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基于Ser-SELEX技术的结肠癌血清适配体的筛选及其应用研究
1
作者
张广鑫
王佳
+5 位作者
石明
刘志伟
丁婷婷
岳金媛
李健
栗坤
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2220-2229,共10页
目的为了解决癌症早期诊断困难的问题,实现结肠癌的早期检测。方法采用Ser-SELEX技术筛选了结肠癌血清的特异性适配体。通过前期结肠癌血清正筛-正常人血清反筛步骤和后期结肠癌血清正筛-其他癌症血清反筛步骤循环的方式,经过16轮筛选流...
目的为了解决癌症早期诊断困难的问题,实现结肠癌的早期检测。方法采用Ser-SELEX技术筛选了结肠癌血清的特异性适配体。通过前期结肠癌血清正筛-正常人血清反筛步骤和后期结肠癌血清正筛-其他癌症血清反筛步骤循环的方式,经过16轮筛选流程,共选取4条候选适配体,并对其进行序列分析、二级结构和三级结构模拟、特异性分析等。结果候选适配体主要形成的结构是茎环和假结两种,q PCR法测试亲和力,Kd约为10 nmol/L,适配体与结肠癌患者血清特异性结合情况分析表明,候选适配体APT-2具有良好特异性,且此种方法检出率约为82.5%。结论适配体(APT-2)应用于结肠癌早期诊断具有良好的发展前景。
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关键词
结肠癌
核酸适配体
SELEX
磁珠
qPCR
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职称材料
题名
基于Ser-SELEX技术的结肠癌血清适配体的筛选及其应用研究
1
作者
张广鑫
王佳
石明
刘志伟
丁婷婷
岳金媛
李健
栗坤
机构
燕山大学
环境与化学工程学院
燕山大学河北省纳米生物技术重点实验室
燕山大学
亚稳材料制备
技术
与科学国家
重点
实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2220-2229,共10页
基金
河北省自然基金创新群体项目(C2022203003)资助。
文摘
目的为了解决癌症早期诊断困难的问题,实现结肠癌的早期检测。方法采用Ser-SELEX技术筛选了结肠癌血清的特异性适配体。通过前期结肠癌血清正筛-正常人血清反筛步骤和后期结肠癌血清正筛-其他癌症血清反筛步骤循环的方式,经过16轮筛选流程,共选取4条候选适配体,并对其进行序列分析、二级结构和三级结构模拟、特异性分析等。结果候选适配体主要形成的结构是茎环和假结两种,q PCR法测试亲和力,Kd约为10 nmol/L,适配体与结肠癌患者血清特异性结合情况分析表明,候选适配体APT-2具有良好特异性,且此种方法检出率约为82.5%。结论适配体(APT-2)应用于结肠癌早期诊断具有良好的发展前景。
关键词
结肠癌
核酸适配体
SELEX
磁珠
qPCR
Keywords
colon cancer
nucleic acid aptamer
SELEX
magnetic bead
qPCR
分类号
Q52 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Ser-SELEX技术的结肠癌血清适配体的筛选及其应用研究
张广鑫
王佳
石明
刘志伟
丁婷婷
岳金媛
李健
栗坤
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023
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