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短枝木麻黄种群苗期表型多样性评价
被引量:
9
1
作者
胡盼
仲崇禄
+4 位作者
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
KHONGSAK Pinyopusarerk
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1013-1020,共8页
以来源于大洋洲原生种源区、亚洲原生种源区、亚洲引种次生区以及非洲引种次生区4个区域的20个种源短枝木麻黄种子和当年生幼苗为材料,通过种子千粒重以及幼苗苗高、地径、一级侧枝粗度、一级侧枝长度等7个性状对短枝木麻黄表型多样性...
以来源于大洋洲原生种源区、亚洲原生种源区、亚洲引种次生区以及非洲引种次生区4个区域的20个种源短枝木麻黄种子和当年生幼苗为材料,通过种子千粒重以及幼苗苗高、地径、一级侧枝粗度、一级侧枝长度等7个性状对短枝木麻黄表型多样性进行了研究,以探讨种群苗期表型遗传差异,为短枝木麻黄早期遗传选择和遗传改良提供基本资料。结果表明:(1)短枝木麻黄种子千粒重在区域间和区域内种源间差异极显著,且千粒重具有显著的地理变异模式,随经度的增大而降低。(2)当年生幼苗苗高、地径在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中泰国干东港种源幼苗生长最好(苗高76.6cm,地径4.64mm),而种源汤加的幼苗生长最差(苗高28.3cm,地径2.58mm)。(3)当年生幼苗一级侧枝粗度、一级侧枝长度、二级侧枝长度、每小枝节数和齿叶数在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中齿叶数在区域间的变异系数最大(82.15%)。(4)通径分析表明,一级侧枝长度对苗高具有显著的正向影响作用,而一级侧枝粗度和二级侧枝长度对地径具有显著正向影响作用,它们可作为短枝木麻黄优良新品种筛选的参考因子。
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关键词
短枝木麻黄
苗期
种源
表型
变异
下载PDF
职称材料
木麻黄EST序列中SSR的分布特征及有效SSR标记的筛选
被引量:
1
2
作者
胡盼
仲崇禄
+6 位作者
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
韩强
Khongsak Pinyopusarerk
Didier Bogusz
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期116-122,共7页
从NCBI的EST数据库中获得的木麻黄EST序列共有34 752条,进行拼接后得到全长7 278.578 kb的非冗余序列(Unigene)12 062条,并从中检索得到分布于353条Unigene的367个SSR位点,SSR检出率为2.93%,平均分布距离为19.83 kb,包括39种重复基序类...
从NCBI的EST数据库中获得的木麻黄EST序列共有34 752条,进行拼接后得到全长7 278.578 kb的非冗余序列(Unigene)12 062条,并从中检索得到分布于353条Unigene的367个SSR位点,SSR检出率为2.93%,平均分布距离为19.83 kb,包括39种重复基序类型。其中,以二核苷酸和三核苷酸为主要类型,在总SSRs中所占比例分别为57.77%和34.60%;而二核苷酸重复基序中,AG/CT所占比例最高,为93.87%;在三核苷酸重复基序中AAG/CTT所占比例最高,为44.09%。对检索出的EST-SSR位点设计得到97对引物,其中32对为可有效扩增引物。Blastx分析发现77.3%的含SSR位点的EST序列与非冗余蛋白序列数据库中功能序列具有同源性,而功能已知的序列中葡萄来源的序列占有最大比例(10.4%)。GO功能分类发现,含有SSR位点的EST序列中有47.3%至少具有1个GO注释,归入细胞组分的序列最多,而其中细胞质和细胞核的功能项所占比例较大。
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关键词
木麻黄
EST
SSR
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职称材料
题名
短枝木麻黄种群苗期表型多样性评价
被引量:
9
1
作者
胡盼
仲崇禄
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
KHONGSAK Pinyopusarerk
机构
中国林业
科学
研究
院热带林业
研究
所
澳大利亚联邦科学与工业研究组织植物所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1013-1020,共8页
基金
"十二五"林业科技支撑计划专题(2012BAD01B0603)
广东省林业科技创新专项资金项目(2010KJCX009-01
+1 种基金
2011KJCX018-01)
福建省林木种苗科技攻关四期项目的子课题4(木麻黄改良代种子园营建技术研究)
文摘
以来源于大洋洲原生种源区、亚洲原生种源区、亚洲引种次生区以及非洲引种次生区4个区域的20个种源短枝木麻黄种子和当年生幼苗为材料,通过种子千粒重以及幼苗苗高、地径、一级侧枝粗度、一级侧枝长度等7个性状对短枝木麻黄表型多样性进行了研究,以探讨种群苗期表型遗传差异,为短枝木麻黄早期遗传选择和遗传改良提供基本资料。结果表明:(1)短枝木麻黄种子千粒重在区域间和区域内种源间差异极显著,且千粒重具有显著的地理变异模式,随经度的增大而降低。(2)当年生幼苗苗高、地径在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中泰国干东港种源幼苗生长最好(苗高76.6cm,地径4.64mm),而种源汤加的幼苗生长最差(苗高28.3cm,地径2.58mm)。(3)当年生幼苗一级侧枝粗度、一级侧枝长度、二级侧枝长度、每小枝节数和齿叶数在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中齿叶数在区域间的变异系数最大(82.15%)。(4)通径分析表明,一级侧枝长度对苗高具有显著的正向影响作用,而一级侧枝粗度和二级侧枝长度对地径具有显著正向影响作用,它们可作为短枝木麻黄优良新品种筛选的参考因子。
关键词
短枝木麻黄
苗期
种源
表型
变异
Keywords
Casuarina equisetifolia
seedling
provenance
phenotypic traits
variation
分类号
Q346.4 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
木麻黄EST序列中SSR的分布特征及有效SSR标记的筛选
被引量:
1
2
作者
胡盼
仲崇禄
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
韩强
Khongsak Pinyopusarerk
Didier Bogusz
机构
中国林业
科学
研究
院热带林业
研究
所
澳大利亚联邦科学与工业研究组织植物所
法国发展
研究
院(IRD)
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期116-122,共7页
基金
十二五林业科技支撑计划任务(2012BAD01B0603)
广东省林业科技创新专项资金项目(2014KJCX017)
+1 种基金
国家自然科学基金项目(31470634)
福建省林木种苗科技攻关四期项目的子课题4:木麻黄改良代种子园营建技术研究
文摘
从NCBI的EST数据库中获得的木麻黄EST序列共有34 752条,进行拼接后得到全长7 278.578 kb的非冗余序列(Unigene)12 062条,并从中检索得到分布于353条Unigene的367个SSR位点,SSR检出率为2.93%,平均分布距离为19.83 kb,包括39种重复基序类型。其中,以二核苷酸和三核苷酸为主要类型,在总SSRs中所占比例分别为57.77%和34.60%;而二核苷酸重复基序中,AG/CT所占比例最高,为93.87%;在三核苷酸重复基序中AAG/CTT所占比例最高,为44.09%。对检索出的EST-SSR位点设计得到97对引物,其中32对为可有效扩增引物。Blastx分析发现77.3%的含SSR位点的EST序列与非冗余蛋白序列数据库中功能序列具有同源性,而功能已知的序列中葡萄来源的序列占有最大比例(10.4%)。GO功能分类发现,含有SSR位点的EST序列中有47.3%至少具有1个GO注释,归入细胞组分的序列最多,而其中细胞质和细胞核的功能项所占比例较大。
关键词
木麻黄
EST
SSR
Keywords
Casuarinaceae
EST
SSR
分类号
S792.93 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
短枝木麻黄种群苗期表型多样性评价
胡盼
仲崇禄
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
KHONGSAK Pinyopusarerk
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
9
下载PDF
职称材料
2
木麻黄EST序列中SSR的分布特征及有效SSR标记的筛选
胡盼
仲崇禄
张勇
姜清彬
陈羽
陈珍
韩强
Khongsak Pinyopusarerk
Didier Bogusz
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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