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长牡蛎(Crassostrea gigas)野生与选育群体的微卫星遗传多样性分析
1
作者
李妍
姚健涛
+6 位作者
张恩烁
孙泽轩
孙国华
李彬
杨建敏
冯艳微
王卫军
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期462-470,共9页
为了评估长牡蛎(Crassostrea gigas)2个壳长性状(掌心形)快速生长选育群体(LY2-K4、LY2-K7)、1个壳高性状(速生型)快速生长选育群体(LY2-K11)和6个野生群体(QHD、LS、HD、ZH、WD、KTD)的遗传多样性和遗传结构,用21对多态性丰富的微卫星...
为了评估长牡蛎(Crassostrea gigas)2个壳长性状(掌心形)快速生长选育群体(LY2-K4、LY2-K7)、1个壳高性状(速生型)快速生长选育群体(LY2-K11)和6个野生群体(QHD、LS、HD、ZH、WD、KTD)的遗传多样性和遗传结构,用21对多态性丰富的微卫星引物对9个长牡蛎群体的269个个体进行了遗传分析。结果显示:21个微卫星位点共检测出了460个等位基因(Na),平均等位基因数为21.905;21个微卫星位点的多态信息含量(PIC)均大于0.5,具有高度遗传多态性;选育群体LY2-K11的遗传多样性最低(Na=13,I=2.128,He=0.831,PIC=0.825),野生群体KTD的遗传多样性最高(Na=29,I=3.112,He=0.941,PIC=0.938);189个群体位点组合有66%偏离哈代-温伯格平衡,表明这些群体存在一定程度的杂合子缺失;9个群体间的遗传分化指数(F_(st))为0.012~0.064,处于较低的遗传分化水平;AMOVA分析显示遗传变异主要来自于个体内;PCoA分析结果与UPGMA聚类树一致,LY2-K11群体单独聚为一类,QHD和HD群体聚为一类,其他6个群体聚为一类。综上所述,长牡蛎3个选育群体和6个野生群体遗传多样性均较高,遗传分化水平较低;选育群体LY2-K11多样性略有下降,选育过程中应保证亲本的数量及质量,防止因近交衰退造成遗传多样性降低,苗种抗逆性变差。该结果将为长牡蛎新品种的选育和野生种质资源的保护提供科学指导。
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关键词
长牡蛎(Crassostrea
gigas)
选育群体
野生群体
微卫星
遗传多样性
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题名
长牡蛎(Crassostrea gigas)野生与选育群体的微卫星遗传多样性分析
1
作者
李妍
姚健涛
张恩烁
孙泽轩
孙国华
李彬
杨建敏
冯艳微
王卫军
机构
鲁东大学农学院
牡蛎种质创制与高效养殖山东省工程研究中心
烟台市
崆峒岛实业
有限公司
烟台市海育海洋科技有限公司
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期462-470,共9页
基金
国家自然科学基金项目,31402298号
山东省农业良种工程,2020LZGC016号
江苏省“双创计划”企业创新类项目,[2019]1454号。
文摘
为了评估长牡蛎(Crassostrea gigas)2个壳长性状(掌心形)快速生长选育群体(LY2-K4、LY2-K7)、1个壳高性状(速生型)快速生长选育群体(LY2-K11)和6个野生群体(QHD、LS、HD、ZH、WD、KTD)的遗传多样性和遗传结构,用21对多态性丰富的微卫星引物对9个长牡蛎群体的269个个体进行了遗传分析。结果显示:21个微卫星位点共检测出了460个等位基因(Na),平均等位基因数为21.905;21个微卫星位点的多态信息含量(PIC)均大于0.5,具有高度遗传多态性;选育群体LY2-K11的遗传多样性最低(Na=13,I=2.128,He=0.831,PIC=0.825),野生群体KTD的遗传多样性最高(Na=29,I=3.112,He=0.941,PIC=0.938);189个群体位点组合有66%偏离哈代-温伯格平衡,表明这些群体存在一定程度的杂合子缺失;9个群体间的遗传分化指数(F_(st))为0.012~0.064,处于较低的遗传分化水平;AMOVA分析显示遗传变异主要来自于个体内;PCoA分析结果与UPGMA聚类树一致,LY2-K11群体单独聚为一类,QHD和HD群体聚为一类,其他6个群体聚为一类。综上所述,长牡蛎3个选育群体和6个野生群体遗传多样性均较高,遗传分化水平较低;选育群体LY2-K11多样性略有下降,选育过程中应保证亲本的数量及质量,防止因近交衰退造成遗传多样性降低,苗种抗逆性变差。该结果将为长牡蛎新品种的选育和野生种质资源的保护提供科学指导。
关键词
长牡蛎(Crassostrea
gigas)
选育群体
野生群体
微卫星
遗传多样性
Keywords
Crassostrea gigas
breeding populations
wild populations
microsatellite marker
genetic diversity
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
S968.3 [农业科学—水产养殖]
S931 [农业科学—渔业资源]
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作者
出处
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1
长牡蛎(Crassostrea gigas)野生与选育群体的微卫星遗传多样性分析
李妍
姚健涛
张恩烁
孙泽轩
孙国华
李彬
杨建敏
冯艳微
王卫军
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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