癌SDC4基因启动子区的甲基化、组蛋白修饰,调控其表达的转录因子和miRNAs.通过GEPIA2、Ualcan、HCMdb与DAVID等数据库研究分析在结肠癌中与SDC4基因共表达的基因及其生物学作用.基于以上生物信息学数据库,研究发现,在结肠癌中:SDC4基因的表达水平显著增高,并与肿瘤组织分期、淋巴结转移正相关,与患者预后负相关.SDC4基因启动子区的甲基化水平显著升高,转录激活性组蛋白修饰H3K4Me1与H3K27Ac显著富集.SP1、TEAD4、JUND、FOSL1、NR1H3、PPARG、SRF、TFAP4共8个转录因子可能调控SDC4基因的转录表达.与此同时hsa-miR-194和hsa-miR-124也可能调控SDC4基因表达.hsa-miR-194和hsa-miR-124的表达下调.SERINC3、DNTTIP1、ATP9A、CHMP4B、BCL2L1、STAU1、SYS1、YWHAB、OSBPL2、SLC35C2、TM9SF4与SDC4基因共表达.SDC4基因可能参与调控结肠癌细胞凋亡、细胞通讯、物质运输与定位等生物学过程.基于生物信息学数据库研究发现的结果,为进一步阐明SDC4基因在结肠癌中的功能及其表达调控机制提供重要的线索.
关键词
生物信息学
结肠癌
SDC4
表达调控机制
Keywords
bioinformatics
colon cancer
SDC4
expression regulation mechanism
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
3D腹腔镜右半结肠癌CME术对术前CT成像血管变异患者的临床效果研究
3
作者
谢裕强
庄丹
林锡汉
机构
潮州市中心医院结直肠肛门外科
出处
《中华普外科手术学杂志(电子版)》
2022年第4期431-434,共4页
基金
2020年度广东省医学科研基金项目(A2020361)
广东省潮州市卫生健康局科研项目(2020096)。
文摘
目的探讨3D腹腔镜右半结肠癌完整结肠系膜切除(CME)术对术前CT成像显示血管变异患者的临床效果。方法回顾性分析2018年12月至2020年7月行腹腔镜下右半结肠癌CME术治疗的95例术前CT成像显示血管变异患者临床资料,根据术式不同将患者分为3D组(n=44例)和2D组(n=51例),3D组:行3D腹腔镜右半结肠癌CME术;2D组:行2D腹腔镜右半结肠癌CME术。采用SPSS 22.0统计软件进行数据分析,围手术期各项指标和炎性指标等计量资料以(x±s)表示,采用独立样本t检验;不同时间计量资料采用重复测量方差分析;术后并发症等计数资料采用χ^(2)检验或Fisher精确检验。P<0.05为差异有统计学意义。结果3D组患者的手术时间、术中出血量、淋巴结清扫时间及住院时间均小于2D组(P<0.05);两组患者淋巴结清扫数目和术后并发症总发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。3D组患者术后3d、5d血清白细胞计数(WBC)均低于2D组,术后1d、3d、5d血清白细胞介素-6(IL-6),肿瘤坏死因子α(TNF-α),C反应蛋白(CRP)均低于2D组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论对于术前CT成像显示血管变异患者,3D腹腔镜右半结肠癌CME术可缩短手术时间,减少术中出血量,缩短住院时间且术后恢复更快,是一种安全可靠的术式。
关键词
结肠肿瘤
腹腔镜
完整结肠系膜切除
血管变异
Keywords
Colonic neoplasms
Laparoscopes
Complete mesocolic excision
Vascular variation
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于中心碳代谢和基因表达谱的结直肠癌相关分子研究
袁炜嗣
陈银杏
曾虹
林芳
陈秀娜
《中国科技期刊数据库 医药》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
基于生物信息学数据库的结肠癌SDC4基因表达调控机制及作用研究
唐梓涵
袁炜嗣
吴泽强
张粤烽
詹涵
王琛瑶
李恩民
陈滋凯
周飞
《韩山师范学院学报》
2023
0
下载PDF
职称材料
3
3D腹腔镜右半结肠癌CME术对术前CT成像血管变异患者的临床效果研究
谢裕强
庄丹
林锡汉
《中华普外科手术学杂志(电子版)》
2022
0
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